JCM Mail News No. 28

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RIKEN BioResource Center - Japan Collection of Microorganisms
            JCM Mail News (電子メール版) No. 28
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独立行政法人 理化学研究所 バイオリソースセンター 微生物材料開発室(JCM)
から公開している微生物等の最新情報をお届けします。

━━━━ 目 次 ━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━
● 今月のリソース紹介
● 新規公開微生物株(2008年7-9月公開)
● 新規公開微生物株由来ゲノムDNA
● 理研BRC国際シンポジウム「研究基盤用微生物を考える」開催のお知らせ
● 今月のFAQコーナー
● 微生物株の寄託ならびに公開の証明書の発行
● 大量依頼の場合に得られる提供手数料の特典システム導入のお知らせ
● JCM微生物株カタログ第10版(2007年)の発行について
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┃  今月のリソース紹介
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 ~11月よりReichenbach 教授より寄託された粘液細菌の提供を開始します~
 寄託された粘液細菌は、ドイツ バイオテクノロジー研究センター(GBF)の
Hans Reichenbach教授が有用な代謝産物のスクリーニングの過程で収集された
菌株のうち、特に分類学的研究が行われた菌株です。菌株の詳細な情報は
Bergey's Manual of Systematic Bacteriology 第2版 vol. 2の中に既存菌種お
よび新種の基準株として記載されています。
 このたび提供のための準備が完了しましたので、提供を開始いたします。
なお、提供開始予定の菌株は以下の通りです。提供に際しては提供承諾書が必要
となります。詳細についてはJCMオンラインカタログの各菌株のページにてご確
認下さい。

Byssovorax cruenta                  JCM 12614 (Type strain)
Chondromyces apiculatus             JCM 12615 (Proposed neotype strain)
Chondromyces crocatus               JCM 12616 (Proposed neotype strain)
Chondromyces lanuginosus            JCM 12617 (Proposed neotype strain)
Chondromyces pediculatus            JCM 12618 (Proposed neotype strain)
Chondromyces robustus               JCM 12619 (Type strain)
Corallococcus exiguus               JCM 12620 (Type strain)
Corallococcus macrosporus           JCM 12621 (Type strain)
Cystobacter armeniaca               JCM 12622 (Type strain)
Cystobacter badius                  JCM 12623 (Type strain)
Cystobacter ferrugineus             JCM 12624 (Proposed neotype strain)
"Cystobacter gracilis"              JCM 12625 (Proposed type strain)
Cystobacter miniatus                JCM 12626 (Type strain)
Cystobacter minus                   JCM 12627 (Proposed neotype strain)
Cystobacter velatus                 JCM 12628 (Type strain)
Cystobacter violaceus               JCM 12629 (Type strain)
Hyalangium minutum                  JCM 12630 (Type strain)
Jahnella thaxteri                   JCM 12631 (Type strain)
Kofleria flava                      JCM 12632 (Type strain)
Melittangium boletus                JCM 12633 (Proposed neotype strain)
Myxococcus stipitatus               JCM 12634 (Proposed neotype strain)
Nannocystis pusilla                 JCM 12635 (Type strain)
Polyangium fumosum                  JCM 12636 (Proposed neotype strain)
Polyangium sorediatum               JCM 12637 (Proposed neotype strain)
Polyangium spumosum                 JCM 12638 (Proposed neotype strain)
Pyxidicoccus fallax                 JCM 12639 (Type strain)
Stigmatella hybrida                 JCM 12640 (Type strain)
Sorangium cellulosum                JCM 12707 (Type strain)

押田祐美(菌株担当者・細菌)

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┃  新規公開微生物株(2008年7-9月公開)
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細菌
Acidimicrobium ferrooxidans                 JCM 15462 Type strain
Actinomadura bangladeshensis                JCM 13933 Type strain
Actinomadura chibensis                      JCM 14158 Type strain
Actinomadura chokoriensis                   JCM 13932 Type strain
Actinospica acidiphila                      JCM 14896 Type strain
Actinospica robiniae                        JCM 14908 Type strain
Aeromicrobium ginsengisoli                  JCM 14732 Type strain
Bifidobacterium longum subsp. infantis      JCM 11344
Bifidobacterium longum subsp. infantis      JCM 11345
Bordetella hinzii                           JCM 15550 Type strain
Bordetella hinzii                           JCM 15551
Brachybacterium zhongshanense               JCM 15471 Type strain
Cloacibacillus evryensis                    JCM 14828 Type strain
Clostridium amylolytica                     JCM 14823 Type strain
Colwellia polaris                           JCM 13952 Type strain
Fodinicola feengrottensis                   JCM 14718 Type strain
Glycomyces sambucus                         JCM 15472 Type strain
Haloplasma contractile                      JCM 14575 Type strain
Kribbella catacumbae                        JCM 14968 Type strain
Kribbella sancticallisti                    JCM 14969 Type strain
Lechevalieria xinjiangensis                 JCM 15473 Type strain
Leifsonia pindariensis                      JCM 15132 Type strain
Marinobacter psychrophilus                  JCM 14643 Type strain
Microlunatus ginsengisoli                   JCM 15306 Type strain
Micromonospora pattaloongensis              JCM 12833 Type strain
Micromonospora rifamycinica                 JCM 15474 Type strain
Mycobacterium avium                         JCM 15429
Mycobacterium avium                         JCM 15430
Mycobacterium avium                         JCM 15431
Mycobacterium avium                         JCM 15432
Mycobacterium farcinogenes                  JCM 15463 Type strain
Mycobacterium gilvum                        JCM 15464 Type strain
Mycobacterium haemophilum                   JCM 15465 Type strain
Nesterenkonia flava                         JCM 14814 Type strain
Nocardia altamirensis                       JCM 14670 Type strain
Nocardioides hwasunensis                    JCM 15307 Type strain
Nocardioides insulae                        JCM 15308 Type strain
Nocardioides panacihumi                     JCM 15309 Type strain
Nocardiopsis baichengensis                  JCM 15310 Type strain
Nocardiopsis chromatogenes                  JCM 15311 Type strain
Nocardiopsis gilva                          JCM 15312 Type strain
Nocardiopsis rosea                          JCM 15314 Type strain
Paenibacillus konsidensis                   JCM 14798 Type strain
Pedobacter agri                             JCM 15120 Type strain
Propionicicella superfundia                 JCM 14922 Type strain
Prosthecobacter fluviatilis                 JCM 14805 Type strain
Pseudomonas xiamenensis                     JCM 13530 Type strain
Pseudosporangium ferrugineum                JCM 14710 Type strain
Psychromonas aquimarina                     JCM 14784 Type strain
Psychromonas Japonica                       JCM 14783 Type strain
Psychromonas macrocephali                   JCM 14785 Type strain
Psychromonas ossibalaenae                   JCM 14786 Type strain
Rhodobacter maris                           JCM 14794 Type strain
Rhodobacter megalophilus                    JCM 14598 Type strain
Rhodococcus qingshengii                     JCM 15477 Type strain
Rhodovulum kholense                         JCM 14888 Type strain
Roseomonas stagni                           JCM 15034 Type strain
Shewanella basaltis                         JCM 14937 Type strain
Shimazuella kribbensis                      JCM 14729 Type strain
Sphingobacterium kitahiroshimense           JCM 14970 Type strain
Spirochaeta smaragdinae                     JCM 15392 Type strain
Sporosarcina antarctica                     JCM 14646 Type strain
Streptomyces albiaxialis                    JCM 15478 Type strain
Streptomyces emeiensis                      JCM 15479 Type strain
Streptomyces radiopugnans                   JCM 15480 Type strain
Streptomyces synnematoformans               JCM 15481 Type strain
Tranquillimonas alkanivorans                JCM 14836 Type strain
Vibrio areninigrae                          JCM 14949 Type strain

アーキア
Halobacterium piscisalsi                    JCM 14661 Type strain
Halorubrum kocurii                          JCM 14978 Type strain
Metanosaeta thermophila                     JCM 14653 Type strain

真菌
Lophiostoma arundinis                       JCM 13550
Lophiostoma arundinis                       JCM 13551
Lophiostoma macrostomum                     JCM 13544
Lophiostoma macrostomum                     JCM 13545
Lophiostoma macrostomum                     JCM 13546
Lophiostoma semiliberum                     JCM 13547
Lophiostoma semiliberum                     JCM 13548
Lophiostoma semiliberum                     JCM 13549
Massarina constricta                        JCM 13536
Massarina magniarundinacea                  JCM 13540 ex-holotype
Neoheteroceras macrosporum                  JCM 14566 ex-holotype
Penicillium purpurogenum                    JCM 23216
Pseudozyma graminicola                      JCM 12496 Type strain
Sporobolomyces fushanensis                  JCM 12422 Type strain

詳細は以下のサイトをご覧下さい。
http://www.jcm.riken.jp/JCM/catalogue_J.shtml

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┃  新規公開微生物株由来ゲノムDNA
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Mitsuokella multacida                       JCM 2054
Selenomonas ruminantium subsp. lactilytica  JCM 6582
Ruminococcus albus                          JCM 14654
Prevotella albensis                         JCM 12258

詳細は以下のサイトをご覧下さい。
https://www.brc.riken.jp/lab/dna/ja/JCMDNA.html

尚、2008年3月6日より微生物株由来ゲノムDNAの価格を改定させていただいて
おります。詳細は以下のサイトをご覧ください。
https://www.brc.riken.jp/inf/news/20080222.html#jcm

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┃  理研BRC国際シンポジウム「研究基盤用微生物を考える」開催のお知らせ
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 理研BRC国際シンポジウム「研究基盤用微生物リソースを考える」を以下の
要領で開催します。

  日時    2009年2月10日(火)
  場所    ハイアットリージェンシー東京(東京都新宿区新宿2-7-2)

 理研BRC-JCMは「健康と環境」に関する微生物リソースを中心とした研究基盤
用微生物リソースに関するリソース事業を行ってきています。2007年からは文
部科学省・ナショナルバイオリソースプロジェクト(NBRP)「一般微生物」に
おける中核機関に選定され、関係する機関と連携を取りながらBRC事業を推進し
ています。本シンポジウムでは、人類にとって重要課題である「健康と環境」
に関わる微生物リソースの役割と今後の可能性(第1部)、アジア地域において
拠点となるBRC機関の活動とその連携(第2部)について討論し、また当室室長
である辨野がライフワークとして取り組んできた「嫌気性菌」の研究とBRC事業
を紹介いたします。どうぞ皆様の奮ってのご参加をお待ちしております。
 シンポジウムの詳細は決定次第ホームページでご案内いたします。

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┃  今月のFAQコーナー
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 Q.1  オンラインカタログで株の詳しい情報を調べたいのですが。
 A.1  JCMオンラインカタログは2ページになっています。1ページ目は、微生
物の学名、JCM番号、国内外の他の保存機関番号、培養条件等です。JCM番号を
クリックすると2ページ目に移ります。2ページ目はその株の分離源や分類学的
なデータが記載されています。[ ]の中の数字はJCMの文献番号で、ここを
クリックすると、そのデータが引用されている論文情報が表示されます。ぜひ
オンラインカタログhttp://www.jcm.riken.jp/JCM/catalogue_J.shtmlをご
利用ください。

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┃  微生物株の寄託ならびに公開の証明書の発行
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 International Journal of Systematic and Evolutionary Microbiology
(IJSEM) 誌に新種等を発表される場合、あるいは本誌の Validation List に新
種等の掲載を依頼する場合、当該種等の基準株が2カ国以上のカルチャーコレ
クションに寄託され、一般に公開されることの証明が求められます。JCMではこ
の IJSEM 誌の方針に沿って、保存微生物株の寄託ならびに公開の証明書を発行
しています。(詳細はhttp://www.jcm.riken.jp/JCM/Depositing_J.shtmlをご
覧下さい。)

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┃  大量依頼の場合に得られる提供手数料の特典システム導入のお知らせ
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 JCMでは、一度に20株以上を提供する場合、申込数に応じて請求代金がディス
カウントされる特典システムを導入しました。20-49株の場合は約20%、50株以
上の場合は約25%ディスカウントの価格となっています。生物遺伝資源提供同意
書に関しては従来どおりです。
 本システムには専用の微生物材料提供依頼書(書式M-4L)がありますので、以
下からダウンロードしてください。
http://www.jcm.riken.jp/JCM/Ordering_J.shtml

価格に関する詳細は以下をご覧ください。
https://www.brc.riken.jp/inf/distribute/jcmdiscount.shtml

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┃  JCM微生物株カタログ第10版 (2007年) の発行について
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 RIKEN BRC では上記カタログを発行しております。収載株数は10,731株 [細
菌(放線菌を含む)6,438株、アーキア(古細菌)274株、真菌(糸状菌および
酵母)4,000株、その他 (Prototheca属) 19株]で、価格は 5,250 円 (本体 
5,000 円 + 税) です。

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※ メールでの情報提供受信を中止されたい場合は、微生物材料開発室(inquiry@jcm.riken.jp)
  まで「メールニュース不要」の旨をご連絡下さい。
※ 当メールへのご質問などは、微生物材料開発室(inquiry@jcm.riken.jp)
  までお送り下さい。
※ 当メールニュース受信者各位機関のサーバーメインテナンス等によりメール
  ニュースをお届けできない場合でも、メールニュースの再発行は行いません。
  発行済みのメールニュースは当開発室のwebサイトで公開しておりますので
  そちらをご覧下さい。
  http://www.jcm.riken.jp/JCM/mailnews.shtml
※ 本メールに記載された内容は予告することなく変更することがあります。
※ 本メールに掲載された記事を許可なく複製・転載することを禁止します。
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発行
独立行政法人 理化学研究所 バイオリソースセンター
微生物材料開発室 (JCM)
inquiry@jcm.riken.jp
http://www.jcm.riken.jp/
2008年10月31日
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