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RIKEN BioResource Research Center - Japan Collection of Microorganisms
JCM Mail News （電子メール版） No. 131
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理化学研究所 バイオリソース研究センター 微生物材料開発室（JCM）
が公開している微生物等の最新情報をお届けします。
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● リソース紹介「液液共培養法によって分離された腸内細菌について」
● 新規公開微生物株（2024年5月-2024年6月公開）
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┃ リソース紹介「液液共培養法によって分離された腸内細菌について」
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腸内細菌は、ヒトの生理機能や多様な疾患に関係することから、医薬品開発な
ど様々な産業分野で注目されています。したがって、難培養微生物や新種など
の分離、培養、分類は、新たな生菌製剤の開発に必要不可欠です。これまで、
いくつかの新種や難培養微生物が共培養によって分離されていますが、固体培
地の代わりに液体培地を用いた液液共培養法を用いて菌株を単離した例はあま
りありません。最近、便希釈液を生育支持菌として、支持菌の産生する代謝産
物により、フィルター濾過（孔径0.45 µm）によって選別した極小の未知細菌
種の生育促進と分離が期待される新しい培養法である液液共培養法を用いて、
湾曲状の特徴を有するWaltera intestinalis（JCM 36211）が分離されました。
W. intestinalisはこれまで仔豚からしか分離されておらず、ヒトから分離さ
れたのは今回が初めてとなります。また、W. intestinalisとともに、Waltera
属の2番目の菌種となるWaltera acetigignens（JCM 36210およびJCM 36378）
も分離されています。分離株の細胞サイズは、生育初期では短く細く、培養時
間が経つごとに長く太くなることが確認されており、培養初期には分離株はフ
ィルターを通過し、後に伸長するというユニークな特徴を持つことが示唆され
ています。液液共培養法は、腸内細菌の分離方法にとどまらず、今後、さまざ
まな環境の微生物の分離への応用が期待されています。
参考文献
久富ら，2024. 液液共培養法による腸内細菌の分離と同定. Microb. Resour.
Syst., 40: 39-45.
Sakamoto et al. 2024. Isolation and characterization of a new Waltera
species and reclassification of Brotolimicola acetigignens Hitch et al.
2022 as Waltera acetigignens comb. nov. Int. J. Syst. Evol. Microbiol.,
74: 006381.
DOI: 10.1099/ijsem.0.006381
坂本 光央（嫌気性細菌および乳酸菌担当）
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┃ 新規公開微生物株（2024年5月-2024年6月公開）
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細菌
Acinetobacter colistiniresistens JCM 36653 Type strain
Acinetobacter schindleri JCM 36654 Type strain
Acinetobacter ursingii JCM 36655 Type strain
Acinetobacter variabilis JCM 36656 Type strain
Agrococcus terreus JCM 34467
Agromyces sp. JCM 34416
Anaerolentibacter hominis JCM 36511 Type strain
Aneurinibacillus uraniidurans JCM 36228 Type strain
Arthrobacter jiangjiafuii JCM 34728 Type strain
Arthrobacter sp. JCM 33935
Arthrobacter sunyaminii JCM 34727 Type strain
"Brachybacterium equifaecis" JCM 35094 Proposed type strain
Brachybacterium sacelli JCM 34468
Bradyrhizobium roseum JCM 34606 Type strain
"Caldimonas mangrovi" JCM 34532 Proposed type strain
"Campylobacter felis" JCM 35847 Proposed type strain
"Campylobacter gastrosuis" JCM 35849 Proposed type strain
"Campylobacter ovis" JCM 35848 Proposed type strain
Cellulomonas dongxiuzhuiae JCM 34729 Type strain
Cellulomonas fengjieae JCM 34730 Type strain
Cellulomonas sp. JCM 34559
Cellulomonas wangleii JCM 34731 Type strain
Chitinophaga horti JCM 33215 Type strain
Clostridium aquiflavi JCM 35355 Type strain
"Clostridium brassicae" JCM 35370 Proposed type strain
Coraliomargarita algicola JCM 35407 Type strain
Coralliovum pocilloporae JCM 35320 Type strain
"Corallococcus caeni" JCM 36609 Proposed type strain
"Corallococcus caeni" JCM 36610
"Desulfomicrobium aggregans" JCM 39179 Proposed type strain
Diplocloster hominis JCM 36512 Type strain
"Erwinia sorbitola" JCM 33839 Proposed type strain
Flavobacterium acetivorans JCM 34193 Type strain
Flavobacterium galactosidilyticum JCM 34203 Type strain
"Flexivirga meconopsidis" JCM 36020 Proposed type strain
"Granulicatella seriolae" JCM 35604 Proposed type strain
"Halomonas piscis" JCM 35927
"Halomonas piscis" JCM 35928
"Halomonas piscis" JCM 35929 Proposed type strain
Hymenobacter canadensis JCM 35843 Type strain
Janibacter limosus JCM 34464
Kaistella rhinocerotis JCM 36038 Type strain
Kitasatospora cathayae JCM 36274 Type strain
Leucobacter edaphi JCM 34360 Type strain
"Limobrevibacterium gyesilva" JCM 35944 Proposed type strain
Lutimonas zeaxanthinifaciens JCM 36287 Type strain
"Lysinibacillus piscis" JCM 36611 Proposed type strain
"Lysobacter changpingensis" JCM 34576 Proposed type strain
"Macromonas nakdongensis" JCM 31376 Proposed type strain
Marinomonas phaeophyticola JCM 35412 Type strain
Marinomonas rhodophyticola JCM 35591 Type strain
Methylobacterium durans JCM 33120
Microbacterium saccharophilum JCM 34465
"Micromonospora thermarum" JCM 17127 Proposed type strain
Mycolicibacterium cyprinidarum JCM 35117 Type strain
"Natronospira bacteriovora" JCM 35397 Proposed type strain
"Natronospira elongata" JCM 35396 Proposed type strain
Nesterenkonia aerolata JCM 36375 Type strain
Niabella defluvii JCM 35315 Type strain
Nocardia implantans JCM 34959 Type strain
Nocardia sp. JCM 33933
Nocardioides litoris JCM 34463
Nocardioides sp. JCM 34558
Ochrobactrum chromiisoli JCM 36000 Type strain
"Ornithinimicrobium cryptoxanthini" JCM 34882 Proposed type strain
"Ornithinimicrobium faecis" JCM 34881 Proposed type strain
"Ornithinimicrobium sufpigmenti" JCM 33397 Proposed type strain
Pararhizobium qamdonense JCM 36247 Type strain
Pelosinus baikalensis JCM 39258 Type strain
Phytohabitans maris JCM 36507 Type strain
Pilosibacter fragilis JCM 36513 Type strain
Propionivibrio soli JCM 35595 Type strain
Protaetiibacter mangrovi JCM 33142 Type strain
"Pseudodesulfovibrio JCM 39269 Proposed type strain
thermohalotolerans"
Quadrisphaera granulorum JCM 34466
"Rheinheimera faecalis" JCM 34823 Proposed type strain
"Roseiterribacter gracilis" JCM 34627 Proposed type strain
"Roseomonas populi" JCM 35579 Proposed type strain
Shewanella phaeophyticola JCM 35409 Type strain
"Shumkonia mesophila" JCM 34766 Proposed type strain
Sinomonas terricola JCM 35868 Type strain
Sphingobacterium oryzagri JCM 35893 Type strain
Sphingobium sp. JCM 36668
Spirillospora rubra JCM 36631 Type strain
"Sporanaerobium hydrogeniformans" JCM 32657 Proposed type strain
"Streptomonospora mangrovi" JCM 34292 Proposed type strain
Streptomyces albipurpureus JCM 35391 Type strain
"Streptomyces argyrophyllae" JCM 35923 Proposed type strain
Streptomyces avermitilis JCM 36725
Streptomyces avermitilis JCM 36726
Streptomyces avermitilis JCM 36727
Streptomyces avermitilis JCM 36728
Streptomyces avermitilis JCM 36729
Streptomyces avermitilis JCM 36730
Streptomyces avermitilis JCM 36731
Streptomyces avermitilis JCM 36732
Streptomyces avermitilis JCM 36733
Streptomyces avermitilis JCM 36734
Streptomyces beigongshangae JCM 34712 Type strain
"Streptomyces halobius" JCM 34935 Proposed type strain
"Streptomyces himalayensis subsp. JCM 33759 Proposed type strain
aureolus"
"Streptomyces himalayensis subsp. JCM 33755 Proposed type strain
himalayensis"
Streptomyces longhuiensis JCM 34789 Type strain
Streptomyces mimosae JCM 33207
"Streptomyces niphimycinicus" JCM 34996 Proposed type strain
Streptomyces sp. JCM 33753
Streptomyces sp. JCM 33754
Streptomyces sp. JCM 33756
Streptomyces sp. JCM 33757
Streptomyces sp. JCM 33758
Streptomyces sp. JCM 34561
"Streptomyces terrae" JCM 35768 Proposed type strain
"Sulfurospirillum oryzae" JCM 35596 Proposed type strain
Vibrio algarum JCM 35410 Type strain
Waltera acetigignens JCM 36210
Waltera acetigignens JCM 36378
Waltera intestinalis JCM 36211
アーキア
Haloarcula halobia JCM 34149 Type strain
Haloarcula halophila JCM 34479 Type strain
Haloarcula litorea JCM 34480 Type strain
Haloarcula pelagica JCM 30034 Type strain
Haloarcula rara JCM 30843 Type strain
"Halomontanus rarus" JCM 34316
"Methanobacterium cahuitense" JCM 39174 Proposed type strain
"Natronoglomus mannanivorans" JCM 34861 Proposed type strain
"Natronoglomus mannanivorans" JCM 34866
"Natronosalvus hydrolyticus" JCM 34865 Proposed type strain
真菌
Acremonium sp. JCM 28389
Acremonium sp. JCM 28462
Acremonium sp. JCM 28478
Bannoa ellipsoidea JCM 35734
Bannoa foliicola JCM 35726
Cystofilobasidium josepaulonis JCM 35442
Danielozyma pruni JCM 35735
Erythrobasidium turpiniae JCM 35725
Metschnikowia kenjo JCM 35862
Metschnikowia seizan JCM 35863
Metschnikowia shishimaru JCM 35864
Meyerozyma guilliermondii JCM 28203
Meyerozyma guilliermondii JCM 28204
Mrakia arctica JCM 32069
Pichia kurtzmaniana JCM 36238
Pichia kurtzmaniana JCM 36239
Sarocladium sp. JCM 28152
Sarocladium sp. JCM 28330
Sarocladium sp. JCM 28331
Sarocladium sp. JCM 28333
Sarocladium sp. JCM 28337
Sarocladium sp. JCM 28417
Sarocladium sp. JCM 28428
Sarocladium sp. JCM 28436
Saturnispora sinensis JCM 36357
Spencermartinsiella henanensis JCM 35730
Teunia acericola JCM 35732
Teunia qingyuanensis JCM 36686
Unidentified fungus JCM 28141
Unidentified fungus JCM 28359
Unidentified fungus JCM 28385
Vishniacozyma pseudocarnescens JCM 35058
Vishniacozyma pseudocarnescens JCM 35059
Vishniacozyma pseudocarnescens JCM 35060
Wickerhamiella bidentis JCM 35540
Wickerhamiella bidentis JCM 35541
Yueomyces silvicola JCM 34883
Yueomyces silvicola JCM 34884
Yueomyces silvicola JCM 34885
Yueomyces silvicola JCM 34886
詳細は以下のサイトから検索できますのでご利用ください。
https://jcm.brc.riken.jp/ja/catalogue
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発行
理化学研究所 バイオリソース研究センター
微生物材料開発室 (JCM)
inquiry.jcm@riken.jp
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2024年07月25日
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