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RIKEN BioResource Center - Japan Collection of Microorganisms
JCM Mail News （電子メール版） No. 104
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理化学研究所 バイオリソースセンター 微生物材料開発室（JCM）
が公開している微生物等の最新情報をお届けします。
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● 今月のリソース紹介「温泉から分離されたアンモニア酸化アーキア
"Nitrososphaera gargensis"」
● 新規公開微生物株（2017年5月-2017年6月公開）
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┃ 今月のリソース紹介「温泉から分離されたアンモニア酸化アーキア
┃ "Nitrososphaera gargensis"」
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自然界の窒素循環におけるアンモニアの酸化反応は、これまでは主にアンモニ
ア酸化細菌が担っていると考えられてきましたが、近年ではタウムアーキオー
タと呼ばれる一群のアーキアにもこのアンモニア酸化能が認められています。
タウムアーキオータが命名規約上正式発表されたのはNitrososphaera
viennensisが提唱された2014年のことで、これまで本種の基準株（EN76株=
JCM 19564, DSM 26422）だけがコレクションから利用可能になっていました。
一方、本種の発見以前にもいくつかのタウムアーキオータが報告されており、
"Nitrososphaera gargensis"もその一つです。本アーキアは2008年に温泉から
の集積培養物中に存在するアンモニア酸化能を有するタウムアーキオータとし
て報告されました。その後しばらくは混合カルチャーとして維持され、この間
にゲノム解析も行われましたが、2016年になって純化された菌株がJCMに寄託
されました。本菌株はN. viennensisとは近縁ですが、N. viennensisとは異な
りシアネートを単一のエネルギー源として利用することができます。JCMでは
この度本菌株を公開致しましたので興味のある方はご利用下さい。尚、その培
養方法については培地データ（JCM Medium No. 1148）に記述がありますが、
いくつか注意点もありますので不明なことがあればお問い合わせ下さい。
Hatzenpichler, R. et al. 2008. A moderately thermophilic
ammonia-oxidizing crenarchaeote from a hot spring. Proc. Natl. Acad.
Sci. USA 105: 2134-2139. PMID: 18250313.
Spang, A. et al. 2012. The genome of the ammonia-oxidizing Candidatus
Nitrososphaera gargensis: insights into metabolic versatility and
environmental adaptations. Environ. Microbiol. 14: 3122-3145.
PMID: 23057602.
Palatinszky, M. et al. 2015. Cyanate as an energy source for
nitrifiers. Nature 524: 105-108. PMID: 26222031.
伊藤 隆 （アーキア・極限環境細菌担当）
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┃ 新規公開微生物株（2017年5月-2017年6月公開）
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細菌
Acinetobacter larvae JCM 31367 Type strain
Actinotalea caeni JCM 30447 Type strain
Agathobacter rectalis JCM 31336
Agromyces sp. JCM 28256
Algoriphagus aestuariicola JCM 31546 Type strain
Anaeromicrobium sediminis JCM 30224 Type strain
Angustibacter aerolatus JCM 32086 Type strain
Arachidicoccus ginsenosidivorans JCM 30984 Type strain
Brachybacterium hainanense JCM 31972 Type strain
Brevibacillus halotolerans JCM 30849 Type strain
Cellulomonas massiliensis JCM 31973 Type strain
Cellulomonas sp. JCM 28268
Chloroflexus islandicus JCM 30533 Type strain
Chthonobacter albigriseus JCM 30603 Type strain
Deinococcus knuensis JCM 31406 Type strain
Deinococcus sedimenti JCM 31405 Type strain
Desulfuribacillus stibiiarsenatis JCM 30866 Type strain
Endothiovibrio diazotrophicus JCM 17961 Type strain
Eubacterium ramulus JCM 31335
Faecalimonas umbilicata JCM 30896 Type strain
Faecalimonas umbilicata JCM 31370
Faecalimonas umbilicata JCM 31933
Flavobacterium crassostreae JCM 31219 Type strain
Geobacillus kaustophilus JCM 31151
Geobacillus kaustophilus JCM 31152
Geobacillus kaustophilus JCM 31153
"Halomonas aestuarii" JCM 31415
Humibacter antri JCM 31974 Type strain
Humibacter aquilariae JCM 31199 Type strain
Hymenobacter aquaticus JCM 31653 Type strain
Kistimonas sp. JCM 30010
Kocuria halotolerans JCM 31975 Type strain
Kribbella italica JCM 31976 Type strain
Lachnospira sp. JCM 31338
Lactococcus formosensis JCM 31966 Type strain
Lactococcus hircilactis JCM 31964 Type strain
Lactococcus lactis subsp. tructae JCM 31963 Type strain
Lactococcus laudensis JCM 31965 Type strain
Lactococcus nasutitermitis JCM 32013 Type strain
Lactococcus taiwanensis JCM 32014 Type strain
Lysobacter humi JCM 31019 Type strain
Marmoricola aquaticus JCM 31977 Type strain
Marmoricola korecus JCM 31978 Type strain
Methylobacillus methanolivorans JCM 31401 Type strain
Microbacterium sp. JCM 28244
Microbacterium sp. JCM 28246
Microbacterium sp. JCM 28264
Microbacterium sp. JCM 28275
Microbacterium sp. JCM 28282
Microbacterium sp. JCM 28291
Microbacterium sp. JCM 28294
Microbulbifer echini JCM 30400 Type strain
Micromonospora taraxaci JCM 31775 Type strain
Motilibacter rhizosphaerae JCM 32087 Type strain
Mucilaginibacter psychrotolerans JCM 30607 Type strain
Muricauda lutea JCM 31455 Type strain
Mycobacterium paraintracellulare JCM 30619
Nesterenkonia populi JCM 31979 Type strain
Niveitalea solisilvae JCM 31525 Type strain
Nocardioides maradonensis JCM 31980 Type strain
Nocardioides soli JCM 32088 Type strain
Nocardioides ultimimeridianus JCM 31981 Type strain
Noviherbaspirillum agri JCM 31463 Type strain
Paenibacillus panaciterrae JCM 30744 Type strain
Paenibacillus sp. JCM 28274
Parahaliea aestuarii JCM 31547 Type strain
Promicromonospora sp. JCM 28281
Pseudaeromonas pectinilytica JCM 31503 Type strain
Rhodococcus sp. JCM 28259
Rhodococcus sp. JCM 28262
Rhodococcus sp. JCM 28271
Rhodococcus sp. JCM 28273
Rhodococcus sp. JCM 28283
Rhodococcus sp. JCM 28285
Rhodococcus sp. JCM 28295
Roseburia hominis JCM 31337
Roseburia inulinivorans JCM 31260
Roseomonas nepalensis JCM 31470 Type strain
Ruficoccus amylovorans JCM 31066 Type strain
Sanguibacter gelidistatuariae JCM 30887 Type strain
Serratia ureilytica JCM 13046 Type strain
Spirosoma fluminis JCM 31409 Type strain
Spirosoma knui JCM 31407 Type strain
Staphylococcus argenteus JCM 31982 Type strain
Staphylococcus schweitzeri JCM 31983 Type strain
Streptomyces lactacystinicus JCM 10101 Type strain
Streptomyces mutomycini JCM 10455 Type strain
Streptomyces sp. JCM 19738
Streptomyces sp. JCM 28257
Streptomyces sp. JCM 28261
Terrabacter terrigena JCM 31984 Type strain
Tersicoccus phoenicis JCM 31985 Type strain
Tsukamurella pulmonis JCM 18308
Zhihengliuella somnathii JCM 31986 Type strain
アーキア
Halobaculum roseum JCM 31273 Type strain
Halorubrum trueperi JCM 31271 Type strain
"Nitrososphaera gargensis" JCM 31473
真菌
Allodekkera sacchari JCM 18455 Type strain
Allodekkera sacchari JCM 18456
Allodekkera sacchari JCM 18457
Arachnopeziza sp. JCM 31955
Cystobasidium ongulense JCM 31527 Type strain
Cystobasidium ongulense JCM 31528
Cystobasidium tubakii JCM 31526 Type strain
Cystobasidium tubakii JCM 31529
Gliocladium novaezelandiae JCM 17532
Hypomyces sp. JCM 16691
Ilyonectria sp. JCM 28329
Ilyonectria sp. JCM 28334
Oidiodendron sp. JCM 31956
Pachysolen tannophilus JCM 31685 Type strain
Penicillium paneum JCM 28412
Sagenomella griseoviridis JCM 15364
Sphaerostilbella aureonitens JCM 16687
Sphaerostilbella aureonitens JCM 16688
Sphaerostilbella lutea JCM 16685
Sphaerostilbella lutea JCM 16686
Sphaerostilbella novaezelandiae JCM 17531
Sphaerostilbella novaezelandiae JCM 30856
Unidentified fungus JCM 31953
Unidentified fungus JCM 31954
微細藻類
Prototheca tumulicola JCM 31123 ex-type strain
Prototheca tumulicola JCM 31124
詳細は以下のサイトから検索できますのでご利用ください。
https://jcm.brc.riken.jp/ja/catalogue
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発行
理化学研究所 バイオリソースセンター
微生物材料開発室 (JCM)
inquiry.jcm@riken.jp
https://jcm.brc.riken.jp/ja/
2017年7月7日
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