JCM Mail News No. 27

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RIKEN BioResource Center - Japan Collection of Microorganisms
            JCM Mail News (電子メール版) No. 27
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独立行政法人 理化学研究所 バイオリソースセンター 微生物材料開発室(JCM)
から公開している微生物等の最新情報をお届けします。

━━━━ 目 次 ━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━
● 今月のリソース紹介
● 新規公開微生物株(2008年6月公開)
● 新規公開微生物株由来ゲノムDNA
● JCM微生物株カタログ第10版(2007年)の発行について
● 微生物株の寄託ならびに公開の証明書の発行
● 大量依頼の場合に得られる提供手数料の特典システム導入のお知らせ
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┃  今月のリソース紹介
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 理研BRC微生物材料開発室(JCM)では、2006年11月より理研BRC遺伝子材料開
発室(DNA Bank)の協力の下、JCMで保有している微生物株由来のゲノムDNAの
提供事業を開始いたしました。2008年8月時点で全31株の微生物株由来ゲノムが
ラインナップされており、このうち5株のアーキアおよび好熱性細菌のゲノムDNA
が公開されています。この中でCaldivirga maquilingensis JCM 10307は
当室室員によって開発された微生物リソースで、既にゲノムシークエンスが公表
されており、硫酸還元に関わる遺伝子を有していることから硫酸還元代謝の起源
を推定する上で貴重なリソースであることが判明しています。今後もこうしたア
ーキアや極限環境細菌のゲノムDNAリソースを徐々に増やしていく予定ですので、
ご関心のある方はどうぞご利用下さい。

現在ゲノムDNAを提供しているアーキアおよび極限環境細菌
JCM 9628      Archaeoglobus fulgidus
JCM 9974      Pyrococcus horikoshii
JCM 10044     Methanothermobacter thermautotrophicus
JCM 10307     Caldivirga maquilingensis
JCM 10941     Thermus thermophilus

都筑智子(菌株担当者・アーキア)

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┃  新規公開微生物株(2008年6月公開)
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細菌
Agromyces terreus                            JCM 14581   Type strain
Alicyclobacillus sp.                         JCM 21416
Chromobacterium haemolyticum                 JCM 14163   Type strain
Corynebacterium ureicelerivorans             JCM 15295   Type strain
Dyella japonica                              JCM 21528
Dyella japonica                              JCM 21529
Micromonospora krabiensis                    JCM 12868
Micromonospora krabiensis                    JCM 12869   Type strain
Rhodobacter ovatus                           JCM 14779   Type strain
Ruminococcus gauvreauii                      JCM 14987   Type strain
Unidentified bacterium                       JCM 9634
Unidentified bacterium                       JCM 9635
Unidentified bacterium                       JCM 9636
Unidentified bacterium                       JCM 9637
Unidentified bacterium                       JCM 9638

真菌
Aspergillus usamii                           JCM 23176
Basipetospora chlamydosporis                 JCM 23157
Basipetospora chlamydosporis                 JCM 23158   ex-type
Cephaliophora irregularis                    JCM 23172
Cephaliophora tropica                        JCM 23173
Monascus pilosus                             JCM 23155   ex-type
Monascus ruber                               JCM 23156
Mortierella ramanniana var. angulispora      JCM 23177
Paecilomyces aerugineus                      JCM 23169   ex-type
Paecilomyces farinosus                       JCM 23150
Paecilomyces isarioides                      JCM 23151   ex-type
Paecilomyces javanicus                       JCM 23170   ex-lectotype
Paecilomyces viridis                         JCM 23171   ex-type
Sagenoma viride                              JCM 23168   ex-isotype
Sagenomella alba                             JCM 23159   ex-holotype
Sagenomella bohemica                         JCM 23160   ex-type
Sagenomella diversispora                     JCM 23161
Sagenomella diversispora                     JCM 23162
Sagenomella griseoviridis                    JCM 23163
Sagenomella griseoviridis                    JCM 23174
Sagenomella humicola                         JCM 23164
Sagenomella oligospora                       JCM 23152
Sagenomella oligospora                       JCM 23154
Sagenomella oligospora                       JCM 23153   ex-type
Sagenomella sclerotialis                     JCM 23165   ex-type
Sagenomella striatispora                     JCM 23166   ex-type
Sagenomella verticillata                     JCM 23167   ex-type
Trichoderma aureoviride                      JCM 23184
Trichoderma polysporum                       JCM 23182
Trichoderma pseudokoningii                   JCM 23183
Trichoderma virens                           JCM 23181
Trichothecium roseum                         JCM 23185

詳細は以下のサイトをご覧下さい。
http://www.jcm.riken.jp/JCM/catalogue_J.shtml

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┃  新規公開微生物株由来ゲノムDNA
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Mitsuokella multacida                        JCM 2054
Selenomonas ruminantium subsp. lactilytica   JCM 6582
Ruminococcus albus                           JCM 14654
Prevotella albensis                          JCM 12258

詳細は以下のサイトをご覧下さい。
https://www.brc.riken.jp/lab/dna/ja/JCMDNA.html

尚、2008年3月6日より微生物株由来ゲノムDNAの価格を改定させていただいて
おります。詳細は以下のサイトをご覧ください。
https://www.brc.riken.jp/inf/news/20080222.html#jcm

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┃  JCM微生物株カタログ第10版 (2007年) の発行について
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 RIKEN BRC では上記カタログを発行しております。収載株数は10,731株 [細
菌(放線菌を含む)6,438株、アーキア(古細菌)274株、真菌(糸状菌および
酵母)4,000株、その他 (Prototheca属) 19株]で、価格は 5,250 円 (本体 
5,000 円 + 税) です。

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┃  微生物株の寄託ならびに公開の証明書の発行
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 International Journal of Systematic and Evolutionary Microbiology
(IJSEM) 誌に新種等を発表される場合、あるいは本誌の Validation List に新
種等の掲載を依頼する場合、当該種等の基準株が2カ国以上のカルチャーコレ
クションに寄託され、一般に公開されることの証明が求められます。JCMではこ
の IJSEM 誌の方針に沿って、保存微生物株の寄託ならびに公開の証明書を発行
しています。(詳細はhttp://www.jcm.riken.jp/JCM/Depositing_J.shtmlをご
覧下さい。)

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┃  大量依頼の場合に得られる提供手数料の特典システム導入のお知らせ
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 JCMでは、一度に20株以上を提供する場合、申込数に応じて請求代金がディス
カウントされる特典システムを導入しました。20-49株の場合は約20%、50株以
上の場合は約25%ディスカウントの価格となっています。生物遺伝資源提供同意
書に関しては従来どおりです。
 本システムには専用の微生物材料提供依頼書(書式M-4L)がありますので、以
下からダウンロードしてください。
http://www.jcm.riken.jp/JCM/Ordering_J.shtml
価格に関する詳細は以下をご覧ください。
https://www.brc.riken.jp/inf/distribute/jcmdiscount.shtml

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※ メールでの情報提供受信を中止されたい場合は、微生物材料開発室(inquiry@jcm.riken.jp)
  まで「メールニュース不要」の旨をご連絡下さい。
※ 当メールへのご質問などは、微生物材料開発室(inquiry@jcm.riken.jp)までお送り下さい。
※ 当メールニュース受信者各位機関のサーバーメインテナンス等によりメール
  ニュースをお届けできない場合でも、メールニュースの再発行は行いません。
  発行済みのメールニュースは当開発室のwebサイトで公開しておりますので
  そちらをご覧下さい。
  http://www.jcm.riken.jp/JCM/mailnews.shtml
※ 本メールに記載された内容は予告することなく変更することがあります。
※ 本メールに掲載された記事を許可なく複製・転載することを禁止します。
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発行
独立行政法人 理化学研究所 バイオリソースセンター
微生物材料開発室 (JCM)
inquiry@jcm.riken.jp
http://www.jcm.riken.jp/
2008年8月28日
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