オンラインカタログ

 学名検索1
 属名:
 種名:
    例1: 属名 = Micromonospora
例2: 種名 = aurantiaca
例3: 属名 = %monospo, 種名 = %ensis
(前方一致検索。ワイルドカード「%」を使って中間または後方一致検索も可能。大文字・小文字は区別されません)

 学名検索2
   学名:
    例1: 学名 = Micromonospora chalcea
例2: 学名 = Lactobacillus paracasei subsp. paracasei
(前方一致検索。ワイルドカード「%」を使って中間または後方一致検索も可能。大文字・小文字は区別されません)

 JCM番号検索
   JCM番号:
    例: JCM = 12345 (完全一致検索)

 他保存機関番号検索
 機関名略称:
 番号:
    例1: 機関名略称 = DSM, 番号 = 43067
例2: 機関名略称 = VKM, 番号 = Ac-636
(完全一致検索。大文字・小文字は区別されます)

 菌株データ検索
   キーワード:
    例: キーワード = toluene
(部分一致検索。大文字・小文字は区別されません)

 培地検索
 JCM培地番号:
 培地名:
    例1: JCM培地番号 = 58
例2: 培地名 = malt extract
(JCM培地番号は完全一致検索、培地名は部分一致検索。大文字・小文字は区別されません)

JCM Mail News No. 110


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RIKEN BioResource Research Center - Japan Collection of Microorganisms
                JCM Mail News (電子メール版) No. 110
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    理化学研究所 バイオリソース研究センター 微生物材料開発室(JCM)
    が公開している微生物等の最新情報をお届けします。

━━━━  目  次  ━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━
 ● 新センター長就任のお知らせ
 ● 寄託・譲渡および提供の申込書類についてのお願い
 ● バイオセーフティーレベル2の設備で取り扱うべき微生物株の
   発送経費ご負担のお願い
 ● 今月のリソース紹介「ブナ科樹木の根の内生菌Glutinomyces属菌」
 ● 新規公開微生物株(2018年9月-2019年3月公開)
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┃  新センター長就任のお知らせ
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 2019年4月1日付で、バイオリソース研究センター長として、城石俊彦が
就任しましたので、お知らせいたします。

https://ja.brc.riken.jp/news/press_20190401_01.html

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┃  寄託・譲渡および提供の申込書類についてのお願い
┗━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━
 微生物株の寄託・譲渡および提供の申込書類の一部が更新されました。今後
のご依頼については、下記より最新版の書式をダウンロードしてお使いいただ
きますようお願いいたします。

寄託・譲渡申し込み書類
https://jcm.brc.riken.jp/ja/depositing#documents

提供申し込み書類
https://jcm.brc.riken.jp/ja/ordering#documents

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┃  バイオセーフティーレベル2の設備で取り扱うべき微生物株の
┃  発送経費ご負担のお願い
┗━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━
 当室のバイオセーフティーレベル2の設備で取り扱うべき微生物株の輸送は、
安全性の確保のために、感染性物質として必要な包装を行なっています。日本
郵便株式会社(旧:郵便事業株式会社)における、検体を送付する場合の包装
に関する遵守事項(※)に従って、これらの微生物株の発送にジュラルミンケ
ース等の特別包装が求められています。
 これを受けて、2019年1月より、バイオセーフティーレベル2の設備で取り扱
うべき微生物株の提供については、提供手数料に加えて、別途、特別包装とそ
の運搬等にかかる経費2,000円(税込)を発送ごとに追加のご負担をお願いい
たします。
 ご理解をいただけますよう、何卒よろしくお願いいたします。

※ 参考URL:
https://www.mhlw.go.jp/file/06-Seisakujouhou-10900000-Kenkoukyoku/2_7_13.pdf

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┃  今月のリソース紹介「ブナ科樹木の根の内生菌Glutinomyces属菌」
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 中村慎崇博士 (京大・農;現 森林総研) がシイやコナラなどのブナ科樹木
の根より分離し、同博士により提唱された子嚢菌門ビョウタケ目の新属
Glutinomycesに属す4新種12株 (タイプ由来株を含む) および関連する未同定
菌 (Unidentified fungus) 8株を公開しました (詳細はJCMオンラインカタロ
グを参照):
Glutinomyces brunneus JCM 32230 (ex-holotype、属の基準種、文献1) ~ 32232.
Glutinomyces inflatus JCM 32227 (ex-holotype、文献2) ~ 32229.
Glutinomyces takaragaikensis JCM 32245 (ex-holotype、文献2), 32246.
Glutinomyces vulgaris JCM 32233 (ex-holotype、文献2) ~ 32236.
Unidentified fungus JCM 32237 ~ 32244 (文献2).

 これらの菌群については今までほとんど知られていませんでしたが、中村博
士らの調査によりブナ科樹木の根には多くのビョウタケ目内生菌の未記載種が
存在することが分かり、分類/系統 (同定・新分類群の提唱・種の多様性解析)
や生態 (植物種と菌種の関係/分布・分散様式・集団間の遺伝子分化/流動)な
どについて活発な研究が始まりました (文献1, 2)。

文献
1. Crous et al. 2017. Fungal Planet description sheets: 625-715.
   Persoonia 39: 270-467. DOI: 10.3767/persoonia.2017.39.11.
2. Nakamura et al. 2018. Detection of a root-associated group of
   Hyaloscyphaceae (Helotiales) species that commonly colonizes
   Fagaceae roots and description of three new species in genus
   Glutinomyces. Mycoscience 59: 397-408.
   DOI: 10.1016/j.myc.2018.02.010.

岡田 元 (糸状菌担当)


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┃  新規公開微生物株(2018年9月-2019年3月公開)
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細菌
Abyssibacter profundi                  JCM 32025  Type strain
"Acetobacter oryzifermentans"          JCM 31096  Proposed type strain
Achromobacter sp.                      JCM 15663
Acinetobacter sp.                      JCM 15664
Acinetobacter sp.                      JCM 15665
Acinetobacter sp.                      JCM 16098
Acinetobacter sp.                      JCM 16099
Actinoplanes deserti                   JCM 30626  Type strain
Actinoplanes rhizophilus               JCM 33034  Type strain
Ahniella affigens                      JCM 31634  Type strain
Alcanivorax profundi                   JCM 31866  Type strain
Alcanivorax sp.                        JCM 16045
Algoriphagus sp.                       JCM 16080
Algoriphagus sp.                       JCM 16111
Alistipes ihumii                       JCM 32776  Type strain
Alistipes inops                        JCM 32777  Type strain
"Alistipes obesi"                      JCM 32778  Proposed type strain
"Alistipes senegalensis"               JCM 32779  Proposed type strain
Alistipes timonensis                   JCM 32780  Type strain
Alsobacter soli                        JCM 32501  Type strain
Alteromonas indica                     JCM 32638  Type strain
Arenimonas caeni                       JCM 32091  Type strain
Asaia sp.                              JCM 15830
Asaia sp.                              JCM 15832
Asaia sp.                              JCM 15833
Bacillus shivajii                      JCM 32183  Type strain
Blastococcus litoris                   JCM 32354  Type strain
Blautia argi                           JCM 31394  Type strain
Bosea sp.                              JCM 28685
Bosea sp.                              JCM 28691
Bosea sp.                              JCM 28714
Bosea sp.                              JCM 28717
Bosea sp.                              JCM 28725
Brachybacterium avium                  JCM 32143  Type strain
Brachybacterium vulturis               JCM 32142  Type strain
Brevibacterium hankyongi               JCM 30949  Type strain
Campylobacter jejuni subsp. jejuni     JCM 32890  Type strain
Castellaniella sp.                     JCM 16238
Castellaniella sp.                     JCM 16239
"Cellulomonas rhizosphaerae"           JCM 32383
Chryseobacterium sp.                   JCM 18517
Chryseobacterium sp.                   JCM 28258
Chryseobacterium sp.                   JCM 28269
Chryseobacterium sp.                   JCM 28306
Chryseobacterium sp.                   JCM 28637
Chryseolinea flava                     JCM 32520  Type strain
Clostridium bovifacis                  JCM 32382  Type strain
Clostridium composti                   JCM 32793  Type strain
Cnuibacter physcomitrellae             JCM 33035  Type strain
Cutibacterium acnes subsp. acnes       JCM 33133
Cutibacterium acnes subsp. acnes       JCM 33134
Cutibacterium acnes subsp. acnes       JCM 33135
Cutibacterium acnes subsp. defendens   JCM 33136
"Deinococcus rubrus"                   JCM 31436  Proposed type strain
"Deinococcus rubrus"                   JCM 31437
"Desulfosporomusa polytropa"           JCM 32836  Proposed type strain
Devosia sp.                            JCM 28284
Devosia sp.                            JCM 28289
Devosia sp.                            JCM 28299
Devosia sp.                            JCM 28713
Devosia sp.                            JCM 28722
Domibacillus epiphyticus               JCM 32632  Type strain
Domibacillus mangrovi                  JCM 32631  Type strain
"Dongshaea marina"                     JCM 32096  Proposed type strain
Egicoccus halophilus                   JCM 33036  Type strain
Emcibacter congregatus                 JCM 32378  Type strain
"Ensifer collicola"                    JCM 31049  Proposed type strain
Eubacterium maltosivorans              JCM 32297  Type strain
Ewingella americana                    JCM 32812  Type strain
Flagellimonas aquimarina               JCM 32292  Type strain
Flavobacterium sediminis               JCM 32291  Type strain
Gelidibacter flavus                    JCM 31135  Type strain
Geobacillus yumthangensis              JCM 32596  Type strain
Georgenia deserti                      JCM 33037  Type strain
Glaciihabitans sp.                     JCM 19869
Gramella salexigens                    JCM 31560  Type strain
Hymenobacter agri                      JCM 32194  Type strain
Hymenobacter jeollabukensis            JCM 32192  Type strain
Hymenobacter rufus                     JCM 32196  Type strain
Hymenobacter segetis                   JCM 32197  Type strain
Hymenobacter terrigena                 JCM 32195  Type strain
Hyphobacterium indicum                 JCM 32612  Type strain
Jishengella zingiberis                 JCM 32592  Type strain
Kaistia algarum                        JCM 31803  Type strain
Kitasatospora sp.                      JCM 32302
Klebsiella huaxiensis                  JCM 32905  Type strain
Komagataeibacter cocois                JCM 31140  Type strain
Lactobacillus terrae                   JCM 32269  Type strain
Lactococcus termiticola                JCM 32569  Type strain
Lentzea guizhouensis                   JCM 33038  Type strain
Lentzea terrae                         JCM 32385  Type strain
Libanicoccus massiliensis              JCM 33000  Type strain
Listeria grayi                         JCM 32813  Type strain
Listeria innocua                       JCM 32814  Type strain
Listeria ivanovii subsp. londoniensis  JCM 32891  Type strain
Listeria seeligeri                     JCM 32815  Type strain
Listeria welshimeri                    JCM 32816  Type strain
Litorivita pollutaquae                 JCM 32715  Type strain
Longicatena caecimuris                 JCM 32781  Type strain
Luteimonas sp.                         JCM 16241
Maribacter litoralis                   JCM 32373  Type strain
Maribacter sp.                         JCM 31510
Marinifilum breve                      JCM 32401  Type strain
Marinobacter sp.                       JCM 15897
Marinobacterium boryeongense           JCM 31902  Type strain
Mesorhizobium sp.                      JCM 28279
Mesorhizobium sp.                      JCM 28715
Mesosutterella multiformis             JCM 32465
Mesosutterella multiformis             JCM 32466
Mesosutterella multiformis             JCM 32467
Methylobacterium currus                JCM 32670  Type strain
"Methylocucumis oryzae"                JCM 32869  Proposed type strain
Methylopila sp.                        JCM 28718
Micromonospora aurantiaca              JCM 12831
"Micromonospora azadirachtae"          JCM 32148  Proposed type strain
Micromonospora chalcea                 JCM 12832
Micromonospora costi                   JCM 32901  Type strain
Micromonospora globbae                 JCM 32902  Type strain
Micromonospora humi                    JCM 12765
Micromonospora mangrovi                JCM 33231  Type strain
Micromonospora narathiwatensis         JCM 12764
Micromonospora siamensis               JCM 12768
Mycobacteroides chelonae               JCM 32454
Neisseria sp.                          JCM 16337
Neptuniibacter sp.                     JCM 15932
Nocardia mangyaensis                   JCM 32795  Type strain
Nocardioides currus                    JCM 32672  Type strain
Nocardioides deserti                   JCM 33040  Type strain
Nonlabens sp.                          JCM 16081
Nonomuraea guangzhouensis              JCM 33041  Type strain
Nonomuraea harbinensis                 JCM 33042  Type strain
Nonomuraea lactucae                    JCM 32549  Type strain
Novosphingobium sp.                    JCM 28633
Novosphingobium sp.                    JCM 28639
Oceanimonas marisflavi                 JCM 32358  Type strain
Pacifimonas sp.                        JCM 16310
Paenibacillus aurantiacus              JCM 32623  Type strain
"Paenibacillus panacihumi"             JCM 32073  Proposed type strain
Paenibacillus sp.                      JCM 32208
Paludirhabdus pumila                   JCM 31957  Type strain
Paludirhabdus telluriireducens         JCM 31958  Type strain
Pandoraea sp.                          JCM 15666
Pandoraea sp.                          JCM 15667
Pandoraea sp.                          JCM 15668
Pedobacter sp.                         JCM 16319
"Pedobacter sp."                       JCM 16320
Pedobacter sp.                         JCM 16321
Pedobacter sp.                         JCM 16322
Pedobacter sp.                         JCM 16323
Pedobacter sp.                         JCM 16324
Pedobacter sp.                         JCM 16325
Pedobacter sp.                         JCM 16326
Phreatobacter cathodiphilus            JCM 31612  Type strain
Pleomorphochaeta naphthae              JCM 31871  Type strain
Prauserella aidingensis                JCM 33234  Type strain
Prauserella endophytica                JCM 33043  Type strain
Prauserella flava                      JCM 33233  Type strain
Prauserella salsuginis                 JCM 33232  Type strain
Prauserella sediminis                  JCM 33235  Type strain
Pseudomonas laurentiana                JCM 32154  Type strain
Pseudomonas pharmafabricae             JCM 31306  Type strain
Pseudomonas pohangensis                JCM 16393  Type strain
Pseudomonas sichuanensis               JCM 32906  Type strain
Pseudomonas sp.                        JCM 16342
Pseudomonas umsongensis                JCM 16394  Type strain
"Pseudonocardia tritici"               JCM 32388
Pseudopropionibacterium rubrum         JCM 31317  Type strain
Pseudosporangium sp.                   JCM 14711
Rarobacter sp.                         JCM 6860 
Rarobacter sp.                         JCM 9465 
Rarobacter sp.                         JCM 9467 
Rarobacter sp.                         JCM 9468 
Rarobacter sp.                         JCM 9469 
Rhizobium sp.                          JCM 28263
Rhizobium sp.                          JCM 28634
Rhizobium sp.                          JCM 28644
Rhizobium sp.                          JCM 28648
Rhizobium sp.                          JCM 28653
Rhizobium sp.                          JCM 28659
Rhizobium sp.                          JCM 28672
"Roseithermus saccariphilus"           JCM 32374  Proposed type strain
Roseomonas aeriglobus                  JCM 32049  Type strain
Roseomonas sp.                         JCM 28683
Saccharopolyspora subtropica           JCM 33044  Type strain
Salibacterium nitratireducens          JCM 32187  Type strain
Salinimicrobium sp.                    JCM 16150
Salinimicrobium sp.                    JCM 16308
Saliniramus fredricksonii              JCM 31876  Type strain
Salmonella enterica subsp. enterica    JCM 32817  Type strain
"Sedimentisphaera cyanobacteriorum"    JCM 19196  Proposed type strain
"Sedimentisphaera salicampi"           JCM 31928
"Sedimentisphaera salicampi"           JCM 31929  Proposed type strain
Shewanella baltica                     JCM 16449  Type strain
Shewanella litoralis                   JCM 32306  Type strain
Shewanella saliphila                   JCM 32304  Type strain
Shewanella ulleungensis                JCM 32305  Type strain
Solimonas fluminis                     JCM 32268  Type strain
Solitalea longa                        JCM 32259  Type strain
Sphaerisporangium rhizosphaerae        JCM 32389  Type strain
Sphingobium sp.                        JCM 28248
Sphingobium sp.                        JCM 28632
Sphingobium sp.                        JCM 28641
Sphingobium sp.                        JCM 28642
Sphingobium sp.                        JCM 28719
Sphingopyxis macrogoltabida            JCM 15108
Sphingopyxis macrogoltabida            JCM 15109
Sphingopyxis sp.                       JCM 28280
Sphingopyxis sp.                       JCM 28290
Sphingorhabdus buctiana                JCM 30114  Type strain
"Spirillospora tritici"                JCM 32390  Proposed type strain
Spirosoma agri                         JCM 32199  Type strain
Spirosoma jeollabukense                JCM 32129  Type strain
Spirosoma terrae                       JCM 31994  Type strain
Streptacidiphilus pinicola             JCM 32300  Type strain
"Streptomyces tunisialbus"             JCM 32165  Proposed type strain
Streptomyces venetus                   JCM 31290  Type strain
Streptomyces venetus                   JCM 31291
"Sulfitobacter pontiacus subsp.        JCM 31094
 fungiae"
Sutterella megalosphaeroides           JCM 32468
Sutterella megalosphaeroides           JCM 32469
Sutterella megalosphaeroides           JCM 32471
Thaumasiovibrio sp.                    JCM 16053
Thermocatellispora soli                JCM 32587  Type strain
"Thermus tenuipuniceus"                JCM 30350  Proposed type strain
"Thiocapsa subramanianensis"           JCM 14886
Unidentified actinobacterium           JCM 14967
Variovorax boronicumulans              JCM 18805  Type strain
Vibrio parahaemolyticus                JCM 32818  Type strain
Winogradskyella aurantiaca             JCM 31383  Type strain
Winogradskyella sp.                    JCM 16151
Winogradskyella sp.                    JCM 16309
Xanthomonas sp.                        JCM 16245
Xanthomonas sp.                        JCM 16246
Yokenella regensburgei                 JCM 16257
Zhengella mangrovi                     JCM 32107  Type strain
Zhongshania marina                     JCM 17372  Type strain
Zobellella sp.                         JCM 14965

アーキア
"Halalkaliarchaeum desulfuricum"       JCM 30664
Haloarcula sebkhae                     JCM 19018  Type strain
"Haloprofundus halophilus"             JCM 30670  Proposed type strain
Halorussus litoreus                    JCM 31109  Type strain
"Natronobiforma cellulositropha"       JCM 31939  Proposed type strain
"Natronolimnobius sulfurreducens"      JCM 17580
"Natronolimnobius sulfurreducens"      JCM 30663
Nitrosarchaeum koreense                JCM 31640  Type strain
"Zestosphaera tikiterensis"            JCM 32895  Proposed type strain

真菌
Byssochlamys fulva                     JCM 12787  ex-neotype strain
Collapsimycopappus styracis            JCM 32503
Collapsimycopappus styracis            JCM 32504  ex-holotype strain
Collapsimycopappus styracis            JCM 32505
Collapsimycopappus styracis            JCM 32506
Collapsimycopappus styracis            JCM 32507
Collapsimycopappus styracis            JCM 32508
Crassiclypeus aquaticus                JCM 13087  ex-holotype strain
Crassiperidium octosporum              JCM 17827  ex-holotype strain
Crassiperidium quadrisporum            JCM 32442  ex-holotype strain
Cystobasidium iriomotense              JCM 24574
Cystobasidium iriomotense              JCM 24575
Cystobasidium iriomotense              JCM 24594  Type strain
Diaporthe oculi                        JCM 32617  ex-holotype strain
Diaporthe pseudooculi                  JCM 32616  ex-holotype strain
Glutinomyces brunneus                  JCM 32230  ex-holotype strain
Glutinomyces brunneus                  JCM 32231
Glutinomyces brunneus                  JCM 32232
Glutinomyces inflatus                  JCM 32227  ex-holotype strain
Glutinomyces inflatus                  JCM 32228
Glutinomyces inflatus                  JCM 32229
Glutinomyces takaragaikensis           JCM 32245  ex-holotype strain
Glutinomyces takaragaikensis           JCM 32246
Glutinomyces vulgaris                  JCM 32233  ex-holotype strain
Glutinomyces vulgaris                  JCM 32234
Glutinomyces vulgaris                  JCM 32235
Glutinomyces vulgaris                  JCM 32236
Leptoparies palmarum                   JCM 13089  ex-holotype strain
Pseudolophiostoma cornisporum          JCM 32348  ex-holotype strain
Pseudolophiostoma obtusisporum         JCM 32349  ex-holotype strain
Pseudopaucispora brunneospora          JCM 32350  ex-holotype strain
Talaromyces minioluteus                JCM 28741
Talaromyces minioluteus                JCM 28748
Talaromyces minioluteus                JCM 28751
Talaromyces minioluteus                JCM 28752
Talaromyces minioluteus                JCM 28756
Talaromyces minioluteus                JCM 28757
Talaromyces minioluteus                JCM 28762
Talaromyces minioluteus                JCM 28767
Talaromyces minioluteus                JCM 28773
Talaromyces minioluteus                JCM 28780
Unidentified fungus                    JCM 32237
Unidentified fungus                    JCM 32238
Unidentified fungus                    JCM 32239
Unidentified fungus                    JCM 32240
Unidentified fungus                    JCM 32241
Unidentified fungus                    JCM 32242
Unidentified fungus                    JCM 32243
Unidentified fungus                    JCM 32244
Vaginatispora amygdali                 JCM 32351  ex-holotype strain
Vaginatispora scabrispora              JCM 32352  ex-holotype strain

詳細は以下のサイトから検索できますのでご利用ください。
https://jcm.brc.riken.jp/ja/catalogue

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発行
理化学研究所 バイオリソース研究センター
微生物材料開発室 (JCM)
inquiry.jcm@riken.jp
https://jcm.brc.riken.jp/ja/
2019年4月12日
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