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RIKEN BioResource Research Center - Japan Collection of Microorganisms
JCM Mail News （電子メール版） No. 123
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理化学研究所 バイオリソース研究センター 微生物材料開発室（JCM）
が公開している微生物等の最新情報をお届けします。
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● リソース紹介「酵母による果糖の発酵能力と資化能力」
● 「理化学研究所 筑波地区 一般公開 2022」のお知らせ
● JCM株の一覧表を公開しています
● 新規公開微生物株（2022年6月-2022年8月公開）
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┃ リソース紹介「酵母による果糖の発酵能力と資化能力」
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酵母には1,500以上の種が知られており、このうちのおよそ半数が子嚢菌門
Ascomycotaに属します。Saccharomyces cerevisiaeやSchizosaccharomyces
pombeに代表される子嚢菌酵母では、7割以上の種でアルコール発酵を行う能力
があります。しかし、アルコール発酵に利用できる糖類の種類は酵母の種によ
ってまちまちで、表現型Phenotypeとして違いがあることが古くから知られて
きました。いわば、菌種（あるいは菌株）によって“個性”がある、と言えま
す。例えば酵母の代表格であるS. cerevisiae ではブドウ糖Glucose・麦芽糖
Maltose・ショ糖Sucroseをアルコール発酵しますが、乳糖Lactoseではアルコ
ール発酵が観察されません。
DNAの存在が知られていなかった時代から、こういった表現型の相違によっ
て酵母の種の識別は行われてきました。こういった背景から、ブドウ糖やショ
糖といった一般的な糖類に対する酵母の発酵能力や資化能力（栄養源として利
用する能力）のデータは、連綿と蓄積してきました。しかしなぜか、果糖
Fructoseの発酵能力と資化能力に関するデータは、ほとんどありませんでした。
欠落していた果糖の発酵能力・資化能力について、JCMが保存している酵母
388株を用いて検証したところ、302株（78%）が果糖を発酵できること、全株
が果糖を資化できることを発見しました。これらは、研究材料として利用され
る酵母の利用価値をさらに高める基礎データ（菌株付随情報）であるといえま
す。酵母たちには、見過ごされている“個性”がまだまだあるのかもしれませ
ん。
ではなぜ、果糖に関する発酵能力・資化能力のデータは欠落していたのか？
その経緯を調べてみると思いもよらない背景があることが判明していき………
ご興味のある方は是非、下記の文献またはプレスリリースをご参照ください。
参考文献
Rikiya Endoh, Maiko Horiyama, and Moriya Ohkuma,
"D-Fructose assimilation and fermentation by yeasts belonging to
Saccharomycetes: Rediscovery of universal phenotypes and elucidation
of fructophilic behaviors in Ambrosiozyma platypodis and Cyberlindnera
americana", Microorganisms, microorganisms9040758
https://doi.org/10.3390/microorganisms9040758
プレスリリース
酵母の果糖発酵と資化能力を再発見
－388株の酵母を使って見過ごされてきた能力を検証－
https://www.riken.jp/press/2021/20210405_1/index.html
遠藤 力也（酵母・酵母様藻類担当）
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┃ 「理化学研究所 筑波地区 一般公開 2022」のお知らせ
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理化学研究所 筑波地区 一般公開を現地参加とオンラインのハイブリッドで
開催します。
開催日時：2022年10月15日（土）9：00～16：00
現地参加を希望する場合は、事前申込が必要となります。
詳細は以下のサイトをご覧ください。
https://openday-tsukuba.riken.jp/
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┃ JCM株の一覧表を公開しています
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JCM株の一覧表を公開しています。JCMからご利用いだだける全原核生物（バク
テリアおよびアーキア）の菌株リストに加えて、個別の分類群（アーキア、乳
酸菌、酵母および酵母様藻類）の菌株リストを含みます。高次分類名や培地番
号、培養温度による絞り込み検索も可能です。菌株のご利用を検討される際に、
是非ご活用ください。
JCM株一覧表
https://www.jcm.riken.jp/JCM/list/
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┃ 新規公開微生物株（2022年6月-2022年8月公開）
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細菌
"Achromobacter aestuarii" JCM 33329 Proposed type strain
Acidaminococcus intestini JCM 35489
"Acididesulfobacillus acetoxydans" JCM 30553
Acidihalobacter yilgarnensis JCM 32255 Type strain
Acinetobacter sp. JCM 14947
Acinetobacter sp. JCM 17259
"Actinoplanes aureus" JCM 33971 Proposed type strain
"Agromyces laixinhei" JCM 33695 Proposed type strain
"Alkanindiges hydrocarboniclasticus" JCM 31550 Proposed type strain
Anaerostipes caccae JCM 35490
Apilactobacillus xinyiensis JCM 34501 Type strain
Apilactobacillus zhangqiuensis JCM 34500 Type strain
Arcobacter sp. JCM 18854
Arenicella sp. JCM 18478
"Arthrobacter sulfonylureivorans" JCM 32824 Proposed type strain
Azotobacter chroococcum subsp. isscasi JCM 33394 Type strain
Bacteroides cellulosilyticus JCM 35491
Bilophila wadsworthia JCM 35487
Blautia hansenii JCM 35484
Blautia wexlerae JCM 35486
"Brevibacterium renqingii" JCM 33953 Proposed type strain
Burkholderia sp. JCM 18793
Butyricicoccus intestinisimiae JCM 35584 Type strain
Catellatospora tritici JCM 33977 Type strain
Clostridium scindens JCM 35483
Clostridium spiroforme JCM 35488
Comamonas sp. JCM 18736
Comamonas sp. JCM 18737
Comamonas sp. JCM 18738
Desulfoferrobacter suflitae JCM 39248 Type strain
Dialister invisus JCM 35492
"Ectobacillus aegiceratis" JCM 33414 Proposed type strain
Escherichia coli JCM 35038
Extibacter muris JCM 35582 Type strain
Ezakiella coagulans JCM 35485
Ferrimonas sp. JCM 18312
Geobacter pickeringii JCM 13000 Type strain
Haloferula sp. JCM 18780
Haloferula sp. JCM 18781
Halomonas populi JCM 33545 Type strain
Halomonas populi JCM 33546
Halomonas populi JCM 33547
Herbaspirillum sp. JCM 18710
Herbaspirillum sp. JCM 18711
Herbaspirillum sp. JCM 18712
"Herbidospora solisilvae" JCM 33460 Proposed type strain
Huaxiibacter chinensis JCM 35262 Type strain
Hydrogenophaga sp. JCM 18739
"Hymenobacter radiodurans" JCM 33185 Proposed type strain
"Janthinobacterium tructae" JCM 33613 Proposed type strain
Lacticaseibacillus pantheris JCM 35494
Lacticaseibacillus pantheris JCM 35511
Lactiplantibacillus pentosus JCM 35499
Lactiplantibacillus pentosus JCM 35500
Lactiplantibacillus pentosus JCM 35502
Lactiplantibacillus plantarum subsp. JCM 35493
plantarum
Lactiplantibacillus plantarum subsp. JCM 35495
plantarum
Lactiplantibacillus plantarum subsp. JCM 35497
plantarum
Lactiplantibacillus plantarum subsp. JCM 35498
plantarum
Lactiplantibacillus plantarum subsp. JCM 35503
plantarum
Lactiplantibacillus plantarum subsp. JCM 35504
plantarum
Lactiplantibacillus plantarum subsp. JCM 35505
plantarum
Lactiplantibacillus plantarum subsp. JCM 35506
plantarum
Lactiplantibacillus plantarum subsp. JCM 35512
plantarum
Lactiplantibacillus plantarum subsp. JCM 35513
plantarum
Lactiplantibacillus plantarum subsp. JCM 35515
plantarum
Lactiplantibacillus plantarum subsp. JCM 35516
plantarum
Leucobacter chinensis JCM 34651 Type strain
Levilactobacillus brevis JCM 35496
Levilactobacillus brevis JCM 35507
Levilactobacillus brevis JCM 35508
Levilactobacillus brevis JCM 35509
Levilactobacillus brevis JCM 35510
Levilactobacillus brevis JCM 35514
"Limisalsivibrio acetivorans" JCM 19438 Proposed type strain
Limosilactobacillus fermentum JCM 35501
"Lysobacter arenosi" JCM 34257 Proposed type strain
"Lysobacter solisilvae" JCM 34258 Proposed type strain
Marinifilum sp. JCM 18855
Marinifilum sp. JCM 18856
"Marinobacterium alkalitolerans" JCM 31159 Proposed type strain
"Massilia aromaticivorans" JCM 34089 Proposed type strain
Massilia sp. JCM 18563
"Microbacterium helvum" JCM 32661 Proposed type strain
"Micromonospora rubida" JCM 32386 Proposed type strain
Mucilaginibacter conchicola JCM 32787 Type strain
"Mycolicibacterium gossypii" JCM 34327 Proposed type strain
"Neobacillus paridis" JCM 34668 Proposed type strain
"Nocardia terrae" JCM 33776 Proposed type strain
Nocardioides luti JCM 33859 Type strain
Nonomuraea aurantiaca JCM 34799 Type strain
Nucisporomicrobium flavum JCM 33973 Type strain
Oxalicibacterium sp. JCM 18713
Oxalicibacterium sp. JCM 18714
"Paenibacillus albiflavus" JCM 33183 Proposed type strain
Paucibacter sp. JCM 18666
Phocaeicola faecicola JCM 35583 Type strain
"Phytoactinopolyspora limicola" JCM 33694 Proposed type strain
Polynucleobacter alcilacus JCM 32939 Type strain
Polynucleobacter arcticus JCM 32563 Type strain
Polynucleobacter bastaniensis JCM 32933 Type strain
Polynucleobacter brandtiae JCM 32562 Type strain
Polynucleobacter corsicus JCM 32935 Type strain
Polynucleobacter finlandensis JCM 32556 Type strain
Polynucleobacter hallstattensis JCM 32938 Type strain
Polynucleobacter ibericus JCM 32554 Type strain
Polynucleobacter kasalickyi JCM 32564 Type strain
Polynucleobacter nymphae JCM 32936 Type strain
Polynucleobacter paludilacus JCM 32557 Type strain
Polynucleobacter parvulilacunae JCM 32561 Type strain
Pseudoalteromonas sp. JCM 18481
"Pseudomonas eucalypticola" JCM 33572 Proposed type strain
"Pseudomonas laoshanensis" JCM 32580 Proposed type strain
"Pseudomonas nanhaiensis" JCM 34440 Proposed type strain
Pseudomonas sp. JCM 17745
Pseudomonas sp. JCM 18515
Pseudomonas sp. JCM 18794
Pseudomonas sp. JCM 18857
"Pseudoxanthomonas beigongshangi" JCM 33961 Proposed type strain
Pusillimonas faecipullorum JCM 34168 Type strain
Rheinheimera maricola JCM 34600 Type strain
"Rhizobium rhizolycopersici" JCM 34245 Proposed type strain
Rhodococcus oxybenzonivorans JCM 32046 Type strain
"Rhodocyclus gracilis" JCM 35354 Proposed type strain
Rodentibacter sp. JCM 18574
Rubrobacter xylanophilus JCM 33581
"Rufibacter radiotolerans" JCM 19446 Proposed type strain
Schumannella soli JCM 33146 Type strain
Shewanella oncorhynchi JCM 34183 Type strain
Sphingomonas sp. JCM 18310
"Stenotrophomonas sepilia" JCM 32102 Proposed type strain
"Streptococcus toyakuensis" JCM 34623 Proposed type strain
"Streptomyces cupreus" JCM 33752 Proposed type strain
Tissierella simiarum JCM 35585 Type strain
"Umezawaea beigongshangensis" JCM 33954 Proposed type strain
Urechidicola croceus JCM 31563 Type strain
Verrucomicrobium sp. JCM 18782
Verrucomicrobium sp. JCM 18783
"Xanthomonas sontii" JCM 33631 Proposed type strain
"Xanthomonas sontii" JCM 33632
"Xanthomonas sontii" JCM 33633
Xanthomonas sp. JCM 18748
"Xylanimonas oleitrophica" JCM 33795 Proposed type strain
Zeimonas arvi JCM 33506 Type strain
アーキア
Halomicrobium salinisoli JCM 30837 Type strain
Halomicrobium salinisoli JCM 30839
"Halorientalis litorea" JCM 34154 Proposed type strain
"Halorientalis marina" JCM 34481 Proposed type strain
"Halorientalis salina" JCM 34155 Proposed type strain
Haloterrigena alkaliphila JCM 34158 Type strain
Methanococcoides orientis JCM 39195 Type strain
"Methanofollis propanolicus" JCM 39176 Proposed type strain
"Natranaeroarchaeum aerophilus" JCM 32519 Proposed type strain
Natrinema amylolyticum JCM 30668 Type strain
Natrinema halophilum JCM 31181 Type strain
Natrinema salinisoli JCM 30832 Type strain
"Natronocalculus amylovorans" JCM 32475 Proposed type strain
Stygiolobus caldivivus JCM 34622 Type strain
真菌
Basidioascus magus JCM 39332 ex-holotype strain
Basidioascus undulatus JCM 39333 ex-epitype strain
Geminibasidium donianum JCM 39334 ex-holotype strain
Geminibasidium hirsutum JCM 39335 ex-holotype strain
Lipomyces starkeyi JCM 39235
Lipomyces starkeyi JCM 39236
Trichothecium ovalisporum JCM 35545 ex-holotype strain
Trichothecium ovalisporum JCM 35546
詳細は以下のサイトから検索できますのでご利用ください。
https://jcm.brc.riken.jp/ja/catalogue
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発行
理化学研究所 バイオリソース研究センター
微生物材料開発室 (JCM)
inquiry.jcm@riken.jp
https://jcm.brc.riken.jp/ja/
2022年9月7日
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