**********************************************************************
RIKEN BioResource Research Center - Japan Collection of Microorganisms
JCM Mail News （電子メール版） No. 116
**********************************************************************
理化学研究所 バイオリソース研究センター 微生物材料開発室（JCM）
が公開している微生物等の最新情報をお届けします。
━━━━ 目 次 ━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━
● 通常業務再開のお知らせ
● リソース紹介「共生細菌をもつ真菌株の紹介」
● 新規公開微生物株（2020年2月-2020年9月公開）
━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━
┏━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━
┃ 通常業務再開のお知らせ
┗━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━
利用者の皆様
理化学研究所バイオリソース研究センター（理研BRC）では、8月27日より職員
の出勤制限が解除され、バイオリソースの寄託・提供については通常業務に戻
りつつあります。これまでのバイオリソース業務の中断や制限により、利用者
の皆様に多大なご迷惑をおかけしました。ご理解いただきましたことに心より
お礼を申し上げます。業務は概ね順調に再開しておりますが、リソースにより
ましては寄託・提供業務の遅延状態を完全に解消するまでにはもうしばらくの
期間を要します。利用者の皆様には、何卒、ご理解とご寛容のほど、お願い申
し上げます。
寄託、提供の手続きに関しましては下記のページをご覧ください。
- バイオリソースの入手＞検索、注文から支払いまでの流れ
- 利用者の皆様へご協力のお願い＞バイオリソースの寄託／譲渡＞
リソースの寄託／譲渡に関するお問い合わせ窓口
最後に、皆様のご研究の益々のご発展をお祈り申し上げますとともに、当セン
ターのバイオリソースの活発なご利用をお願い申し上げます。
理化学研究所バイオリソース研究センター
┏━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━
┃ リソース紹介「共生細菌をもつ真菌株の紹介」
┗━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━
近年、真核生物である真菌で自身の細胞の中に原核生物の共生細菌
（バクテリア）を有する種の存在が明らかにされました。Mortierella
（クサレケカビ）やRhizopus（クモノスカビ）などのケカビ門真菌の細胞内に
内生するBetaproteobacteria綱に属する細菌はBurkholderiaceae-related
endofungal bacteria（BRE）と呼ばれています（文献1）。
茨城大学の研究グループでは、これまでにマツ目やブナ目の植物の根よりクサ
レケカビを分離し、多くのBREを検出しました。同グループの研究により、共
生細菌を単離・培養し、共生細菌のゲノム解読が進められています（文献2）。
こうした共生細菌保有菌株は、微生物共生体の相互作用の仕組みの解明を進め
るための活発な研究に結びつくことが期待されます。JCMでは茨城大学のグル
ープにより分離された共生細菌保有菌株64株を公開いたしました
（詳細は文献3を参照して下さい）。
ここではゲノム決定された共生細菌を保有する代表株を紹介致します。
Mortierella parvispora JCM 39028
文献
1．Bonfante and Desirò.
Who lives in a fungus? The diversity, origins and functions of fungal
endobacteria living in Mucoromycota.
The ISME Journal 11: 1727-1735. 2017.
DOI: 10.1038/ismej.2017.21.
2．Guo et al.
Mycoavidus sp. Strain B2-EB: Comparative genomics reveals minimal
genomic features required by a cultivable Burkholderiaceae-related
endofungal bacterium.
Applied Environmental Microbiology 86: e01018-20. 2020.
DOI: 10.1128/AEM.01018-20
3. 西澤智康. 糸状菌ー内生細菌の微生物間相互作用現象の解明.
IFO Research Communications 33: 7-22. 2019.
橋本陽（特別研究員）
┏━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━
┃ 新規公開微生物株（2020年2月-2020年9月公開）
┗━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━
細菌
Absicoccus porci JCM 32769 Type strain
Acetobacter aceti JCM 25003
Acetobacter aceti JCM 25004
Acetobacter aceti JCM 25005
Acetobacter ascendens JCM 25076 Type strain
Acetobacter nitrogenifigens JCM 33644 Type strain
Acetobacter oryzoeni JCM 33371 Type strain
Acetobacter pasteurianus JCM 25075
Acetobacter tropicalis JCM 25084
"Acidibacillus ferrooxidans" JCM 31945
"Acidibacillus sulfuroxidans" JCM 31946
Acidithiobacillus ferrianus JCM 33084 Type strain
Acidovorax sp. JCM 17028
Acinetobacter sp. JCM 17134
Acinetobacter sp. JCM 17135
Actinomadura harenae JCM 32659 Type strain
"Actinomadura physcomitrii" JCM 33455 Proposed type strain
Actinomyces wuliandei JCM 33611 Type strain
"Aeromicrobium endophyticum" JCM 33141 Proposed type strain
Aeromicrobium yanjiei JCM 33790 Type strain
Aestuariirhabdus litorea JCM 32043 Type strain
Akkermansia muciniphila JCM 33894 Type strain
Algoriphagus aquimaris JCM 33187 Type strain
Alistipes communis JCM 32851
Alistipes onderdonkii subsp. vulgaris JCM 32840
Alistipes onderdonkii subsp. vulgaris JCM 32841
Alistipes onderdonkii subsp. vulgaris JCM 32842
Alistipes onderdonkii subsp. vulgaris JCM 32843
Alistipes onderdonkii subsp. vulgaris JCM 32844
Alistipes onderdonkii subsp. vulgaris JCM 32845
Alistipes onderdonkii subsp. vulgaris JCM 32846
Alistipes onderdonkii subsp. vulgaris JCM 32847
Alistipes onderdonkii subsp. vulgaris JCM 32849
Allorhizobium terrae JCM 31228 Type strain
Alteromonas portus JCM 32687 Type strain
Alteromonas profundi JCM 33893 Type strain
Alteromonas sp. JCM 32647
Amedibacterium intestinale JCM 33779
Amedibacterium intestinale JCM 33780
Amedibacterium intestinale JCM 33781
Amycolatopsis nivea JCM 30652 Type strain
Antarcticibacterium arcticum JCM 33514 Type strain
Apibacter raozihei JCM 33423 Type strain
Arenimonas terrae JCM 33216 Type strain
Auraticoccus cholistanensis JCM 33648 Type strain
Bacillus caeni JCM 33411 Type strain
Bacillus cereus JCM 33474
Bacillus natronophilus JCM 32118 Type strain
Bacillus sp. JCM 32642
Bacillus taxi JCM 33117 Type strain
"Bacillus yapensis" JCM 33181 Proposed type strain
Bacteroides faecalis JCM 34008 Type strain
"Bacteroides sedimenti" JCM 34007 Proposed type strain
Balneicella halophila JCM 19909 Type strain
Blastococcus sp. JCM 18931
Blastococcus sp. JCM 18932
Blastococcus sp. JCM 18933
Bordetella hinzii JCM 16709
Bordetella hinzii JCM 16710
Caldithermus roseus JCM 30647 Type strain
Caldithermus roseus JCM 30648
Capnocytophaga felis JCM 32681 Type strain
Caproicibacter fermentans JCM 33110 Type strain
Carideicomes alvinocaridis JCM 33426 Type strain
Catellatospora sichuanensis JCM 32394 Type strain
Chryseobacterium mulctrae JCM 33443 Type strain
Chryseobacterium sp. JCM 17078
Chryseotalea sanaruensis JCM 30318 Type strain
"Cohnella candidum" JCM 33199 Proposed type strain
Cohnella fermenti JCM 32834 Type strain
Cryobacterium soli JCM 32391 Type strain
Cytobacillus horneckiae JCM 18375
"Desulfobacterium catecholicum" JCM 39068 Proposed type strain
"Desulfobacterium oleovorans" JCM 39069
Desulfobotulus mexicanus JCM 32146 Type strain
Desulfocella sp. JCM 39067
Desulfofundulus australicus JCM 34022 Type strain
Devosia indica JCM 32636 Type strain
Dickeya oryzae JCM 33020 Type strain
Enterobacter quasihormaechei JCM 33345 Type strain
Enterobacter wuhouensis JCM 33346 Type strain
Erythrobacter sp. JCM 16849
Escherichia coli JCM 31464
Flammeovirga pectinis JCM 33169 Type strain
"Flavisolibacter galbus" JCM 33203 Proposed type strain
"Flavobacterium jocheonensis" JCM 31512 Proposed type strain
"Flavobacterium sangjuense" JCM 32764 Proposed type strain
Flavobacterium sp. JCM 17067
Fluviispira multicolorata JCM 32978 Type strain
Fructilactobacillus ixorae JCM 32627 Type strain
"Gelidibacter japonicus" JCM 31967 Proposed type strain
Geobacillus sp. JCM 30829
Geobacillus thermodenitrificans JCM 32406
"Geomonas oryzae" JCM 33030 Proposed type strain
"Glaciimonas soli" JCM 32375 Proposed type strain
Glycocaulis profundi JCM 33028 Type strain
Glycomyces albidus JCM 33458 Type strain
Glycomyces buryatensis JCM 33362 Type strain
Gordonia insulae JCM 33277 Type strain
Haemophilus influenzae JCM 33542 Type strain
"Halobacillus marinus" JCM 30443 Proposed type strain
Herbidospora galbida JCM 33459 Type strain
Hwanghaeella grinnelliae JCM 32943 Type strain
Hydrogeniiclostidium mannosilyticum JCM 33295 Type strain
Hylemonella gracilis JCM 17030
Hylemonella gracilis JCM 17031
Hylemonella gracilis JCM 17032
Hylemonella gracilis JCM 17036
"Hymenobacter jejuensis" JCM 33186 Proposed type strain
Jeotgalibaca ciconiae JCM 33222 Type strain
Jiangella aurantiaca JCM 33519 Type strain
Jiangella ureilytica JCM 33520 Type strain
Klebsiella indica JCM 33718 Type strain
Klebsiella pneumoniae JCM 31465
Komagataeibacter saccharivorans JCM 25122
"Labrenzia callyspongiae" JCM 31309 Proposed type strain
"Lachnoanaerobaculum gingivalis" JCM 33452 Proposed type strain
Lacisediminimonas profundi JCM 32676 Type strain
Lacticaseibacillus daqingensis JCM 33273 Type strain
Lacticaseibacillus suibinensis JCM 33275 Type strain
Lacticaseibacillus yichunensis JCM 33272 Type strain
Lactobacillus buchneri subsp. silagei JCM 32599 Type strain
Lactobacillus zhaodongensis JCM 33865 Type strain
Lactococcus reticulitermitis JCM 32568
Lapidilactobacillus mulanensis JCM 33274 Type strain
Lapidilactobacillus wuchangensis JCM 33271 Type strain
Levilactobacillus suantsaii JCM 34120 Type strain
Lichenihabitans psoromatis JCM 33310
Lichenihabitans psoromatis JCM 33311 Type strain
Luteimonas yindakuii JCM 33487 Type strain
Lysinimonas yzui JCM 32630 Type strain
Lysobacter caseinilyticus JCM 32879 Type strain
Lysobacter lacus JCM 30983 Type strain
Lysobacter segetis JCM 33058 Type strain
Lysobacter terrigena JCM 33057 Type strain
Maribacter algicola JCM 32941 Type strain
"Marinitoga lauensis" JCM 32613
Marinobacter salinexigens JCM 33013 Type strain
Marinobacter sp. JCM 10458
Massilia arenae JCM 32744 Type strain
"Mesorhizobium composti" JCM 31762 Proposed type strain
Microbacterium sp. JCM 18357
Microbacterium wangchenii JCM 33494 Type strain
Microbispora catharanthi JCM 30045 Type strain
Microbulbifer harenosus JCM 32688 Type strain
Micromonospora deserti JCM 32583 Type strain
Mucilaginibacter agri JCM 33472 Type strain
Mucilaginibacter humi JCM 33916 Type strain
Mucilaginibacter sp. JCM 17083
Mucilaginibacter sp. JCM 17086
"Mucilaginibacter terrigena" JCM 33049 Proposed type strain
Muricauda alvinocaridis JCM 33425 Type strain
Mycobacterium avium JCM 34066
Mycobacterium avium JCM 34067
Mycobacterium avium JCM 34068
Mycobacterium avium JCM 34069
Mycobacterium avium JCM 34070
Mycobacterium avium JCM 34071
Mycobacterium avium JCM 34072
Mycobacterium avium JCM 34073
Mycobacterium avium JCM 34074
Nitrincola tapanii JCM 31570 Type strain
Nocardia stercoris JCM 32663 Type strain
Nocardioides dongxiaopingii JCM 33469 Type strain
Nocardioides eburneiflavus JCM 32833 Type strain
Nocardioides euryhalodurans JCM 32831 Type strain
Nocardioides guangzhouensis JCM 33269 Type strain
"Nocardioides jejuensis" JCM 33182 Proposed type strain
Nocardioides jishulii JCM 33496 Type strain
Nocardioides seonyuensis JCM 32832 Type strain
Nocardioides vastitatis JCM 33365 Type strain
Nonlabens sp. JCM 17108
Nonomuraea mesophila JCM 32916 Type strain
Nonomuraea typhae JCM 33461 Type strain
Novosphingobium rosa JCM 21080 Type strain
"Oenococcus sicerae" JCM 33895 Proposed type strain
Olsenella faecalis JCM 34009 Type strain
"Paenibacillus albilobatus" JCM 32395 Proposed type strain
"Paenibacillus albus" JCM 33184 Proposed type strain
"Paenibacillus lutimineralis" JCM 32684 Proposed type strain
Paenibacillus solisilvae JCM 32513 Type strain
Paraburkholderia flava JCM 33640 Type strain
Paracoccus aurantiacus JCM 33630 Type strain
Paracoccus tegillarcae JCM 33289 Type strain
Paraconexibacter algicola JCM 31881 Type strain
Pedobacter sp. JCM 17087
Pedobacter sp. JCM 17088
Pedobacter sp. JCM 17089
Pedobacter sp. JCM 17090
Pelagicola marinus JCM 33637 Type strain
Phytoactinopolyspora mesophila JCM 33740 Type strain
Pilibacter termitis JCM 32571
Pilibacter termitis JCM 32572
"Planococcus antioxidans" JCM 32826
"Planococcus lenghuensis" JCM 32719 Proposed type strain
Pontibacter mangrovei JCM 33333 Type strain
Pontibacter oryzae JCM 32880 Type strain
Prevotella hominis JCM 33280 Type strain
"Prevotella koreensis" JCM 33298 Proposed type strain
Pseudomonas aeruginosa JCM 17284
Pseudomonas aeruginosa JCM 31466
Pseudomonas citronellolis JCM 33429
Pseudomonas izuensis JCM 33655 Type strain
Pseudomonas neustonica JCM 31284 Type strain
Pseudomonas neustonica JCM 31285
Pseudomonas rhizoryzae JCM 33201 Type strain
Pseudomonas sp. JCM 17029
Pseudomonas yangonensis JCM 33396 Type strain
Psychrobacillus sp. JCM 32643
Puteibacter caeruleilacunae JCM 33128 Type strain
Rectinema subterraneum JCM 32656 Type strain
Rheinheimera sp. JCM 32650
Rhodoferax aquaticus JCM 19166 Type strain
Rhodopirellula sp. JCM 17608
Rhodopirellula sp. JCM 17609
Rhodopirellula sp. JCM 17610
Rhodopirellula sp. JCM 17611
Rhodopirellula sp. JCM 17612
Rhodopirellula sp. JCM 17615
Rhodopirellula sp. JCM 17616
Rhodopirellula sp. JCM 17617
Rhodopirellula sp. JCM 17618
Rhodopirellula sp. JCM 17619
Rhodopirellula sp. JCM 17620
Rhodopirellula sp. JCM 17621
Rhodopirellula sp. JCM 17623
Rhodopirellula sp. JCM 17625
Rhodothermus marinus JCM 33045
Rhodothermus marinus JCM 33046
Saccharopolyspora coralli JCM 31844 Type strain
"Salicibibacter halophilus" JCM 33437 Proposed type strain
Salimicrobium salexigens JCM 16415
Segnochrobactrum spirostomi JCM 32162 Type strain
Serratia marcescens JCM 17283
Shewanella maritima JCM 33294 Type strain
Shewanella sp. JCM 17276
Silvanigrella paludirubra JCM 32975 Type strain
Sphingomonas edaphi JCM 32377 Type strain
Sphingomonas sp. JCM 17075
Sphingorhabdus lutea JCM 31568 Type strain
Staphylococcus aureus JCM 31453
Staphylococcus epidermidis JCM 33475
"Streptococcus chosunense" JCM 33453 Proposed type strain
"Streptococcus koreensis" JCM 33454 Proposed type strain
Streptomyces aquilus JCM 33584 Type strain
Streptomyces bauhiniae JCM 33208 Type strain
Streptomyces mimosae JCM 33328 Type strain
Streptomyces paludis JCM 33019 Type strain
Streptomyces qinzhouensis JCM 33585 Type strain
"Sutterella faecalis" JCM 34010 Proposed type strain
Tabrizicola piscis JCM 33230 Type strain
"Tellurirhabdus rosea" JCM 32361 Proposed type strain
Tessaracoccus antarcticus JCM 33126 Type strain
Thermaurantimonas aggregans JCM 31826 Type strain
Thermus thermophilus JCM 33999
Trinickia soli JCM 16392 Type strain
Tsukamurella asaccharolytica JCM 33388 Type strain
Tsukamurella conjunctivitidis JCM 33389 Type strain
Tsukamurella sputi JCM 33387 Type strain
"Uab amorphum" JCM 39082
Unidentified bacterium JCM 32665
Vagococcus xieshaowenii JCM 33477 Type strain
Vibrio aquaticus JCM 32691 Type strain
"Vibrio chemaguriensis" JCM 33348 Proposed type strain
Vibrio ouci JCM 32690 Type strain
Vibrio sinensis JCM 32692 Type strain
Vibrio sp. JCM 17072
Vibrio viridaestus JCM 32693 Type strain
Xylella taiwanensis JCM 31186
アーキア
Ferroplasma acidiphilum JCM 30201
"Halarchaeum nitratireducens" JCM 19589
Halarchaeum salinum JCM 19590
Halarchaeum salinum JCM 19591
Haloarcula sp. JCM 30956
Halobacterium bonnevillei JCM 32472 Type strain
Halobaculum saliterrae JCM 32473 Type strain
"Haloglomus irregulare" JCM 33318 Proposed type strain
"Halorussus halophilus" JCM 30239 Proposed type strain
Halostella litorea JCM 32955 Type strain
Halostella pelagica JCM 32954 Type strain
Halostella pelagica JCM 32956
Halovenus carboxidivorans JCM 32474 Type strain
Natrialba swarupiae JCM 33002 Type strain
"Natrinema thermophila" JCM 30478 Proposed type strain
Salinibaculum litoreum JCM 31107 Type strain
Salinigranum halophilum JCM 30238 Type strain
Salinigranum halophilum JCM 30240
Salinigranum halophilum JCM 33557
Saliphagus infecundisoli JCM 17436 Type strain
Sulfuracidifex tepidarius JCM 16834
"Thermococcus indicus" JCM 39077 Proposed type strain
真菌
Acrogenospora altissima JCM 15435
Aspergillus brasiliensis JCM 39130
Aspergillus coremiiformis JCM 39131 ex-type strain
Aspergillus kawachii JCM 39133 ex-type strain
Aspergillus luchuensis JCM 39132 ex-type strain
Aspergillus nidulans JCM 19073
Aspergillus nidulans JCM 19074
Aspergillus parasiticus JCM 39129
Aspergillus terreus JCM 33989
Aspergillus westerdijkiae JCM 39128 ex-type strain
Bactrodesmium microleucurum JCM 15433
Canalisporium exiguum JCM 15434
Coprinopsis cinerea JCM 19078
Kazachstania bovina JCM 3916
Leptobacillium leptobactrum JCM 39056
Mrakia hoshinonis JCM 32575 Type strain
Mrakia hoshinonis JCM 32576
Mrakia hoshinonis JCM 32577
Mrakia hoshinonis JCM 32578
Neurospora crassa JCM 19068
Neurospora crassa JCM 19070
Neurospora crassa JCM 19071
Neurospora crassa JCM 19072
Pestalotiopsis maculiformans JCM 15437
Rhodotorula sphaerocarpa JCM 32652
Saitozyma podzolica JCM 32653
Simplicillium spumae JCM 39050
Simplicillium spumae JCM 39051 ex-holotype strain
Simplicillium spumae JCM 39054
Simplicillium subtropicum JCM 39052
Simplicillium subtropicum JCM 39053
Spadicoides bambusicola JCM 15436
Vishniacozyma ellesmerensis JCM 32573 Type strain
Vishniacozyma ellesmerensis JCM 32574
詳細は以下のサイトから検索できますのでご利用ください。
https://jcm.brc.riken.jp/ja/catalogue
------------------------
※ メールでの情報提供受信を中止されたい場合は、微生物材料開発室
(inquiry.jcm@riken.jp)まで「メールニュース不要」の旨をご連絡ください。
※ 当メールへのご質問などは、微生物材料開発室(inquiry.jcm@riken.jp)
までお送りください。
※ 当メールニュース受信者各位機関のサーバーメンテナンス等によりメール
ニュースをお届けできない場合でも、メールニュースの再発行は行いません。
発行済みのメールニュースは当開発室のWebサイトで公開しておりますので
そちらをご覧ください。
https://jcm.brc.riken.jp/ja/mailnews
※ 本メールに記載された内容は予告することなく変更することがあります。
※ 本メールに掲載された記事を許可なく複製・転載することを禁止します。
_____________________________________________
発行
理化学研究所 バイオリソース研究センター
微生物材料開発室 (JCM)
inquiry.jcm@riken.jp
https://jcm.brc.riken.jp/ja/
2020年10月29日
_____________________________________________
