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RIKEN BioResource Center - Japan Collection of Microorganisms
JCM Mail News （電子メール版） No. 26
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独立行政法人 理化学研究所 バイオリソースセンター 微生物材料開発室（JCM）
から公開している微生物等の最新情報をお届けします。
━━━━ 目 次 ━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━
● 今月のリソース紹介
● 新規公開微生物株（2008年5月公開）
● JCM微生物株カタログ第10版（2007年）の発行について
● 微生物株の寄託ならびに公開の証明書の発行
● 大量依頼の場合に得られる提供手数料の特典システム導入のお知らせ
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┃ 今月のリソース紹介
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2005年よりJCMでは登録される細菌について16S rRNA遺伝子配列による菌株の
確認を行っておりますが、過去に登録された菌株については必要な際に確認を
している状況です。Lactobacillus 属には公開株339株のうち参考株が247株存
在し、そのうち1980年代に登録されたものは145株にのぼります。
Lactobacillus 属の保有菌株339株について16S rRNA遺伝子配列を用いて学名の
確認を行った結果、登録時の同定とは異なる菌株として22株が明らかとなり
Lactobacillus sp.に学名変更したのでお知らせします。今回決定した塩基配
列についてはオンラインカタログに全て公開しており、菌株情報の
[Quality control by DNA sequences]の項目に登録番号を記載しております。
Lactobacillus sp.として学名変更した菌株については［More information］
にどの菌種と近縁であるかという情報を掲載しておりますので、菌株選択の際
に見ていただけると利用しやすいかと思います。
[今回Lactobacillus sp. に学名変更した22株]
旧名 JCM番号 BLAST検索
L. amylovorus JCM 2010 L. johnsonii (99.7%)
"L. brevis subsp. gravesensis" JCM 1102 L. hilgardi (100%)
"L. brevis subsp. otakiensis" JCM 1183 L. hilgardi (100%)
L. delbrueckii subsp. bulgaricus JCM 11039 L. helveticus (100%)
L. delbrueckii subsp. delbrueckii JCM 1013 L. amylolyticus (99.7%)
L. fermentum JCM 2761 L. farraginis (100%)
L. fermentum JCM 2768 L. farraginis (100%)
L. fermentum JCM 5867 L. reuteri (100%)
L. fermentum JCM 5868 L. reuteri (100%)
L. fermentum JCM 5869 L. reuteri (100%)
L. fructivorans JCM 7525 L. acetotolerans (98.6%)
L. fructivorans JCM 7527 L. acetotolerans (98.6%)
L. helveticus JCM 1552 L. delbrueckii (99.8%)
L. homohiochii JCM 7524 L. acetotolerans (98.6%)
L. homohiochii JCM 9717 L. acetotolerans (98.6%)
L. homohiochii JCM 9721 L. paracasei (100%)
L. mali JCM 2774 L. nagelii (98.1%)
L. paracasei subsp. paracasei JCM 2770 L. harbinensis (99.7%)
L. reuteri JCM 1088 L. fermentum (100%)
L. reuteri JCM 2762 L. farraginis (100%)
L. reuteri JCM 2763 L. farraginis (100%)
L. reuteri JCM 2764 L. farraginis(99.3%)
北原 真樹（協力研究員）
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┃ 新規公開微生物株（2008年5月公開）
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細菌
Adlercreutzia equolifaciens JCM 14793 Type strain
Alkalibacterium indicireducens JCM 14232 Type strain
Asaccharobacter celatus JCM 14811 Type strain
Aurantimonas frigidaquae JCM 14755 Type strain
Cedecea neteri JCM 24180
Cedecea neteri JCM 24181
Cronobacter sakazakii JCM 24133
Cronobacter sakazakii JCM 24135
Cronobacter sakazakii JCM 24136
Dasania marina JCM 13441 Type strain
Deinococcus misasensis JCM 14369 Type strain
Deinococcus roseus JCM 14370 Type strain
Desulfomicrobium aestuarii JCM 14714 Type strain
Desulfomicrobium salsuginis JCM 14713 Type strain
Enterobacter aerogenes JCM 24140
Enterobacter aerogenes JCM 24141
Enterobacter aerogenes JCM 24142
Enterobacter aerogenes JCM 24143
Enterobacter aerogenes JCM 24145
Enterobacter amnigenus JCM 24158
Enterobacter amnigenus JCM 24159
Enterobacter amnigenus JCM 24161
Enterobacter amnigenus JCM 24162
Enterobacter amnigenus JCM 24163
Enterobacter amnigenus JCM 24164
Enterobacter amnigenus JCM 24165
Enterobacter gergoviae JCM 24137
Enterobacter gergoviae JCM 24138
Enterobacter gergoviae JCM 24139
Flagellimonas eckloniae JCM 13831 Type strain
Hafnia alvei JCM 24184
Hafnia alvei JCM 24185
Hafnia alvei JCM 24186
Hafnia alvei JCM 24187
Hafnia alvei JCM 24188
Hafnia alvei JCM 24189
Hafnia alvei JCM 24190
Hafnia alvei JCM 24191
Hafnia alvei JCM 24192
Halomonas caseinilytica JCM 14802 Type strain
Kluyvera intermedia JCM 24166
Kluyvera intermedia JCM 24167
Kluyvera intermedia JCM 24168
Kluyvera intermedia JCM 24170
Microbulbifer agarilyticus JCM 14708 Type strain
Microbulbifer thermotolerans JCM 14709 Type strain
Moritella dasanensis JCM 14759 Type strain
Neptunomonas japonica JCM 14595 Type strain
Odoribacter splanchnicus JCM 15291 Type strain
Paenibacillus ginsengihumi JCM 14928 Type strain
Prevotella oulorum JCM 14966 Type strain
Providencia alcalifaciens JCM 24289
Providencia rettgeri JCM 24282
Providencia rettgeri JCM 24284
Providencia rettgeri JCM 24285
Providencia rettgeri JCM 24286
Providencia rettgeri JCM 24287
Providencia rettgeri JCM 24288
Ruminococcus schinkii JCM 14657 Type strain
Saccharopolyspora shandongensis JCM 14614 Type strain
Serratia marcescens subsp. marcescens JCM 24193
Serratia marcescens subsp. marcescens JCM 24194
Serratia marcescens subsp. marcescens JCM 24195
Serratia marcescens subsp. marcescens JCM 24197
Serratia marcescens subsp. marcescens JCM 24199
Serratia marcescens subsp. marcescens JCM 24200
Serratia marcescens subsp. marcescens JCM 24201
Serratia rubidaea JCM 24202
Serratia rubidaea JCM 24204
Serratia rubidaea JCM 24205
Serratia rubidaea JCM 24208
Serratia rubidaea JCM 24209
Syntrophomonas erecta subsp. sporosyntropha JCM 13344 Type strain
Syntrophomonas wolfei subsp. methylbutyratica JCM 14075 Type strain
Syntrophorhabdus aromaticivorans JCM 13376 Type strain
Thermodesulfovibrio hydrogeniphilus JCM 13991 Type strain
Tindallia texcoconensis JCM 13990 Type strain
Treponema isoptericolens JCM 13955 Type strain
アーキア
Halosarcina pallida JCM 14848 Type strain
詳細は以下のサイトをご覧下さい。
http://www.jcm.riken.jp/JCM/catalogue_J.shtml
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┃ JCM微生物株カタログ第10版 (2007年) の発行について
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RIKEN BRC では上記カタログを発行しております。収載株数は10,731株 [細
菌（放線菌を含む）6,438株、アーキア（古細菌）274株、真菌（糸状菌および
酵母）4,000株、その他 (Prototheca属) 19株]で、価格は 5,250 円 (本体
5,000 円 + 税) です。
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┃ 微生物株の寄託ならびに公開の証明書の発行
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International Journal of Systematic and Evolutionary Microbiology
(IJSEM) 誌に新種等を発表される場合、あるいは本誌の Validation List に新
種等の掲載を依頼する場合、当該種等の基準株が２カ国以上のカルチャーコレ
クションに寄託され、一般に公開されることの証明が求められます。JCMではこ
の IJSEM 誌の方針に沿って、保存微生物株の寄託ならびに公開の証明書を発行
しています。（詳細はhttp://www.jcm.riken.jp/JCM/Depositing_J.shtmlをご
覧下さい。）
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┃ 大量依頼の場合に得られる提供手数料の特典システム導入のお知らせ
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JCMでは、一度に20株以上を提供する場合、申込数に応じて請求代金がディス
カウントされる特典システムを導入しました。20-49株の場合は約20％、50株以
上の場合は約25％ディスカウントの価格となっています。生物遺伝資源提供同意
書に関しては従来どおりです。
本システムには専用の微生物材料提供依頼書（書式M-4L）がありますので、以
下からダウンロードしてください。
http://www.jcm.riken.jp/JCM/Ordering_J.shtml
価格に関する詳細は以下をご覧ください。
https://www.brc.riken.jp/inf/distribute/jcmdiscount.shtml
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※ メールでの情報提供受信を中止されたい場合は、微生物材料開発室(inquiry@jcm.riken.jp)
まで「メールニュース不要」の旨をご連絡下さい。
※ 当メールへのご質問などは、微生物材料開発室(inquiry@jcm.riken.jp)までお送り下さい。
※ 当メールニュース受信者各位機関のサーバーメインテナンス等によりメール
ニュースをお届けできない場合でも、メールニュースの再発行は行いません。
発行済みのメールニュースは当開発室のwebサイトで公開しておりますので
そちらをご覧下さい。
http://www.jcm.riken.jp/JCM/mailnews.shtml
※ 本メールに記載された内容は予告することなく変更することがあります。
※ 本メールに掲載された記事を許可なく複製・転載することを禁止します。
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発行
独立行政法人 理化学研究所 バイオリソースセンター
微生物材料開発室 (JCM)
inquiry@jcm.riken.jp
http://www.jcm.riken.jp/
2008年7月15日
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