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RIKEN BioResource Research Center - Japan Collection of Microorganisms
JCM Mail News (電子メール版) No. 133
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理化学研究所 バイオリソース研究センター 微生物材料開発室(JCM)
が公開している微生物等の最新情報をお届けします。
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● リソース紹介「利尻島および西表島の自然環境から分離された酵母株」
● 「JCM BLAST検索」を公開しました
● 新規公開微生物株(2024年10月公開)
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┃ リソース紹介「利尻島および西表島の自然環境から分離された酵母株」
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JCMでは、酵母の種多様性調査を目的として利尻島および西表島の土壌や植物
体から分離・培養された酵母916株を保管しています。これらを構成する総種
数は150以上にも及び、そのうち半数程度が分離当時は未記載種で、日本に棲
息する酵母類の多様さを示す分離株群です(Takashima et al., 2012)。
この中には油脂の産生能力が高い油糧酵母が含まれ(Tanimura et al., 2014a)、
デンプンから油脂を産生するSolicoccozyma terricola (JCM 24514など;
旧学名 Cryptococcus terricola)、グルコースとキシロースの混合物から油脂
を産生するCystobasidium iriomotense (JCM 24594Tなど)といった有用な形質
を併せ持つ菌株も報告されています(Tanimura et al., 2014b, 2018)。
今後、利尻島および西表島から分離された酵母株から、さらなるユニークな能
力が発見されることが期待されます。また、酵母の分類と種の多様性といった
基礎研究に活用されることも期待されます。
利尻島および西表島から分離された菌株の一覧は
https://www.jcm.riken.jp/cgi-bin/jcm/rishiri_iriomoteをご覧ください。
提供依頼にあたっては、まずはinquiry.jcm@riken.jpまでご相談ください。
参考文献
Takashima, M., Sugita, T., Van, B. H., Nakamura, M., Endoh, R.
and Ohkuma, M.
Taxonomic richness of yeasts in Japan within subtropical and cool
temperate areas.
PLOS ONE 7: e50784, 2012.
PMID: 23226383.
DOI: 10.1371/journal.pone.0050784.
Tanimura, A., Takashima, M., Sugita, T., Endoh, R., Kikukawa, M.,
Yamaguchi, S., Sakuradani, E., Ogawa, J. and Shima, J.
Selection of oleaginous yeasts with high lipid productivity for
practical biodiesel production.
Bioresour. Technol. 153: 230-235, 2014a.
PMID: 24368271.
DOI: 10.1016/j.biortech.2013.11.086.
Tanimura, A., Takashima, M., Sugita, T., Endoh, R., Kikukawa, M.,
Yamaguchi, S., Sakuradani, E., Ogawa, J., Ohkuma, M. and Shima, J.
Cryptococcus terricola is a promising oleaginous yeast for
biodiesel production from starch through consolidated bioprocessing.
Sci. Rep. 4: 4776, 2014b.
PMID: 24758986.
DOI: 10.1038/srep04776.
Tanimura, A., Sugita, T., Endoh, R., Ohkuma, M., Kishino, S.,
Ogawa, J., Shima, J. and Takashima, M.
Lipid production via simultaneous conversion of glucose and xylose by
a novel yeast, Cystobasidium iriomotense.
PLOS ONE 13: e0202164, 2018.
PMID: 30208038.
DOI: 10.1371/journal.pone.0202164.
遠藤 力也(酵母・酵母様藻類担当)
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┃ 「JCM BLAST検索」を公開しました
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「JCM BLAST検索」を公開いたしました。クエリ配列と相同性のあるゲノム配
列をもつJCM株(もしくは同等株)を検索することができます。
現時点では、原核生物株のみが対象です。是非ご活用ください。
JCM BLAST検索
https://www.jcm.riken.jp/JCM/jcmblast/jp/
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┃ 新規公開微生物株(2024年10月公開)
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細菌
Acidihalobacter sp. JCM 30070
"Adlercreutzia murintestinalis" JCM 37185 Proposed type strain
Adlercreutzia wanghongyangiae JCM 37067 Type strain
"Alistipes muris" JCM 37184 Proposed type strain
"Alkalihalobacterium chitinilyticum" JCM 35078 Proposed type strain
Amycolatopsis carbonis JCM 30563 Type strain
Amycolatopsis cynarae JCM 35980 Type strain
Amycolatopsis nalaikhensis JCM 30462 Type strain
"Bartonella apihabitans" JCM 35029 Proposed type strain
"Bartonella choladocola" JCM 35030 Proposed type strain
Biformimicrobium ophioploci JCM 36221 Type strain
"Bovifimicola ammoniilytica" JCM 37190 Proposed type strain
"Carboxydochorda subterranea" JCM 39509 Proposed type strain
"Flavobacterium agricola" JCM 34764 Proposed type strain
"Geochorda subterranea" JCM 39508 Proposed type strain
"Halalkalibacter alkaliphilus" JCM 34004 Proposed type strain
Metabacillus arenae JCM 34523 Type strain
Metabacillus sp. JCM 35039
Nocardia endophytica JCM 37298 Type strain
Nocardioides turkmenicus JCM 33525 Type strain
"Paracraurococcus lichenis" JCM 33121 Proposed type strain
Paraflavitalea pollutisoli JCM 36460 Type strain
Paraglaciecola algarum JCM 34972 Type strain
Paralimibaculum aggregatum JCM 36220 Type strain
"Parasutterella muris" JCM 37186 Proposed type strain
"Petralouisia muris" JCM 37187 Proposed type strain
Pollutibacter soli JCM 36462 Type strain
Polluticoccus soli JCM 36463 Type strain
"Porcipelethomonas ammoniilytica" JCM 37191 Proposed type strain
Psychrosphaera algicola JCM 34971 Type strain
"Senimuribacter intestinalis" JCM 37188 Proposed type strain
Sphaerotilus microaerophilus JCM 35424 Type strain
Sphingomonas endolithica JCM 35386 Type strain
"Streptococcus nakanoensis" JCM 35953 Proposed type strain
Streptomyces camelliae JCM 35918 Type strain
Streptomyces cathayae JCM 36055 Type strain
Streptomyces luomodiensis JCM 36555 Type strain
アーキア
Halomarina halobia JCM 34147 Type strain
Halomarina litorea JCM 34908 Type strain
Halomarina ordinaria JCM 34148 Type strain
Halomarina pelagica JCM 34910 Type strain
Methanobrevibacter curvatus JCM 39452 Type strain
真菌
Hannaella higashiohmiensis JCM 24969
Hannaella higashiohmiensis JCM 25812
Hannaella higashiohmiensis JCM 25820
Papiliotrema flavescens JCM 25798
Papiliotrema flavescens JCM 25823
Papiliotrema flavescens JCM 25885
Spencermartinsiella japonica JCM 35525
Spencermartinsiella japonica JCM 35526
Yamadazyma thunbergiae JCM 36746
Yamadazyma thunbergiae JCM 36749
詳細は以下のサイトから検索できますのでご利用ください。
https://jcm.brc.riken.jp/ja/catalogue
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発行
理化学研究所 バイオリソース研究センター
微生物材料開発室 (JCM)
inquiry.jcm@riken.jp
https://jcm.brc.riken.jp/ja/
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2024年11月07日
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