********************************************************************** RIKEN BioResource Research Center - Japan Collection of Microorganisms JCM Mail News (電子メール版) No. 137 ********************************************************************** 理化学研究所 バイオリソース研究センター 微生物材料開発室(JCM) が公開している微生物等の最新情報をお届けします。 ━━━━ 目 次 ━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━ ● リソース紹介「高次分類群の正名承認に寄与した原核生物株」 ● JCM株一覧表への分離源カテゴリーの追加 ● 8/26 TRIP Summer Event 2025 のお知らせ ● BRC公式Bluesky(SNS)を開設しました ● 新規公開微生物株(2025年5月-6月公開) ━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━ ┏━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━ ┃ リソース紹介「高次分類群の正名承認に寄与した原核生物株」 ┗━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━ 現在、国際原核生物命名規約では、高次分類群として「門 (phylum)」、 「界 (kingdom)」、さらには「ドメイン (domain)」までが正式に採用されて います。ドメインは細菌 (Bacteria) とアーキア (Archaea)の2つ、その一つ 下位の界においては、細菌ドメインで4つ、アーキアドメインで4つがそれぞ れ正式に承認されています。アーキアドメインの4界のうちの1つが Nanobdellati界であり、この分類名の由来となったNanobdella aerobiophila MJ1T (=JCM 33616T) を以前当室の研究グループが報告しました。2024年には、 Promethearchaeum syntrophicum MK-D1T (=JCM 39240T)の属名に基づいて、 Promethearchaeati界が承認されました。一方で、細菌ドメインにおいては、 CPR(Candidate phyla radiation)群と呼ばれていたMinisyncoccota門や、 'Marine Group A'もしくはSAR406群と呼ばれていたFidelibacterota門など、 新門の提唱および承認が相次いでいます。それぞれの門名は、 Minisyncoccus archaeiphilus PMX.108T (=JCM 39522T)およびFidelibacter multiformis IA91T (=JCM 39387T)の属名に基づいて名付けられました。上記 の種はそれぞれ、特定の宿主の細胞外に付着する絶対共生性であったり、触手 のような突起構造を形成したり、他者の特定細胞成分を利用しないと生育でき なかったりと、いずれも培養しないと明らかにできなかった特徴を有しており、 分類学としてだけでなく、生理・生態・進化を含めて微生物学全般において重 要な知見を与えてきました。現時点では、上記のMK-D1T株とPMX.108T株は、数 ある国際カルチャーコレクションの中でもJCMからのみ公開されています。JCM では、上記の株の他にも、系統学的にも生理機能的にも多様な菌株を公開して おり、生きた「モノ」として提供可能です。 参考文献: Kato et al. 2022. Nanobdella aerobiophila gen. nov., sp. nov., a thermoacidophilic, obligate ectosymbiotic archaeon, and proposal of Nanobdellaceae fam. nov., Nanobdellales ord. nov. and Nanobdellia class. nov. Int. J. Syst. Evol. Microbiol. 72: 005489. DOI: 10.1099/ijsem.0.005489 Imachi et al. 2024. Promethearchaeum syntrophicum gen. nov., sp. nov., an anaerobic, obligately syntrophic archaeon, the first isolate of the lineage 'Asgard' archaea, and proposal of the new archaeal phylum Promethearchaeota phyl. nov. and kingdom Promethearchaeati regn. nov. Int. J. Syst. Evol. Microbiol. 74: 006435. DOI: 10.1099/ijsem.0.006435 Katayama et al. 2024. Fidelibacter multiformis gen. nov., sp. nov., isolated from a deep subsurface aquifer and proposal of Fidelibacterota phyl. nov., formerly called Marine Group A, SAR406 or Candidatus Marinimicrobia Int. J. Syst. Evol. Microbiol. 74: 006558. DOI: 10.1099/ijsem.0.006558 Nakajima et al. 2025. Minisyncoccus archaeiphilus gen. nov., sp. nov., a mesophilic, obligate parasitic bacterium and proposal of Minisyncoccaceae fam. nov., Minisyncoccales ord. nov., Minisyncoccia class. nov. and Minisyncoccota phyl. nov. formerly referred to as Candidatus Patescibacteria or candidate phyla radiation Int. J. Syst. Evol. Microbiol. 75: 006668. DOI: 10.1099/ijsem.0.006668 加藤真悟(アーキア・極限環境細菌担当) ┏━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━ ┃ JCM株一覧表への分離源カテゴリーの追加 ┗━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━ 「JCM株一覧表」に、分離源情報に基づくカテゴリーを追加いたしました。現 時点では、原核生物株のみが対象です。菌株の選定の際に是非ご活用ください。 JCM株一覧表 https://www.jcm.riken.jp/JCM/list/ 分離源カテゴリーのリスト https://www.jcm.riken.jp/JCM/list/description.html ┏━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━ ┃ 8/26 TRIP Summer Event 2025 のお知らせ ┗━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━ 理化学研究所 最先端研究プラットフォーム連携(TRIP)事業本部では、専門 学校生、高等専門学校生(4年生以上)、大学生、大学院生の皆さまを対象に、 理研の研究基盤となる研究技術を数多くの研究室に提供・支援しているコアフ ァシリティで働く技術者たちの仕事や日頃見ることができない作業現場を公開 する一日限りのイベント(講演および見学会)を開催します。 筑波地区では、「バイオリソースなくして、研究なし!」と称される、「世界 のライフサイエンス研究を支える拠点・BRC(バイオリソースセンター)」を 見学することができます。 生命科学を支えるリアルな研究の最前線を、あなたの目で体感してください! 巧みな技術を持つ諸先輩方と交流できる貴重な機会です。ぜひ、ご応募ください! お申込み・詳細は下記をご覧ください。 8/26 TRIP Summer Event 2025 理研の研究力を支えるコアファシリティで働く:匠への道 https://web.brc.riken.jp/ja/archives/news/20250617_01 ┏━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━ ┃ BRC公式Bluesky(SNS)を開設しました ┗━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━ 分散型SNSとして活用が広まっているBlueskyに、BRC公式アカウントを開設い たしました。 バイオリソースに関連する情報や最新のお知らせを発信してまいります。 ぜひフォローをお願いいたします。 @riken-brc-jp.bsky.social ┏━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━ ┃ 新規公開微生物株(2025年5月-6月公開) ┗━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━ 細菌 "Agrococcus chionoecetis" JCM 37393 Proposed type strain Arcobacter iocasae JCM 35939 Type strain Blautia sp. JCM 36141 Blautia sp. JCM 36214 Brooklawnia propionicigenes JCM 15806 "Burkholderia theae" JCM 36471 Butyricimonas sp. JCM 36246 "Caenicola nitritireducens" JCM 31897 Proposed type strain Clostridium sp. JCM 36194 "Congregicoccus parvus" JCM 36569 Proposed type strain "Desulfurivibrio dismutans" JCM 39203 Proposed type strain "Elusimicrobium posterum" JCM 31828 Proposed type strain "Elusimicrobium simillimum" JCM 31830 Proposed type strain Enterocloster sp. JCM 36192 Enterococcus montenegrensis JCM 34907 Faecalibacterium langellae JCM 39552 Type strain "Flexibacterium corallicola" JCM 35474 Proposed type strain "Frateuria hangzhouensis" JCM 35226 Proposed type strain Gaoshiqia hydrogeniformans JCM 36072 Type strain Geomonas sp. JCM 33031 "Gracilimonas aurantiaca" JCM 37229 Proposed type strain Gulosibacter sediminis JCM 30297 Type strain Halodesulfovibrio sp. JCM 32479 Humidisolicoccus flavus JCM 37009 Type strain Janthinobacterium aestuarii JCM 36076 Type strain "Lachnoanaerobaculum sanguinis" JCM 36186 Proposed type strain Lacticaseibacillus salsurae JCM 37150 Type strain Lactovum odontotermitis JCM 34431 Type strain Lactovum odontotermitis JCM 34432 "Leuconostoc aquikimchii" JCM 37029 Levilactobacillus muriae JCM 37001 Type strain "Lutibacter atrimaris" JCM 32877 Proposed type strain "Magnetovirga frankeli" JCM 39467 Proposed type strain "Maritimibacter harenae" JCM 33811 Proposed type strain Methylobacterium sp. JCM 34944 Microaceticoccus formicicus JCM 39108 Type strain "Microbacterium chionoecetis" JCM 37392 Proposed type strain Micropruina sonneratiae JCM 34552 Type strain "Nesiotobacter zosterae" JCM 14066 Proposed type strain "Nocardioides jiangxiensis" JCM 36377 Proposed type strain "Nocardioides limicola" JCM 33692 Proposed type strain "Oceanispirochaeta piezotolerans" JCM 32615 Proposed type strain "Paenibacillus haidiansis" JCM 37487 Proposed type strain "Paenibacillus kandeliae" JCM 34547 Proposed type strain "Paenibacillus sanfengchensis" JCM 37488 Proposed type strain "Paracoccus yibinensis" JCM 36429 Proposed type strain "Parelusimicrobium proximum" JCM 31829 Proposed type strain Peptoniphilus sp. JCM 36142 Phocaeicola sp. JCM 36017 Phocaeicola sp. JCM 36018 Pilosibacter fragilis JCM 37189 "Pontosulfidobacter cellobiosiphilus" JCM 32480 Proposed type strain Prevotella sp. JCM 36069 "Pseudodesulfovibrio turroides" JCM 32483 Proposed type strain "Pseudogemmobacter faecipullorum" JCM 34182 Proposed type strain Pseudolactococcus yaeyamensis JCM 36015 Type strain Pseudomonas arabinosi JCM 37131 Type strain Pseudomonas atacamensis JCM 34579 "Pseudomonas ceruminis" JCM 34110 Proposed type strain "Pseudomonas faucium" JCM 34112 Proposed type strain Pseudomonas frigoris JCM 37141 Type strain Pseudomonas lyxosi JCM 37126 Type strain Pseudomonas parafulva JCM 35035 "Pseudomonas paraglycinae" JCM 34581 Proposed type strain "Pseudomonas parakoreensis" JCM 34582 Proposed type strain "Pseudomonas parasichuanensis" JCM 34580 Proposed type strain "Pseudomonas pharyngis" JCM 34583 Proposed type strain "Pseudomonas pseudonitroreducens" JCM 34578 Proposed type strain "Pseudomonas sputi" JCM 34577 Proposed type strain Pseudomonas tohonis JCM 34584 "Pseudomonas urethralis" JCM 34111 Proposed type strain Rhodococcus indonesiensis JCM 36625 Rodentibacter abscessus JCM 37054 Type strain Rodentibacter abscessus JCM 37055 Rodentibacter abscessus JCM 37056 Roseomonas xinghualingensis JCM 35902 Type strain "Saccharopolyspora mangrovi" JCM 34548 Proposed type strain Sanyastnella coralliicola JCM 35373 Type strain "Shewanella youngdeokensis" JCM 35745 Proposed type strain Skermanella cutis JCM 34945 Type strain "Sneathiella litorea" JCM 33810 Proposed type strain Stenotrophomonas pigmentata JCM 36488 Type strain Streptococcus sp. JCM 36001 Streptomyces avermitilis JCM 37747 Streptomyces avermitilis JCM 37748 Streptomyces avermitilis JCM 37749 Streptomyces avermitilis JCM 37750 Streptomyces avermitilis JCM 37751 Streptomyces avermitilis JCM 37752 Streptomyces avermitilis JCM 37753 Streptomyces avermitilis JCM 37754 Streptomyces avermitilis JCM 37847 Streptomyces avermitilis JCM 37848 Streptomyces avermitilis JCM 37849 Streptomyces cucumeris JCM 36418 Type strain Streptomyces lycopersici JCM 36736 Type strain "Streptomyces rubellus" JCM 35793 Proposed type strain "Terrimonas alba" JCM 37058 Proposed type strain Thiofaba tepidiphila JCM 39392 Unidentified bacterium JCM 36071 Unidentified bacterium JCM 36193 アーキア "Halosimplex amylolyticum" JCM 37371 Proposed type strain "Halosimplex halobium" JCM 34482 Proposed type strain "Halosimplex marinum" JCM 34315 Proposed type strain "Halovenus amylolytica" JCM 30833 Proposed type strain "Halovenus halobia" JCM 34159 Proposed type strain "Halovenus marina" JCM 37151 Proposed type strain Methanosarcina baikalica JCM 39438 Type strain 真菌 Aaosphaeria arxii JCM 39574 Alternaria chlamydospora JCM 39575 Alternaria sp. JCM 39592 Ascoidea xinghuacunensis JCM 36890 Type strain Atractium sp. JCM 39337 Camptophora sp. JCM 39274 Camptophora sp. JCM 39275 Camptophora sp. JCM 39276 Camptophora sp. JCM 39277 Camptophora sp. JCM 39278 Camptophora sp. JCM 39279 Cladosporium endophyticum JCM 37764 Cladosporium halotolerans JCM 37766 Cladosporium perangustum JCM 37760 Cladosporium sp. JCM 37761 Cladosporium sp. JCM 37762 Cladosporium sp. JCM 37763 Cladosporium sp. JCM 37768 Cladosporium sp. JCM 37769 Cladosporium sp. JCM 37770 Cladosporium sp. JCM 37771 Cladosporium sp. JCM 37772 Cladosporium sp. JCM 39603 Cladosporium sp. JCM 39604 Cladosporium sp. JCM 39605 Devonomyces endophyticus JCM 37765 Didymella heteroderae JCM 39578 Didymella segeticola JCM 39581 Epicoccum sp. JCM 39577 Epicoccum sp. JCM 39586 Geotrichum sinensis JCM 36364 Meira qingyuanensis JCM 36711 Type strain Montagnula chromolaenae JCM 39589 Neocucurbitaria keratinophila JCM 39585 Neocucurbitaria sp. JCM 39582 Neocucurbitaria sp. JCM 39584 Neodevriesia kalakoutskii JCM 39594 Neodevriesia metrosideri JCM 39601 Neodevriesia modesta JCM 39591 Nigrograna sp. JCM 39598 Paecilomyces divaricatus JCM 12812 Paecilomyces formosus JCM 28097 Paecilomyces formosus JCM 28182 Paecilomyces sp. JCM 11338 Paradendryphiella arenariae JCM 39580 Phaeophleospora sp. JCM 39590 Pseudocercospora sp. JCM 39583 Pseudopithomyces palmicola JCM 39576 Pyrenochaetopsis sp. JCM 39579 Septoria galeopsidis JCM 39600 Sphaerulina sp. JCM 37767 Stemphylium sp. JCM 39588 Subplenodomus galicola JCM 39596 Unidentified fungus JCM 39451 Unidentified fungus JCM 39597 Unidentified fungus JCM 39599 Valsaria insitiva JCM 39593 Zalaria obscura JCM 39587 Zasmidium sp. JCM 39595 詳細は以下のサイトから検索できますのでご利用ください。 https://jcm.brc.riken.jp/ja/catalogue ------------------------ ※ メールニュースの配信を停止されたい場合は、こちらのページ ( https://jcm.brc.riken.jp/ja/jcmmn )で配信停止を行ってください。 ※ 当メールへのご質問などは、微生物材料開発室( inquiry.jcm@riken.jp ) までお送りください。 ※ 当メールニュース受信者各位機関のサーバーメンテナンス等によりメール ニュースをお届けできない場合でも、メールニュースの再発行は行いません。 発行済みのメールニュースは当開発室のWebサイトで公開しておりますので そちらをご覧ください。 https://jcm.brc.riken.jp/ja/mailnews ※ 本メールに記載された内容は予告することなく変更することがあります。 ※ 本メールに掲載された記事を許可なく複製・転載することを禁止します。 _____________________________________________ 発行 理化学研究所 バイオリソース研究センター 微生物材料開発室 (JCM) inquiry.jcm@riken.jp https://jcm.brc.riken.jp/ja/ https://x.com/RBRC_JCM_jp https://x.com/RIKEN_BRC_jp https://bsky.app/profile/riken-brc-jp.bsky.social 2025年07月08日 _____________________________________________