JCM Mail News No. 133


**********************************************************************
RIKEN BioResource Research Center - Japan Collection of Microorganisms
                JCM Mail News (電子メール版) No. 133
**********************************************************************

    理化学研究所 バイオリソース研究センター 微生物材料開発室(JCM)
    が公開している微生物等の最新情報をお届けします。

━━━━  目  次  ━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━
 ● リソース紹介「利尻島および西表島の自然環境から分離された酵母株」
 ● 「JCM BLAST検索」を公開しました
 ● 新規公開微生物株(2024年10月公開)
━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━

┏━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━
┃  リソース紹介「利尻島および西表島の自然環境から分離された酵母株」
┗━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━
JCMでは、酵母の種多様性調査を目的として利尻島および西表島の土壌や植物
体から分離・培養された酵母916株を保管しています。これらを構成する総種
数は150以上にも及び、そのうち半数程度が分離当時は未記載種で、日本に棲
息する酵母類の多様さを示す分離株群です(Takashima et al., 2012)。
この中には油脂の産生能力が高い油糧酵母が含まれ(Tanimura et al., 2014a)、
デンプンから油脂を産生するSolicoccozyma terricola (JCM 24514など;
旧学名 Cryptococcus terricola)、グルコースとキシロースの混合物から油脂
を産生するCystobasidium iriomotense (JCM 24594Tなど)といった有用な形質
を併せ持つ菌株も報告されています(Tanimura et al., 2014b, 2018)。
今後、利尻島および西表島から分離された酵母株から、さらなるユニークな能
力が発見されることが期待されます。また、酵母の分類と種の多様性といった
基礎研究に活用されることも期待されます。
利尻島および西表島から分離された菌株の一覧は
https://www.jcm.riken.jp/cgi-bin/jcm/rishiri_iriomoteをご覧ください。
提供依頼にあたっては、まずはinquiry.jcm@riken.jpまでご相談ください。

参考文献

Takashima, M., Sugita, T., Van, B. H., Nakamura, M., Endoh, R.
and Ohkuma, M.
Taxonomic richness of yeasts in Japan within subtropical and cool
temperate areas.
PLOS ONE 7: e50784, 2012.
PMID: 23226383.
DOI: 10.1371/journal.pone.0050784.

Tanimura, A., Takashima, M., Sugita, T., Endoh, R., Kikukawa, M.,
Yamaguchi, S., Sakuradani, E., Ogawa, J. and Shima, J.
Selection of oleaginous yeasts with high lipid productivity for
practical biodiesel production.
Bioresour. Technol. 153: 230-235, 2014a.
PMID: 24368271.
DOI: 10.1016/j.biortech.2013.11.086.

Tanimura, A., Takashima, M., Sugita, T., Endoh, R., Kikukawa, M.,
Yamaguchi, S., Sakuradani, E., Ogawa, J., Ohkuma, M. and Shima, J.
Cryptococcus terricola is a promising oleaginous yeast for
biodiesel production from starch through consolidated bioprocessing.
Sci. Rep. 4: 4776, 2014b.
PMID: 24758986.
DOI: 10.1038/srep04776.

Tanimura, A., Sugita, T., Endoh, R., Ohkuma, M., Kishino, S.,
Ogawa, J., Shima, J. and Takashima, M.
Lipid production via simultaneous conversion of glucose and xylose by
a novel yeast, Cystobasidium iriomotense.
PLOS ONE 13: e0202164, 2018.
PMID: 30208038.
DOI: 10.1371/journal.pone.0202164.

遠藤  力也(酵母・酵母様藻類担当)

┏━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━
┃  「JCM BLAST検索」を公開しました
┗━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━
「JCM BLAST検索」を公開いたしました。クエリ配列と相同性のあるゲノム配
列をもつJCM株(もしくは同等株)を検索することができます。
現時点では、原核生物株のみが対象です。是非ご活用ください。

JCM BLAST検索
https://www.jcm.riken.jp/JCM/jcmblast/jp/

┏━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━
┃  新規公開微生物株(2024年10月公開)
┗━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━
細菌
Acidihalobacter sp.                    JCM 30070
"Adlercreutzia murintestinalis"        JCM 37185  Proposed type strain
Adlercreutzia wanghongyangiae          JCM 37067  Type strain
"Alistipes muris"                      JCM 37184  Proposed type strain
"Alkalihalobacterium chitinilyticum"   JCM 35078  Proposed type strain
Amycolatopsis carbonis                 JCM 30563  Type strain
Amycolatopsis cynarae                  JCM 35980  Type strain
Amycolatopsis nalaikhensis             JCM 30462  Type strain
"Bartonella apihabitans"               JCM 35029  Proposed type strain
"Bartonella choladocola"               JCM 35030  Proposed type strain
Biformimicrobium ophioploci            JCM 36221  Type strain
"Bovifimicola ammoniilytica"           JCM 37190  Proposed type strain
"Carboxydochorda subterranea"          JCM 39509  Proposed type strain
"Flavobacterium agricola"              JCM 34764  Proposed type strain
"Geochorda subterranea"                JCM 39508  Proposed type strain
"Halalkalibacter alkaliphilus"         JCM 34004  Proposed type strain
Metabacillus arenae                    JCM 34523  Type strain
Metabacillus sp.                       JCM 35039
Nocardia endophytica                   JCM 37298  Type strain
Nocardioides turkmenicus               JCM 33525  Type strain
"Paracraurococcus lichenis"            JCM 33121  Proposed type strain
Paraflavitalea pollutisoli             JCM 36460  Type strain
Paraglaciecola algarum                 JCM 34972  Type strain
Paralimibaculum aggregatum             JCM 36220  Type strain
"Parasutterella muris"                 JCM 37186  Proposed type strain
"Petralouisia muris"                   JCM 37187  Proposed type strain
Pollutibacter soli                     JCM 36462  Type strain
Polluticoccus soli                     JCM 36463  Type strain
"Porcipelethomonas ammoniilytica"      JCM 37191  Proposed type strain
Psychrosphaera algicola                JCM 34971  Type strain
"Senimuribacter intestinalis"          JCM 37188  Proposed type strain
Sphaerotilus microaerophilus           JCM 35424  Type strain
Sphingomonas endolithica               JCM 35386  Type strain
"Streptococcus nakanoensis"            JCM 35953  Proposed type strain
Streptomyces camelliae                 JCM 35918  Type strain
Streptomyces cathayae                  JCM 36055  Type strain
Streptomyces luomodiensis              JCM 36555  Type strain

アーキア
Halomarina halobia                     JCM 34147  Type strain
Halomarina litorea                     JCM 34908  Type strain
Halomarina ordinaria                   JCM 34148  Type strain
Halomarina pelagica                    JCM 34910  Type strain
Methanobrevibacter curvatus            JCM 39452  Type strain

真菌
Hannaella higashiohmiensis             JCM 24969
Hannaella higashiohmiensis             JCM 25812
Hannaella higashiohmiensis             JCM 25820
Papiliotrema flavescens                JCM 25798
Papiliotrema flavescens                JCM 25823
Papiliotrema flavescens                JCM 25885
Spencermartinsiella japonica           JCM 35525
Spencermartinsiella japonica           JCM 35526
Yamadazyma thunbergiae                 JCM 36746
Yamadazyma thunbergiae                 JCM 36749

詳細は以下のサイトから検索できますのでご利用ください。
https://jcm.brc.riken.jp/ja/catalogue

------------------------
※ メールニュースの配信を停止されたい場合は、こちらのページ
( https://jcm.brc.riken.jp/ja/jcmmn )で配信停止を行ってください。
※ 当メールへのご質問などは、微生物材料開発室( inquiry.jcm@riken.jp )
までお送りください。
※ 当メールニュース受信者各位機関のサーバーメンテナンス等によりメール
ニュースをお届けできない場合でも、メールニュースの再発行は行いません。
発行済みのメールニュースは当開発室のWebサイトで公開しておりますので
そちらをご覧ください。
https://jcm.brc.riken.jp/ja/mailnews
※ 本メールに記載された内容は予告することなく変更することがあります。
※ 本メールに掲載された記事を許可なく複製・転載することを禁止します。
_____________________________________________
発行
理化学研究所 バイオリソース研究センター
微生物材料開発室 (JCM)
inquiry.jcm@riken.jp
https://jcm.brc.riken.jp/ja/
https://x.com/RBRC_JCM_jp
https://x.com/RIKEN_BRC_jp
2024年11月07日
_____________________________________________


コメントは受け付けていません。