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RIKEN BioResource Center - Japan Collection of Microorganisms
JCM Mail News (電子メール版) No. 27
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独立行政法人 理化学研究所 バイオリソースセンター 微生物材料開発室(JCM)
から公開している微生物等の最新情報をお届けします。
━━━━ 目 次 ━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━
● 今月のリソース紹介
● 新規公開微生物株(2008年6月公開)
● 新規公開微生物株由来ゲノムDNA
● JCM微生物株カタログ第10版(2007年)の発行について
● 微生物株の寄託ならびに公開の証明書の発行
● 大量依頼の場合に得られる提供手数料の特典システム導入のお知らせ
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┃ 今月のリソース紹介
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理研BRC微生物材料開発室(JCM)では、2006年11月より理研BRC遺伝子材料開
発室(DNA Bank)の協力の下、JCMで保有している微生物株由来のゲノムDNAの
提供事業を開始いたしました。2008年8月時点で全31株の微生物株由来ゲノムが
ラインナップされており、このうち5株のアーキアおよび好熱性細菌のゲノムDNA
が公開されています。この中でCaldivirga maquilingensis JCM 10307は
当室室員によって開発された微生物リソースで、既にゲノムシークエンスが公表
されており、硫酸還元に関わる遺伝子を有していることから硫酸還元代謝の起源
を推定する上で貴重なリソースであることが判明しています。今後もこうしたア
ーキアや極限環境細菌のゲノムDNAリソースを徐々に増やしていく予定ですので、
ご関心のある方はどうぞご利用下さい。
現在ゲノムDNAを提供しているアーキアおよび極限環境細菌
JCM 9628 Archaeoglobus fulgidus
JCM 9974 Pyrococcus horikoshii
JCM 10044 Methanothermobacter thermautotrophicus
JCM 10307 Caldivirga maquilingensis
JCM 10941 Thermus thermophilus
都筑智子(菌株担当者・アーキア)
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┃ 新規公開微生物株(2008年6月公開)
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細菌
Agromyces terreus JCM 14581 Type strain
Alicyclobacillus sp. JCM 21416
Chromobacterium haemolyticum JCM 14163 Type strain
Corynebacterium ureicelerivorans JCM 15295 Type strain
Dyella japonica JCM 21528
Dyella japonica JCM 21529
Micromonospora krabiensis JCM 12868
Micromonospora krabiensis JCM 12869 Type strain
Rhodobacter ovatus JCM 14779 Type strain
Ruminococcus gauvreauii JCM 14987 Type strain
Unidentified bacterium JCM 9634
Unidentified bacterium JCM 9635
Unidentified bacterium JCM 9636
Unidentified bacterium JCM 9637
Unidentified bacterium JCM 9638
真菌
Aspergillus usamii JCM 23176
Basipetospora chlamydosporis JCM 23157
Basipetospora chlamydosporis JCM 23158 ex-type
Cephaliophora irregularis JCM 23172
Cephaliophora tropica JCM 23173
Monascus pilosus JCM 23155 ex-type
Monascus ruber JCM 23156
Mortierella ramanniana var. angulispora JCM 23177
Paecilomyces aerugineus JCM 23169 ex-type
Paecilomyces farinosus JCM 23150
Paecilomyces isarioides JCM 23151 ex-type
Paecilomyces javanicus JCM 23170 ex-lectotype
Paecilomyces viridis JCM 23171 ex-type
Sagenoma viride JCM 23168 ex-isotype
Sagenomella alba JCM 23159 ex-holotype
Sagenomella bohemica JCM 23160 ex-type
Sagenomella diversispora JCM 23161
Sagenomella diversispora JCM 23162
Sagenomella griseoviridis JCM 23163
Sagenomella griseoviridis JCM 23174
Sagenomella humicola JCM 23164
Sagenomella oligospora JCM 23152
Sagenomella oligospora JCM 23154
Sagenomella oligospora JCM 23153 ex-type
Sagenomella sclerotialis JCM 23165 ex-type
Sagenomella striatispora JCM 23166 ex-type
Sagenomella verticillata JCM 23167 ex-type
Trichoderma aureoviride JCM 23184
Trichoderma polysporum JCM 23182
Trichoderma pseudokoningii JCM 23183
Trichoderma virens JCM 23181
Trichothecium roseum JCM 23185
詳細は以下のサイトをご覧下さい。
http://www.jcm.riken.jp/JCM/catalogue_J.shtml
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┃ 新規公開微生物株由来ゲノムDNA
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Mitsuokella multacida JCM 2054
Selenomonas ruminantium subsp. lactilytica JCM 6582
Ruminococcus albus JCM 14654
Prevotella albensis JCM 12258
詳細は以下のサイトをご覧下さい。
https://www.brc.riken.jp/lab/dna/ja/JCMDNA.html
尚、2008年3月6日より微生物株由来ゲノムDNAの価格を改定させていただいて
おります。詳細は以下のサイトをご覧ください。
https://www.brc.riken.jp/inf/news/20080222.html#jcm
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┃ JCM微生物株カタログ第10版 (2007年) の発行について
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RIKEN BRC では上記カタログを発行しております。収載株数は10,731株 [細
菌(放線菌を含む)6,438株、アーキア(古細菌)274株、真菌(糸状菌および
酵母)4,000株、その他 (Prototheca属) 19株]で、価格は 5,250 円 (本体
5,000 円 + 税) です。
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┃ 微生物株の寄託ならびに公開の証明書の発行
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International Journal of Systematic and Evolutionary Microbiology
(IJSEM) 誌に新種等を発表される場合、あるいは本誌の Validation List に新
種等の掲載を依頼する場合、当該種等の基準株が2カ国以上のカルチャーコレ
クションに寄託され、一般に公開されることの証明が求められます。JCMではこ
の IJSEM 誌の方針に沿って、保存微生物株の寄託ならびに公開の証明書を発行
しています。(詳細はhttp://www.jcm.riken.jp/JCM/Depositing_J.shtmlをご
覧下さい。)
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┃ 大量依頼の場合に得られる提供手数料の特典システム導入のお知らせ
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JCMでは、一度に20株以上を提供する場合、申込数に応じて請求代金がディス
カウントされる特典システムを導入しました。20-49株の場合は約20%、50株以
上の場合は約25%ディスカウントの価格となっています。生物遺伝資源提供同意
書に関しては従来どおりです。
本システムには専用の微生物材料提供依頼書(書式M-4L)がありますので、以
下からダウンロードしてください。
http://www.jcm.riken.jp/JCM/Ordering_J.shtml
価格に関する詳細は以下をご覧ください。
https://www.brc.riken.jp/inf/distribute/jcmdiscount.shtml
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※ メールでの情報提供受信を中止されたい場合は、微生物材料開発室(inquiry@jcm.riken.jp)
まで「メールニュース不要」の旨をご連絡下さい。
※ 当メールへのご質問などは、微生物材料開発室(inquiry@jcm.riken.jp)までお送り下さい。
※ 当メールニュース受信者各位機関のサーバーメインテナンス等によりメール
ニュースをお届けできない場合でも、メールニュースの再発行は行いません。
発行済みのメールニュースは当開発室のwebサイトで公開しておりますので
そちらをご覧下さい。
http://www.jcm.riken.jp/JCM/mailnews.shtml
※ 本メールに記載された内容は予告することなく変更することがあります。
※ 本メールに掲載された記事を許可なく複製・転載することを禁止します。
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発行
独立行政法人 理化学研究所 バイオリソースセンター
微生物材料開発室 (JCM)
inquiry@jcm.riken.jp
http://www.jcm.riken.jp/
2008年8月28日
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