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RIKEN BioResource Research Center - Japan Collection of Microorganisms
JCM Mail News （電子メール版） No. 124
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理化学研究所 バイオリソース研究センター 微生物材料開発室（JCM）
が公開している微生物等の最新情報をお届けします。
━━━━ 目 次 ━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━
● リソース紹介「アンモニウム変換能を有するFlavobacterium属の新種」
● 真菌類の分子系統解析に関する技術研修実施のお知らせ
● 新規公開微生物株（2022年9月-2022年11月公開）
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┃ リソース紹介「アンモニウム変換能を有するFlavobacterium属の新種」
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微生物は自然界の物質循環に大きく関与しており、環境中の微生物群集構造や
生態的特徴を明らかすることは人類が環境を持続的に維持していく上でも重要
と考えられます。
Flavobacterium属菌株は好気性グラム陰性桿菌で、湖沼や河川、土壌をはじめ
とした様々な環境に生息しています。埼玉県環境科学国際センターの研究グル
ープは、水環境保全の観点から埼玉県の河川の細菌群を調査し、分離された菌
株の中からFlavobacterium属の2新種を発見しました。これらの菌株は生息地
における優占種と考えられ、さらに水中の溶存有機態窒素をアンモニウムに変
換する能力を持っていることから、水中の窒素循環において重要な役割を担っ
ていると考えられるそうです。これら2新種はアンモニウム変換能にちなみ、
Flavobacterium ammonificansおよびF. ammoniigenesと命名され、IJSEM誌で
発表されました。
JCMでは下記のJCM番号にて公開しています。
Flavobacterium ammonificans JCM 34684(T), JCM 34685 (=SHINM13, GENT11)
Flavobacterium ammoniigenes JCM 32249(T) (=GENT5)
文献
1. Watanabe, K., Kitamura, T., Ogata, Y., Shindo, C. and Suda, W. 2022.
Flavobacterium ammonificans sp. nov. and Flavobacterium ammoniigenes
sp. nov., ammonifying bacteria isolated from surface river water.
Int. J. Syst. Evol. Microbiol. 72: 005307.
DOI: 10.1099/ijsem.0.005307.
2. Suda, W., Ogata, Y., Shindo, C. and Watanabe, K. 2022.
Complete genome sequences of two Flavobacterium ammonificans strains
and a Flavobacterium ammoniigenes strain of ammonifying
bacterioplankton isolated from surface river water.
Microbiol. Resour. Announc. 11: e0017622.
DOI: 10.1128/mra.00176-22.
参考資料
https://www.pref.saitama.lg.jp/b0508/news/page/news2022071901.html
押田 祐美（好気性細菌担当）
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┃ 真菌類の分子系統解析に関する技術研修実施のお知らせ
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理研BRC微生物材料開発室では以下の要領で技術研修を行う予定です。
概 要：真菌類を事例に分子系統解析に関する基本的な実験操作について、
講義と実習を行います。
研修期間：2023年3月7日（火）～ 2023年3月8日（水）（2日間）
開催方法：オンライン
定 員：5～10名
対 象：微生物の取り扱い業務に従事している方、または従事する予定の方。
（大学・公的機関や民間の企業・団体に所属されていること）
詳細が決まりましたら、ホームページでご案内いたします。
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┃ 新規公開微生物株（2022年9月-2022年11月公開）
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細菌
Acidithiobacillus ferrooxidans JCM 39192
Acinetobacter sp. JCM 18511
Acrocarpospora catenulata JCM 34849 Type strain
Aestuariicella albida JCM 34652 Type strain
Alcanivorax sp. JCM 18791
Aquirufa aurantiipilula JCM 34078 Type strain
Aquirufa lenticrescens JCM 34077 Type strain
Berryella wangjianweii JCM 34748 Type strain
Blautia pseudococcoides JCM 35243 Type strain
Croceicoccus hydrothermalis JCM 31508 Type strain
Deefgea salmonis JCM 35050 Type strain
"Desulfopila corrodens" JCM 39320
Flavobacterium soyae JCM 34673 Type strain
"Geoalkalibacter halelectricus" JCM 35356 Proposed type strain
Gordonia liuliyuniae JCM 34879 Type strain
Gordonia zhenghanii JCM 34878 Type strain
Granulimonas faecalis JCM 35015 Type strain
"Hallella faecis" JCM 34979 Proposed type strain
Hephaestia mangrovi JCM 33125 Type strain
Ideonella aquatica JCM 34285 Type strain
Jiella flava JCM 34331 Type strain
Lactobacillus amylovorus JCM 35777
Legionella lytica JCM 33226
Leptogranulimonas caecicola JCM 35017 Type strain
"Levilactobacillus tujiorum" JCM 35210 Proposed type strain
Ligilactobacillus pabuli JCM 34518 Type strain
Limnohabitans australis JCM 32223
Lysobacter avium JCM 33223 Type strain
Lysobacter ciconiae JCM 34832 Type strain
Lysobacter selenitireducens JCM 34786 Type strain
Megasphaera elsdenii JCM 35779
Metabacillus flavus JCM 34406 Type strain
Micromonospora antibiotica JCM 34495 Type strain
Micromonospora humidisoli JCM 34496 Type strain
Mucilaginibacter robiniae JCM 33062 Type strain
Neorhizobium xiangyangii JCM 35100 Type strain
Niabella agricola JCM 34758 Type strain
Nocardioides campestrisoli JCM 34307 Type strain
Nocardioides ochotonae JCM 34185 Type strain
Paenibacillus sabuli JCM 34216 Type strain
"Palleniella intestinalis" JCM 34697 Proposed type strain
Parachryseolinea silvisoli JCM 35041 Type strain
Paracoccus everestensis JCM 35227 Type strain
Polymorphobacter megasporae JCM 34545 Type strain
Pseudomonas lijiangensis JCM 35177 Type strain
Rhodoluna lacicola JCM 32204
Roseovarius carneus JCM 34778 Type strain
Saccharothrix luteola JCM 34800 Type strain
Salmonella enterica subsp. enterica JCM 35086
Salmonella enterica subsp. enterica JCM 35087
Salmonella enterica subsp. enterica JCM 35088
Salmonella enterica subsp. enterica JCM 35089
Salmonella enterica subsp. enterica JCM 35090
Salmonella enterica subsp. enterica JCM 35091
Salmonella enterica subsp. enterica JCM 35092
Salmonella enterica subsp. enterica JCM 35093
Secundilactobacillus angelensis JCM 35209 Type strain
"Sellimonas caecigallum" JCM 35759 Proposed type strain
Sphingomonas citri JCM 34796 Type strain
Sphingomonas citricola JCM 34795 Type strain
Sphingomonas folii JCM 34794 Type strain
"Sporosarcina beigongshangi" JCM 34409 Proposed type strain
Streptococcus alactolyticus JCM 35778
Streptomyces plumbidurans JCM 35204 Type strain
"Sulfurimonas aquatica" JCM 35004 Proposed type strain
"Taurinivorans muris" JCM 34262
Tenacibaculum aquimarinum JCM 35023 Type strain
Unidentified actinobacterium JCM 32205
Unidentified bacterium JCM 32221
Unidentified bacterium JCM 32222
Unidentified bacterium JCM 32224
Xiamenia xianingshaonis JCM 34097 Type strain
"Xylanibacter muris" JCM 34698 Proposed type strain
"Xylanibacter rodentium" JCM 34762 Proposed type strain
Zobellella iuensis JCM 34456 Type strain
アーキア
Haladaptatus halobius JCM 34141 Type strain
Haladaptatus salinisoli JCM 34142 Type strain
Halosolutus amylolyticus JCM 33558 Type strain
Halosolutus gelatinilyticus JCM 33554 Type strain
Halosolutus halophilus JCM 30838 Type strain
Metallosphaera javensis JCM 34702 Type strain
Methanobacterium alkalithermotolerans JCM 31304 Type strain
真菌
Globisporangium sp. JCM 30524
Hanseniaspora osmophila JCM 34045
Hanseniaspora osmophila JCM 34052
Hanseniaspora vineae JCM 34057
Hanseniaspora vineae JCM 34058
Phaeotremella translucens JCM 32022
Phaeotremella translucens JCM 32023
Sirobasidium apiculatum JCM 32018
Sirobasidium apiculatum JCM 32019
Sirobasidium japonicum JCM 32020
Sirobasidium japonicum JCM 32021
Starmerella stellata JCM 34049
Torulaspora delbrueckii JCM 34048
Torulaspora delbrueckii JCM 34061
詳細は以下のサイトから検索できますのでご利用ください。
https://jcm.brc.riken.jp/ja/catalogue
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発行
理化学研究所 バイオリソース研究センター
微生物材料開発室 (JCM)
inquiry.jcm@riken.jp
https://jcm.brc.riken.jp/ja/
2022年12月22日
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