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RIKEN BioResource Center - Japan Collection of Microorganisms
JCM Mail News （電子メール版） No. 92
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理化学研究所 バイオリソースセンター 微生物材料開発室（JCM）
が公開している微生物等の最新情報をお届けします。
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● 好気性細菌の培養とrRNA遺伝子解析に関する初心者向け技術研修のお知らせ
● 今月のトピックス「高濃度亜硝酸塩存在下で生育可能な
Achromobacter denitrificans JCM 19165」
● 日本微生物生態学会第30回大会および第7回日本—台湾—韓国 微生物生態
学会国際シンポジウムにおけるパネル展示のお知らせ
● 新規公開微生物株（2015年6-9月公開）
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┃好気性細菌の培養とrRNA遺伝子解析に関する初心者向け技術研修のお知らせ
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JCMでは下記の要領で技術研修を行います。
概 要： 好気性細菌の培養と16S rRNA遺伝子解析に関する基本的な実験
操作について、講義と実習を行います。
研修期間： 平成 27年 10月 29日（木）～30日（金）（2日間）
実施場所： 独立行政法人理化学研究所（筑波地区） 情報・微生物棟内
（茨城県つくば市高野台3-1-1）
詳細はhttps://ja.brc.riken.jp/consulting/kensyu_jcm9.shtmlをご覧ください。
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┃今月のトピックス「高濃度亜硝酸塩存在下で生育可能な
┃ Achromobacter denitrificans JCM 19165」
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自然界では、温度、pH、浸透圧、化学物質といった様々なストレスに晒され
ています。微生物は多様な耐性機構や無害化機構をもって、それらの環境に適
応しています。亜硝酸 (NO2-) もストレス物質の一つで、生物活性を阻害しま
すが、Achromobacter denitrificans YD35株 (= JCM 19165) は高濃度の亜硝
酸塩存在下でも増殖できる細菌です。YD35株の亜硝酸耐性について、トランス
ポゾンを用いて突然変異誘発されたYD35株の亜硝酸感受性株を用いて解析され
た結果、ピルビン酸脱水素酵素 (Pdh) 遺伝子クラスター欠損株が100 mM亜硝
酸塩存在下で増殖できないことや、細胞内のNADH/NAD+比率と細胞内ATPレベル
が亜硝酸によって下がることから、Pdhが亜硝酸塩耐性や細胞内のNADHやATPの
発現増強に関与することが明らかにされました。また、アコニターゼ変異株と
の比較解析の結果、A. denitrificans YD35株中のAcnA3のアコニターゼ活性が
活性窒素種 (RNS) を形成する高濃度NO2-レベル下で活性を持続することが明
らかにされました。AcnA3変異株 (AcnA3Tn) は、AcnA4変異株、AcnB変異株な
どの他のアコニターゼ変異株と比較して、細胞内クエン酸濃度が高く、酸化や
RNSに対するAcnA3の耐性がYD35株の亜硝酸存在下での生存に関与することが示
されました。
参考文献
1) Doi, T. et al. 2014. Appl. Environ. Microbiol., 80: 1910-1918.
2) Doi, T. and Takaya, N. 2015. J. Biol. Chem., 290: 1412-1421.
飯野 隆夫（好気性および通性嫌気性細菌担当）
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┃日本微生物生態学会第30回大会および第7回日本—台湾—韓国 微生物生態
┃学会国際シンポジウムにおけるパネル展示のお知らせ
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日本微生物生態学会第30回大会および第7回日本—台湾—韓国 微生物生態
学会国際シンポジウムにおいてJCMのパネル展示を行います。本大会にご出席
される方はどうぞブースにお立ち寄り下さいますようご案内いたします。
日本微生物生態学会第30回大会および第7回日本—台湾—韓国
微生物生態学会国際シンポジウム
展示会期 2015年10月18日（日）- 20日（火）
展示会場 土浦市亀城プラザ（1階・リハーサル室）
（〒300-0043 茨城県土浦市中央二丁目16-4）
年大会ホームページ：http://www.microbial-ecology.jp/meeting/
展示のご案内：http://www.microbial-ecology.jp/meeting/?p=2581
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┃ 新規公開微生物株（2015年6-9月公開）
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細菌
Acetoanaerobium pronyense JCM 19400 Type strain
Achromobacter denitrificans JCM 19165
"Actinoallomurus bryophytorum" JCM 30340 Proposed type strain
"Actinomadura amylolytica" JCM 30324 Proposed type strain
"Actinomadura cellulosilytica" JCM 30326 Proposed type strain
Actinomycetospora atypica JCM 30775 Type strain
Actinoplanes lutulentus JCM 30776 Type strain
Actinorugispora endophytica JCM 30099 Type strain
Aeromonas schubertii JCM 7373 Type strain
Aeromonas sp. JCM 2526
Aestuariicella hydrocarbonica JCM 30134 Type strain
Akkermansia muciniphila JCM 30893
Alcanivorax gelatiniphagus JCM 18425 Type strain
Algibacter lectus JCM 19274
Algibacter psychrophilus JCM 30370 Type strain
Aliiglaciecola aliphaticivorans JCM 30133 Type strain
"Aliiglaciecola coringensis" JCM 19197 Proposed type strain
Alteromonas gracilis JCM 30236 Type strain
Anaerosolibacter carboniphilus JCM 19988 Type strain
"Antarctobacter jejuensis" JCM 19898 Proposed type strain
Arthrobacter endophyticus JCM 30091 Type strain
"Arthrobacter ginsengisoli" JCM 19357 Proposed type strain
Azotobacter sp. JCM 2964
"Bacillus aequororis" JCM 19304 Proposed type strain
"Bacillus alkalicola" JCM 17098 Proposed type strain
Bacillus caseinilyticus JCM 30246 Type strain
"Bacillus cheonanensis" JCM 19333 Proposed type strain
Bacillus crassostreae JCM 17523 Type strain
Bacillus subtilis JCM 30051
Belliella aquatica JCM 19468 Type strain
Bifidobacterium adolescentis JCM 19480
Bifidobacterium aesculapii JCM 18762
Bifidobacterium bifidum JCM 19474
Bifidobacterium bifidum JCM 19478
Bifidobacterium bifidum JCM 19482
Bifidobacterium bifidum JCM 19483
Bifidobacterium lemurum JCM 30168 Type strain
"Bifidobacterium longum subsp. suillum" JCM 19995 Proposed type strain
Blastomonas aquatica JCM 30179 Type strain
Caloranaerobacter ferrireducens JCM 19467 Type strain
Cellulomonas marina JCM 30777 Type strain
Chelatococcus caeni JCM 30181 Type strain
Chloracidobacterium thermophilum JCM 30199 Type strain
Chryseobacterium shandongense JCM 30154 Type strain
"Citrimicrobium luteum" JCM 19530 Proposed type strain
Citrobacter freundii JCM 2621
Citrobacter freundii JCM 2622
Citrobacter freundii JCM 2623
Citrobacter freundii JCM 2624
Citrobacter freundii JCM 2625
Citrobacter freundii JCM 2626
Citrobacter freundii JCM 2627
Citrobacter freundii JCM 2628
Citrobacter freundii JCM 2629
Citrobacter freundii JCM 2630
Citrobacter freundii JCM 2632
Citrobacter freundii JCM 2633
Citrobacter freundii JCM 2634
Citrobacter freundii JCM 2635
Citrobacter freundii JCM 2636
Citrobacter freundii JCM 2637
Citrobacter freundii JCM 2640
Citrobacter freundii JCM 2641
Citrobacter freundii JCM 2642
Citrobacter freundii JCM 2643
Citrobacter freundii JCM 2644
Citrobacter freundii JCM 2645
Citrobacter freundii JCM 2646
Citrobacter freundii JCM 2647
Citrobacter freundii JCM 2648
Citrobacter freundii JCM 2649
"Cohnella capsici" JCM 19168 Proposed type strain
"Comamonas faecalis" JCM 17561 Proposed type strain
"Cupriavidus yeoncheonense" JCM 19890 Proposed type strain
"Deinococcus puniceus" JCM 18576 Proposed type strain
"Deinococcus radioresistens" JCM 19777 Proposed type strain
"Deinococcus radioresistens" JCM 19778
"Deinococcus soli" JCM 19176 Proposed type strain
Delftia acidovorans JCM 2784
"Delftia deserti" JCM 30639 Proposed type strain
Desulfuromonas carbonis JCM 30471 Type strain
Dokdonia pacifica JCM 18216 Type strain
Eubacterium contortum JCM 6483 Type strain
"Ferruginibacter profundus" JCM 19431 Proposed type strain
Flaviaesturariibacter amylovorans JCM 17919 Type strain
Flavirhabdus iliipiscaria JCM 18637 Type strain
Flavobacterium daemonensis JCM 19455 Type strain
"Flavobacterium panaciterrae" JCM 19161 Proposed type strain
Flavobacterium qiangtangensis JCM 19739 Type strain
"Flavobacterium shanxiense" JCM 30153 Proposed type strain
"Fusobacterium hwasookii" JCM 30218 Proposed type strain
"Fusobacterium hwasookii" JCM 30219
"Fusobacterium hwasookii" JCM 30220
"Fusobacterium hwasookii" JCM 30221
"Fusobacterium hwasookii" JCM 30222
Gibbsiella greigii JCM 30408 Type strain
Gibbsiella quercinecans JCM 30407 Type strain
Glaciihabitans tibetensis JCM 30778 Type strain
Glycomyces tarimensis JCM 30184 Type strain
"Gordonia jinhuaensis" JCM 30100 Proposed type strain
Grimontia hollisae JCM 1286
"Grimontia indica" JCM 17852 Proposed type strain
Hafnia psychrotolerans JCM 30077 Type strain
Helicobacter sp. JCM 30736
"Hymenobacter humi" JCM 19635 Proposed type strain
"Hymenobacter terrae" JCM 30007 Proposed type strain
Hymenobacter wooponensis JCM 19491 Type strain
Ichthyenterobacterium magnum JCM 18636 Type strain
"Idiomarina woeseii" JCM 19499 Proposed type strain
Janibacter indicus JCM 30779 Type strain
Jejuia pallidilutea JCM 19538
Jiella aquimaris JCM 30119 Type strain
Kangiella profundi JCM 30232 Type strain
"Kribbella qitaiheensis" JCM 30343 Proposed type strain
"Kushneria pakistanensis" JCM 18802 Proposed type strain
Lactobacillus apinorum JCM 30765 Type strain
Lactobacillus delbrueckii subsp. jakobsenii JCM 30917 Type strain
Lactobacillus heilongjiangensis JCM 30916 Type strain
Lactobacillus helsingborgensis JCM 30766 Type strain
Lactobacillus helveticus JCM 30912
Lactobacillus kimbladii JCM 30767 Type strain
Lactobacillus kullabergensis JCM 30802 Type strain
Lactobacillus mellifer JCM 30768 Type strain
Lactobacillus mellis JCM 30769 Type strain
Lactobacillus melliventris JCM 30770 Type strain
Lactobacillus mixtipabuli JCM 19805 Type strain
Lactobacillus mixtipabuli JCM 19804
Lactobacillus mixtipabuli JCM 19806
Lactobacillus nenjiangensis JCM 30919 Type strain
Lactobacillus parabrevis JCM 30911 Type strain
Lactobacillus songhuajiangensis JCM 30918 Type strain
"Lactobacillus vespulae" JCM 19742
Lactobacillus xiangfangensis JCM 30915 Type strain
Leeuwenhoekiella polynyae JCM 30387 Type strain
"Lentibacillus garicola" JCM 30131 Proposed type strain
"Leucobacter humi" JCM 18638 Proposed type strain
Leuconostoc mesenteroides subsp. suionicum JCM 30910 Type strain
"Lysobacter fragariae" JCM 30322 Proposed type strain
"Lysobacter lycopersici" JCM 19164 Proposed type strain
"Lysobacter rhizosphaerae" JCM 30321 Proposed type strain
"Marinactinospora endophytica" JCM 30293 Proposed type strain
Marinobacter nitratireducens JCM 18428 Type strain
Marivirga atlantica JCM 30305 Type strain
Marivita lacus JCM 19516 Type strain
Massilia eurypsychrophila JCM 30074 Type strain
"Mesorhizobium soli" JCM 19897 Proposed type strain
Methylobrevis pamukkalensis JCM 30229 Type strain
Methyloversatilis discipulorum JCM 30542 Type strain
Microbacterium shaanxiense JCM 30164 Type strain
"Micromonospora harpali" JCM 30055 Proposed type strain
"Micromonospora palomenae" JCM 30056 Proposed type strain
Micromonospora polyrhachis JCM 30780 Type strain
Mucilaginibacter vulcanisilvae JCM 30363 Type strain
Mycobacterium anyangense JCM 30275 Type strain
"Niabella thaonhiensis" JCM 18864 Proposed type strain
Nocardioides echinoideorum JCM 30276 Type strain
Nocardiopsis fildesensis JCM 30781 Type strain
Nonlabens sediminis JCM 19294
Nonlabens ulvanivorans JCM 19296
Nonlabens ulvanivorans JCM 19297
Nonlabens ulvanivorans JCM 19298
Nonomuraea fuscirosea JCM 30782 Type strain
Nonomuraea solani JCM 30783 Type strain
"Ochrovirga pacifica" JCM 18327 Proposed type strain
"Okibacterium endophyticum" JCM 30086 Proposed type strain
"Oricola cellulosilytica" JCM 19534 Proposed type strain
"Paenbacillus cucumis" JCM 19515 Proposed type strain
"Paenibacillus dauci" JCM 30283 Proposed type strain
Paenibacillus qingshengii JCM 30613 Type strain
Paenibacillus sp. JCM 30052
"Paenibacillus vini" JCM 19842 Proposed type strain
"Paenibacillus wulumuqiensis" JCM 30284 Proposed type strain
"Paenibacillus yonginensis" JCM 19885 Proposed type strain
Paracoccus panacisoli JCM 30337 Type strain
Pediococcus argentinicus JCM 30771 Type strain
Pediococcus ethanolidurans JCM 30913 Type strain
Pediococcus stilesii JCM 30772 Type strain
"Pedobacter bambusae" JCM 19364 Proposed type strain
"Pedobacter edaphicus" JCM 30351 Proposed type strain
"Pedobacter seoulensis" JCM 19363 Proposed type strain
"Peptoniphilus mikwangii" JCM 30223 Proposed type strain
"Peptoniphilus rhinitidis" JCM 17448 Proposed type strain
"Peptoniphilus rhinitidis" JCM 17449
Phascolarctobacterium faecium JCM 30894
Phascolarctobacterium faecium JCM 30895
"Photobacterium panuliri" JCM 19199 Proposed type strain
Phycicoccus soli JCM 19837 Type strain
Pontibacter humi JCM 19178 Type strain
Ponticoccus lacteus JCM 30379 Type strain
Porphyromonas pasteri JCM 30531 Type strain
"Pseudoruegeria limi" JCM 19487 Proposed type strain
Psychrobacter oceani JCM 30235 Type strain
Pullulanibacillus pueri JCM 30075 Type strain
"Rhizobium capsici" JCM 19535 Proposed type strain
Salipiger nanhaiensis JCM 19383 Type strain
Sediminicola arcticus JCM 19894 Type strain
"Sinomonas mesophila" JCM 30094 Proposed type strain
"Sphingobacterium yamdrokense" JCM 19397 Proposed type strain
"Sphingomonas aeria" JCM 19859 Proposed type strain
Sphingorhabdus pacificus JCM 30177 Type strain
"Streptomyces bohaiensis" JCM 19630 Proposed type strain
"Streptomyces lushanensis" JCM 19628 Proposed type strain
Streptosporangium nanhuense JCM 30784 Type strain
"Sulfurimonas hongkongensis" JCM 18418 Proposed type strain
"Thiobacillus prosperus" JCM 30709 Proposed type strain
"Vibrio panuliri" JCM 19500 Proposed type strain
Yersinia sp. JCM 1678
Youngimonas vesicularis JCM 18819 Type strain
アーキア
Halocalculus aciditolerans JCM 19596 Type strain
Halocalculus aciditolerans JCM 19594
Halocalculus aciditolerans JCM 19595
Halococcus agarilyticus JCM 19592 Type strain
Halolamina sediminis JCM 30187 Type strain
Halomicroarcula salina JCM 18369 Type strain
Halorubrum gandharaense JCM 17823 Type strain
Halorubrum persicum JCM 30541 Type strain
Methanobacterium aggregans JCM 30569 Type strain
Sulfolobus solfataricus JCM 30930
Thermoproteus thermophilus JCM 17229 Type strain
真菌
Aspergillus arcoverdensis JCM 19878 ex-holotype strain
Aspergillus arcoverdensis JCM 19879
Aspergillus arcoverdensis JCM 19880
Aspergillus caatingaensis JCM 19242 ex-holotype strain
Aspergillus caatingaensis JCM 19243
Aspergillus huiyaniae JCM 19448 ex-holotype strain
Aspergillus huiyaniae JCM 19449
Aspergillus pernambucoensis JCM 19244 ex-holotype strain
Aspergillus pernambucoensis JCM 19245
Aspergillus pernambucoensis JCM 19246
Aspergillus pernambucoensis JCM 19247
Burgoa anomala JCM 30265
Burgoa anomala JCM 30266
Burgoa anomala JCM 30267
Burgoa anomala JCM 30268
Burgoa anomala JCM 30269
Mariannaea elegans var. punicea JCM 19622
Mariannaea macrochlamydospora JCM 19621 ex-holotype strain
Mortierella elongata JCM 30264
Ogataea sp. JCM 24526
Pythium biforme JCM 30207 ex-holotype strain
Pythium biforme JCM 30208
Pythium brachiatum JCM 30210 ex-holotype strain
Pythium brachiatum JCM 30209
Pythium brachiatum JCM 30211
Pythium junctum JCM 30212 ex-holotype strain
Pythium junctum JCM 30213
Pythium junctum JCM 30214
Pythium junctum JCM 30215
Pythium utonaiense JCM 30206 ex-holotype strain
詳細は以下のサイトから検索できますのでご利用ください。
https://jcm.brc.riken.jp/ja/catalogue
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(inquiry@jcm.riken.jp)まで「メールニュース不要」の旨をご連絡下さい。
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発行
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2015年10月07日
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