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RIKEN BioResource Center - Japan Collection of Microorganisms
JCM Mail News （電子メール版） No. 96
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理化学研究所 バイオリソースセンター 微生物材料開発室（JCM）
が公開している微生物等の最新情報をお届けします。
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● 理化学研究所バイオリソースセンター 一般公開のお知らせ
● 今月のリソース紹介「マッサリナ亜目 (クロイボタケ綱・プレオスポラ目)
の分類学的再検討に用いられた日本産菌株」
● 新規公開微生物株（2016年2-3月公開）
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┃ 理化学研究所バイオリソースセンター 一般公開のお知らせ
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理化学研究所バイオリソースセンターの一般公開が行われます。
当室の坂本光央研究員の講演がございます。
講演タイトル
「目に見えないけど大切なパートナー
-私たちの体の一部である微生物とうまく付き合っていこう！-」
皆様のご来場をお待ちしております。
4月22日（金）13:00 - 16:00 および 23日（土）10:00 - 16:00
詳細は以下のサイトをご覧ください。
http://rtcweb.rtc.riken.jp/openhouse28/20160404-ippan.pdf
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┃ 今月のリソース紹介「マッサリナ亜目 (クロイボタケ綱・プレオスポラ目)
┃ の分類学的再検討に用いられた日本産菌株」
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田中和明准教授 （弘前大学農学生命科学部） らの日本人研究者が、子嚢菌
クロイボタケ綱 (Dothideomycetes) プレオスポラ目 (Pleosporales) の
マッサリナ亜目 (Massarineae) について、形態・生態・分子系統
[核リボソームRNA遺伝子 (SSU, LSU)、tef1遺伝子] に基づいた分類学的
再検討を試み、その成果をオランダの著名な雑誌に最近発表しました
(Tanaka et al. 2015)。2新科・10新属・22新種・7新組合せ・2エピタイプ
選定が提案され、同時に菌類バーコードマーカーとしての多数のITS配列が
公開されました。JCMではこれらの株 (以下、一部抜粋) を公開すべく、準備
を進めています。なお、天然基質上の子嚢果・子嚢・子嚢胞子・分生子などの
みごとな写真は下に示すサイトよりご覧ください。
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JCM no. 学名 備考
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19429 Aquastroma magniostiolata 新属新種、ex-type
19427 Aquilomyces rebunensis 新種、ex-type
19424 Clypeoloculus akitaensis 新属新種、ex-type
19425 Clypeoloculus hirosakiensis 新種、ex-type
19426 Clypeoloculus microsporus 新種、ex-type
19428 Clypeoloculus towadaensis 新種、ex-type
19404 Dictyosporium digitatum
19407 Dictyosporium hughesii
19409 Dictyosporium pseudomusae 新種、ex-type
19410 Dictyosporium tetrasporum
19403 Dictyosporium sp.
13104 Fuscostagonospora sasae 新属新種、ex-type
19411 Gregarithecium curvisporum 新属新種、ex-type
19423 Helicascus aquaticus
17526 Helicascus thalassioideus
13095 Helminthosporium massarinum 新種、ex-type
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引用文献
Tanaka et al. 2015. Revision of the Massarineae
(Pleosporales, Dothideomycetes). Stud. Mycol. 82: 75–136.
<http://www.sciencedirect.com/science/article/pii/S0166061615000160>
岡田 元 (糸状菌担当)
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┃ 新規公開微生物株（2016年2-3月公開）
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細菌
Acidithiobacillus ferriphilus JCM 30830 Type strain
Actinoplanes lichenis JCM 30485 Type strain
Advenella alkanexedens JCM 30465 Type strain
Alcaligenes pakistanensis JCM 30216 Type strain
Algoriella xinjiangensis JCM 16590 Type strain
Alteromonas naphthalenivorans JCM 17741 Type strain
Aminobacterium thunnarium JCM 19320 Type strain
Amphritea spongicola JCM 16668 Type strain
Anaerosalibacter bizertensis JCM 17239 Type strain
"Aneurinibacillus humi" JCM 19865 Proposed type strain
Arcobacter pacificus JCM 17857 Type strain
Athalassotoga saccharophila JCM 19762 Type strain
Azospirillum soli JCM 18820 Type strain
Bacillus ectoiniformans JCM 30397 Type strain
Bacillus formosensis JCM 18448 Type strain
Bacillus malikii JCM 30192 Type strain
Bacillus sp. JCM 15709
Bacillus stamsii JCM 30025 Type strain
"Bergeyella cardium" JCM 30115 Proposed type strain
Bifidobacterium hapali JCM 30799 Type strain
Bifidobacterium hapali JCM 30800
Bifidobacterium myosotis JCM 30796 Type strain
Bifidobacterium myosotis JCM 30797
Bifidobacterium tissieri JCM 30798 Type strain
Bifidobacterium tissieri JCM 30803
Bordetella muralis JCM 30931 Type strain
Bordetella muralis JCM 30932
Bordetella muralis JCM 30933
Bordetella tumbae JCM 30934 Type strain
Bordetella tumulicola JCM 30935 Type strain
Bordetella tumulicola JCM 30936
Bordetella tumulicola JCM 30937
Bordetella tumulicola JCM 30938
Bordetella tumulicola JCM 30939
Bordetella tumulicola JCM 30940
Burkholderia cepacia JCM 5509
Burkholderia cepacia JCM 5510
Burkholderia cepacia JCM 5511
Caulobacter flavus JCM 30763 Type strain
Celeribacter manganoxidans JCM 19384 Type strain
Chryseobacterium echinoideorum JCM 30470 Type strain
"Clostridium kogasensis" JCM 18719 Proposed type strain
Clostridium xylanovorans JCM 31057 Type strain
Comamonas piscis JCM 30718 Type strain
Confluentimicrobium naphthalenivorans JCM 30828 Type strain
Croceitalea litorea JCM 19531 Type strain
Deinococcus actinosclerus JCM 30700 Type strain
Deinococcus actinosclerus JCM 30701
Deinococcus actinosclerus JCM 30702
Dissulfurimicrobium hydrothermale JCM 19990 Type strain
Duganella ginsengisoli JCM 30745 Type strain
Filobacterium rodentium JCM 19453 Type strain
Flavisolibacter ginsenosidimutans JCM 18197 Type strain
"Flavisolibacter swuensis" JCM 19974 Proposed type strain
Flavitalea soli JCM 19937 Type strain
Flavobacterium buctense JCM 30750 Type strain
Flavobacterium seoulense JCM 30145 Type strain
Flexilinea flocculi JCM 30897 Type strain
Fusibacter bizertensis JCM 19376 Type strain
Halocynthiibacter arcticus JCM 30530 Type strain
Halomonas garicola JCM 30151 Type strain
Humibacter ginsengisoli JCM 30080 Type strain
Humibacter ginsengiterrae JCM 30079 Type strain
Hymenobacter mucosus JCM 19647 Type strain
Hyunsoonleella udonensis JCM 30600 Type strain
Inquilinus ginsengisoli JCM 14825 Type strain
Kushneria aurantia JCM 15469 Type strain
Kushneria indalinina JCM 19369 Type strain
Labrys soli JCM 19895 Type strain
Luteimonas notoginsengisoli JCM 30329 Type strain
Luteimonas pelagia JCM 18792 Type strain
Lysobacter hankyongensis JCM 18204 Type strain
Lysobacter sediminicola JCM 18205 Type strain
"Lysobacter tyrosinelyticus" JCM 30320 Proposed type strain
Mariniluteicoccus endophyticus JCM 30097 Type strain
Mariniluteicoccus endophyticus JCM 30098
Methyloterrigena soli JCM 30821 Type strain
Niveibacterium umoris JCM 18716 Type strain
Novosphingobium oryzae JCM 30537 Type strain
"Paenibacillus ginsengiterrae" JCM 19887 Proposed type strain
Paenibacillus medicaginis JCM 18446 Type strain
Paracoccus laeviglucosivorans JCM 30587 Type strain
"Paralcaligenes ginsengisoli" JCM 30746 Proposed type strain
"Phaeobacter marinintestinus" JCM 19926 Proposed type strain
Phaeobacterium nitratireducens JCM 19219 Type strain
Polymorphobacter fuscus JCM 19740 Type strain
Pseudoclavibacter terrae JCM 30298 Type strain
Pseudofulvibacter gastropodicola JCM 30369 Type strain
Pseudomonas aeruginosa JCM 5517
Pseudooceanicola antarcticus JCM 19802 Type strain
"Pseudooceanicola flagellatus" JCM 19803 Proposed type strain
Psychroflexus planctonicus JCM 30616 Type strain
Psychroflexus salis JCM 30615 Type strain
Rhabdobacter roseus JCM 30685 Type strain
Rhizobium marinum JCM 30155 Type strain
Rhodanobacter aciditrophus JCM 30774 Type strain
Roseomonas wooponensis JCM 19527 Type strain
Saccharothrix stipae JCM 30560 Type strain
Simplicispira piscis JCM 19291 Type strain
Sphingobacterium mucilaginosum JCM 30424 Type strain
Sphingobium barthaii JCM 30309 Type strain
"Sphingosinicella ginsenosidimutans" JCM 18201 Proposed type strain
Spirosoma fluviale JCM 30659 Type strain
Sporohalobacter salinus JCM 19279 Type strain
Staphylococcus lentus JCM 2426 Type strain
Streptomyces actinomycinicus JCM 30864 Type strain
"Streptomyces siamensis" JCM 18409 Proposed type strain
"Streptomyces similanensis" JCM 18410 Proposed type strain
Streptomyces sp. JCM 30950
Thalassocola ureilytica JCM 30682 Type strain
Thermanaeromonas burensis JCM 18718 Type strain
Thermostilla marina JCM 19992 Type strain
Tsukamurella hongkongensis JCM 30715 Type strain
Tsukamurella hongkongensis JCM 30716
Tsukamurella sinensis JCM 30714 Type strain
Undibacterium aquatile JCM 30323 Type strain
Xanthomarina gelatinilytica JCM 18821 Type strain
アーキア
Acidianus sp. JCM 30227
Cuniculiplasma divulgatum JCM 30641
Cuniculiplasma divulgatum JCM 30642 Type strain
Haloarcula sp. JCM 30477
"Haloparvum sedimenti" JCM 30891
"Haloparvum sedimenti" JCM 30892
Halorubrum yunnanense JCM 30666
Methanolobus chelungpuianus JCM 15159 Type strain
真菌
Aspergillus nidulans JCM 19075
Cunninghamella echinulata JCM 22488
Cunninghamella elegans JCM 22489
Lyophyllum decastes JCM 30590
Lyophyllum shimeji JCM 30591
Mucor circinelloides JCM 22475
Mucor circinelloides JCM 22476
Mucor circinelloides JCM 22477
Mucor circinelloides JCM 22478
Mucor circinelloides JCM 22479
Mucor circinelloides JCM 22480
Mucor circinelloides JCM 22483
Mucor circinelloides JCM 22484
Mucor mucedo JCM 23020
Mucor racemosus f. racemosus JCM 22481
Muscodor oryzae JCM 18231 ex-holotype
Pilasporangium apinafurcum JCM 30513 ex-holotype
Pilasporangium apinafurcum JCM 30514
Rhodosporidium toruloides JCM 24501
Rhodotorula slooffiae JCM 10954 Type strain
Schizophyllum commune JCM 22674
Syncephalastrum racemosum JCM 22491
Yarrowia sp. JCM 30694
Yarrowia sp. JCM 30695
Yarrowia sp. JCM 30696
詳細は以下のサイトから検索できますのでご利用ください。
https://jcm.brc.riken.jp/ja/catalogue
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(inquiry@jcm.riken.jp)まで「メールニュース不要」の旨をご連絡ください。
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発行
理化学研究所 バイオリソースセンター
微生物材料開発室 (JCM)
inquiry@jcm.riken.jp
https://jcm.brc.riken.jp/ja/
2016年4月20日
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