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 属名:
 種名:
    例1: 属名 = Micromonospora
例2: 種名 = aurantiaca
例3: 属名 = %monospo, 種名 = %ensis
(前方一致検索。ワイルドカード「%」を使って中間または後方一致検索も可能。大文字・小文字は区別されません)

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   学名:
    例1: 学名 = Micromonospora chalcea
例2: 学名 = Lactobacillus paracasei subsp. paracasei
(前方一致検索。ワイルドカード「%」を使って中間または後方一致検索も可能。大文字・小文字は区別されません)

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例2: 培地名 = malt extract
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JCM Mail News No. 92


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RIKEN BioResource Center - Japan Collection of Microorganisms
            JCM Mail News (電子メール版) No. 92
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理化学研究所 バイオリソースセンター 微生物材料開発室(JCM)
が公開している微生物等の最新情報をお届けします。

━━━━  目  次  ━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━
● 好気性細菌の培養とrRNA遺伝子解析に関する初心者向け技術研修のお知らせ
● 今月のトピックス「高濃度亜硝酸塩存在下で生育可能な
                     Achromobacter denitrificans JCM 19165」
● 日本微生物生態学会第30回大会および第7回日本—台湾—韓国 微生物生態
   学会国際シンポジウムにおけるパネル展示のお知らせ
● 新規公開微生物株(2015年6-9月公開)
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┃好気性細菌の培養とrRNA遺伝子解析に関する初心者向け技術研修のお知らせ
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 JCMでは下記の要領で技術研修を行います。
 概   要:  好気性細菌の培養と16S rRNA遺伝子解析に関する基本的な実験
            操作について、講義と実習を行います。
 研修期間: 平成 27年 10月 29日(木)~30日(金)(2日間)
 実施場所: 独立行政法人理化学研究所(筑波地区) 情報・微生物棟内
           (茨城県つくば市高野台3-1-1)

 詳細はhttps://ja.brc.riken.jp/consulting/kensyu_jcm9.shtmlをご覧ください。


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┃今月のトピックス「高濃度亜硝酸塩存在下で生育可能な
┃                  Achromobacter denitrificans JCM 19165」
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  自然界では、温度、pH、浸透圧、化学物質といった様々なストレスに晒され
ています。微生物は多様な耐性機構や無害化機構をもって、それらの環境に適
応しています。亜硝酸 (NO2-) もストレス物質の一つで、生物活性を阻害しま
すが、Achromobacter denitrificans YD35株 (= JCM 19165) は高濃度の亜硝
酸塩存在下でも増殖できる細菌です。YD35株の亜硝酸耐性について、トランス
ポゾンを用いて突然変異誘発されたYD35株の亜硝酸感受性株を用いて解析され
た結果、ピルビン酸脱水素酵素 (Pdh) 遺伝子クラスター欠損株が100 mM亜硝
酸塩存在下で増殖できないことや、細胞内のNADH/NAD+比率と細胞内ATPレベル
が亜硝酸によって下がることから、Pdhが亜硝酸塩耐性や細胞内のNADHやATPの
発現増強に関与することが明らかにされました。また、アコニターゼ変異株と
の比較解析の結果、A. denitrificans YD35株中のAcnA3のアコニターゼ活性が
活性窒素種 (RNS) を形成する高濃度NO2-レベル下で活性を持続することが明
らかにされました。AcnA3変異株 (AcnA3Tn) は、AcnA4変異株、AcnB変異株な
どの他のアコニターゼ変異株と比較して、細胞内クエン酸濃度が高く、酸化や
RNSに対するAcnA3の耐性がYD35株の亜硝酸存在下での生存に関与することが示
されました。

参考文献
1) Doi, T. et al. 2014. Appl. Environ. Microbiol., 80: 1910-1918.
2) Doi, T. and Takaya, N. 2015. J. Biol. Chem., 290: 1412-1421.

飯野 隆夫(好気性および通性嫌気性細菌担当)


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┃日本微生物生態学会第30回大会および第7回日本—台湾—韓国 微生物生態
┃学会国際シンポジウムにおけるパネル展示のお知らせ
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  日本微生物生態学会第30回大会および第7回日本—台湾—韓国 微生物生態
学会国際シンポジウムにおいてJCMのパネル展示を行います。本大会にご出席
される方はどうぞブースにお立ち寄り下さいますようご案内いたします。

日本微生物生態学会第30回大会および第7回日本—台湾—韓国
微生物生態学会国際シンポジウム

  展示会期 2015年10月18日(日)- 20日(火)
  展示会場 土浦市亀城プラザ(1階・リハーサル室)
  (〒300-0043 茨城県土浦市中央二丁目16-4)
  年大会ホームページ:http://www.microbial-ecology.jp/meeting/
  展示のご案内:http://www.microbial-ecology.jp/meeting/?p=2581


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┃  新規公開微生物株(2015年6-9月公開)
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細菌
Acetoanaerobium pronyense                    JCM 19400    Type strain
Achromobacter denitrificans                  JCM 19165
"Actinoallomurus bryophytorum"               JCM 30340    Proposed type strain
"Actinomadura amylolytica"                   JCM 30324    Proposed type strain
"Actinomadura cellulosilytica"               JCM 30326    Proposed type strain
Actinomycetospora atypica                    JCM 30775    Type strain
Actinoplanes lutulentus                      JCM 30776    Type strain
Actinorugispora endophytica                  JCM 30099    Type strain
Aeromonas schubertii                         JCM 7373     Type strain
Aeromonas sp.                                JCM 2526
Aestuariicella hydrocarbonica                JCM 30134    Type strain
Akkermansia muciniphila                      JCM 30893
Alcanivorax gelatiniphagus                   JCM 18425    Type strain
Algibacter lectus                            JCM 19274
Algibacter psychrophilus                     JCM 30370    Type strain
Aliiglaciecola aliphaticivorans              JCM 30133    Type strain
"Aliiglaciecola coringensis"                 JCM 19197    Proposed type strain
Alteromonas gracilis                         JCM 30236    Type strain
Anaerosolibacter carboniphilus               JCM 19988    Type strain
"Antarctobacter jejuensis"                   JCM 19898    Proposed type strain
Arthrobacter endophyticus                    JCM 30091    Type strain
"Arthrobacter ginsengisoli"                  JCM 19357    Proposed type strain
Azotobacter sp.                              JCM 2964
"Bacillus aequororis"                        JCM 19304    Proposed type strain
"Bacillus alkalicola"                        JCM 17098    Proposed type strain
Bacillus caseinilyticus                      JCM 30246    Type strain
"Bacillus cheonanensis"                      JCM 19333    Proposed type strain
Bacillus crassostreae                        JCM 17523    Type strain
Bacillus subtilis                            JCM 30051
Belliella aquatica                           JCM 19468    Type strain
Bifidobacterium adolescentis                 JCM 19480
Bifidobacterium aesculapii                   JCM 18762
Bifidobacterium bifidum                      JCM 19474
Bifidobacterium bifidum                      JCM 19478
Bifidobacterium bifidum                      JCM 19482
Bifidobacterium bifidum                      JCM 19483
Bifidobacterium lemurum                      JCM 30168    Type strain
"Bifidobacterium longum subsp. suillum"      JCM 19995    Proposed type strain
Blastomonas aquatica                         JCM 30179    Type strain
Caloranaerobacter ferrireducens              JCM 19467    Type strain
Cellulomonas marina                          JCM 30777    Type strain
Chelatococcus caeni                          JCM 30181    Type strain
Chloracidobacterium thermophilum             JCM 30199    Type strain
Chryseobacterium shandongense                JCM 30154    Type strain
"Citrimicrobium luteum"                      JCM 19530    Proposed type strain
Citrobacter freundii                         JCM 2621
Citrobacter freundii                         JCM 2622
Citrobacter freundii                         JCM 2623
Citrobacter freundii                         JCM 2624
Citrobacter freundii                         JCM 2625
Citrobacter freundii                         JCM 2626
Citrobacter freundii                         JCM 2627
Citrobacter freundii                         JCM 2628
Citrobacter freundii                         JCM 2629
Citrobacter freundii                         JCM 2630
Citrobacter freundii                         JCM 2632
Citrobacter freundii                         JCM 2633
Citrobacter freundii                         JCM 2634
Citrobacter freundii                         JCM 2635
Citrobacter freundii                         JCM 2636
Citrobacter freundii                         JCM 2637
Citrobacter freundii                         JCM 2640
Citrobacter freundii                         JCM 2641
Citrobacter freundii                         JCM 2642
Citrobacter freundii                         JCM 2643
Citrobacter freundii                         JCM 2644
Citrobacter freundii                         JCM 2645
Citrobacter freundii                         JCM 2646
Citrobacter freundii                         JCM 2647
Citrobacter freundii                         JCM 2648
Citrobacter freundii                         JCM 2649
"Cohnella capsici"                           JCM 19168    Proposed type strain
"Comamonas faecalis"                         JCM 17561    Proposed type strain
"Cupriavidus yeoncheonense"                  JCM 19890    Proposed type strain
"Deinococcus puniceus"                       JCM 18576    Proposed type strain
"Deinococcus radioresistens"                 JCM 19777    Proposed type strain
"Deinococcus radioresistens"                 JCM 19778
"Deinococcus soli"                           JCM 19176    Proposed type strain
Delftia acidovorans                          JCM 2784
"Delftia deserti"                            JCM 30639    Proposed type strain
Desulfuromonas carbonis                      JCM 30471    Type strain
Dokdonia pacifica                            JCM 18216    Type strain
Eubacterium contortum                        JCM 6483     Type strain
"Ferruginibacter profundus"                  JCM 19431    Proposed type strain
Flaviaesturariibacter amylovorans            JCM 17919    Type strain
Flavirhabdus iliipiscaria                    JCM 18637    Type strain
Flavobacterium daemonensis                   JCM 19455    Type strain
"Flavobacterium panaciterrae"                JCM 19161    Proposed type strain
Flavobacterium qiangtangensis                JCM 19739    Type strain
"Flavobacterium shanxiense"                  JCM 30153    Proposed type strain
"Fusobacterium hwasookii"                    JCM 30218    Proposed type strain
"Fusobacterium hwasookii"                    JCM 30219
"Fusobacterium hwasookii"                    JCM 30220
"Fusobacterium hwasookii"                    JCM 30221
"Fusobacterium hwasookii"                    JCM 30222
Gibbsiella greigii                           JCM 30408    Type strain
Gibbsiella quercinecans                      JCM 30407    Type strain
Glaciihabitans tibetensis                    JCM 30778    Type strain
Glycomyces tarimensis                        JCM 30184    Type strain
"Gordonia jinhuaensis"                       JCM 30100    Proposed type strain
Grimontia hollisae                           JCM 1286
"Grimontia indica"                           JCM 17852    Proposed type strain
Hafnia psychrotolerans                       JCM 30077    Type strain
Helicobacter sp.                             JCM 30736
"Hymenobacter humi"                          JCM 19635    Proposed type strain
"Hymenobacter terrae"                        JCM 30007    Proposed type strain
Hymenobacter wooponensis                     JCM 19491    Type strain
Ichthyenterobacterium magnum                 JCM 18636    Type strain
"Idiomarina woeseii"                         JCM 19499    Proposed type strain
Janibacter indicus                           JCM 30779    Type strain
Jejuia pallidilutea                          JCM 19538
Jiella aquimaris                             JCM 30119    Type strain
Kangiella profundi                           JCM 30232    Type strain
"Kribbella qitaiheensis"                     JCM 30343    Proposed type strain
"Kushneria pakistanensis"                    JCM 18802    Proposed type strain
Lactobacillus apinorum                       JCM 30765    Type strain
Lactobacillus delbrueckii subsp. jakobsenii  JCM 30917    Type strain
Lactobacillus heilongjiangensis              JCM 30916    Type strain
Lactobacillus helsingborgensis               JCM 30766    Type strain
Lactobacillus helveticus                     JCM 30912
Lactobacillus kimbladii                      JCM 30767    Type strain
Lactobacillus kullabergensis                 JCM 30802    Type strain
Lactobacillus mellifer                       JCM 30768    Type strain
Lactobacillus mellis                         JCM 30769    Type strain
Lactobacillus melliventris                   JCM 30770    Type strain
Lactobacillus mixtipabuli                    JCM 19805    Type strain
Lactobacillus mixtipabuli                    JCM 19804
Lactobacillus mixtipabuli                    JCM 19806
Lactobacillus nenjiangensis                  JCM 30919    Type strain
Lactobacillus parabrevis                     JCM 30911    Type strain
Lactobacillus songhuajiangensis              JCM 30918    Type strain
"Lactobacillus vespulae"                     JCM 19742
Lactobacillus xiangfangensis                 JCM 30915    Type strain
Leeuwenhoekiella polynyae                    JCM 30387    Type strain
"Lentibacillus garicola"                     JCM 30131    Proposed type strain
"Leucobacter humi"                           JCM 18638    Proposed type strain
Leuconostoc mesenteroides subsp. suionicum   JCM 30910    Type strain
"Lysobacter fragariae"                       JCM 30322    Proposed type strain
"Lysobacter lycopersici"                     JCM 19164    Proposed type strain
"Lysobacter rhizosphaerae"                   JCM 30321    Proposed type strain
"Marinactinospora endophytica"               JCM 30293    Proposed type strain
Marinobacter nitratireducens                 JCM 18428    Type strain
Marivirga atlantica                          JCM 30305    Type strain
Marivita lacus                               JCM 19516    Type strain
Massilia eurypsychrophila                    JCM 30074    Type strain
"Mesorhizobium soli"                         JCM 19897    Proposed type strain
Methylobrevis pamukkalensis                  JCM 30229    Type strain
Methyloversatilis discipulorum               JCM 30542    Type strain
Microbacterium shaanxiense                   JCM 30164    Type strain
"Micromonospora harpali"                     JCM 30055    Proposed type strain
"Micromonospora palomenae"                   JCM 30056    Proposed type strain
Micromonospora polyrhachis                   JCM 30780    Type strain
Mucilaginibacter vulcanisilvae               JCM 30363    Type strain
Mycobacterium anyangense                     JCM 30275    Type strain
"Niabella thaonhiensis"                      JCM 18864    Proposed type strain
Nocardioides echinoideorum                   JCM 30276    Type strain
Nocardiopsis fildesensis                     JCM 30781    Type strain
Nonlabens sediminis                          JCM 19294
Nonlabens ulvanivorans                       JCM 19296
Nonlabens ulvanivorans                       JCM 19297
Nonlabens ulvanivorans                       JCM 19298
Nonomuraea fuscirosea                        JCM 30782    Type strain
Nonomuraea solani                            JCM 30783    Type strain
"Ochrovirga pacifica"                        JCM 18327    Proposed type strain
"Okibacterium endophyticum"                  JCM 30086    Proposed type strain
"Oricola cellulosilytica"                    JCM 19534    Proposed type strain
"Paenbacillus cucumis"                       JCM 19515    Proposed type strain
"Paenibacillus dauci"                        JCM 30283    Proposed type strain
Paenibacillus qingshengii                    JCM 30613    Type strain
Paenibacillus sp.                            JCM 30052
"Paenibacillus vini"                         JCM 19842    Proposed type strain
"Paenibacillus wulumuqiensis"                JCM 30284    Proposed type strain
"Paenibacillus yonginensis"                  JCM 19885    Proposed type strain
Paracoccus panacisoli                        JCM 30337    Type strain
Pediococcus argentinicus                     JCM 30771    Type strain
Pediococcus ethanolidurans                   JCM 30913    Type strain
Pediococcus stilesii                         JCM 30772    Type strain
"Pedobacter bambusae"                        JCM 19364    Proposed type strain
"Pedobacter edaphicus"                       JCM 30351    Proposed type strain
"Pedobacter seoulensis"                      JCM 19363    Proposed type strain
"Peptoniphilus mikwangii"                    JCM 30223    Proposed type strain
"Peptoniphilus rhinitidis"                   JCM 17448    Proposed type strain
"Peptoniphilus rhinitidis"                   JCM 17449
Phascolarctobacterium faecium                JCM 30894
Phascolarctobacterium faecium                JCM 30895
"Photobacterium panuliri"                    JCM 19199    Proposed type strain
Phycicoccus soli                             JCM 19837    Type strain
Pontibacter humi                             JCM 19178    Type strain
Ponticoccus lacteus                          JCM 30379    Type strain
Porphyromonas pasteri                        JCM 30531    Type strain
"Pseudoruegeria limi"                        JCM 19487    Proposed type strain
Psychrobacter oceani                         JCM 30235    Type strain
Pullulanibacillus pueri                      JCM 30075    Type strain
"Rhizobium capsici"                          JCM 19535    Proposed type strain
Salipiger nanhaiensis                        JCM 19383    Type strain
Sediminicola arcticus                        JCM 19894    Type strain
"Sinomonas mesophila"                        JCM 30094    Proposed type strain
"Sphingobacterium yamdrokense"               JCM 19397    Proposed type strain
"Sphingomonas aeria"                         JCM 19859    Proposed type strain
Sphingorhabdus pacificus                     JCM 30177    Type strain
"Streptomyces bohaiensis"                    JCM 19630    Proposed type strain
"Streptomyces lushanensis"                   JCM 19628    Proposed type strain
Streptosporangium nanhuense                  JCM 30784    Type strain
"Sulfurimonas hongkongensis"                 JCM 18418    Proposed type strain
"Thiobacillus prosperus"                     JCM 30709    Proposed type strain
"Vibrio panuliri"                            JCM 19500    Proposed type strain
Yersinia sp.                                 JCM 1678
Youngimonas vesicularis                      JCM 18819    Type strain

アーキア
Halocalculus aciditolerans                   JCM 19596    Type strain
Halocalculus aciditolerans                   JCM 19594
Halocalculus aciditolerans                   JCM 19595
Halococcus agarilyticus                      JCM 19592    Type strain
Halolamina sediminis                         JCM 30187    Type strain
Halomicroarcula salina                       JCM 18369    Type strain
Halorubrum gandharaense                      JCM 17823    Type strain
Halorubrum persicum                          JCM 30541    Type strain
Methanobacterium aggregans                   JCM 30569    Type strain
Sulfolobus solfataricus                      JCM 30930
Thermoproteus thermophilus                   JCM 17229    Type strain

真菌
Aspergillus arcoverdensis                    JCM 19878    ex-holotype strain
Aspergillus arcoverdensis                    JCM 19879
Aspergillus arcoverdensis                    JCM 19880
Aspergillus caatingaensis                    JCM 19242    ex-holotype strain
Aspergillus caatingaensis                    JCM 19243
Aspergillus huiyaniae                        JCM 19448    ex-holotype strain
Aspergillus huiyaniae                        JCM 19449
Aspergillus pernambucoensis                  JCM 19244    ex-holotype strain
Aspergillus pernambucoensis                  JCM 19245
Aspergillus pernambucoensis                  JCM 19246
Aspergillus pernambucoensis                  JCM 19247
Burgoa anomala                               JCM 30265
Burgoa anomala                               JCM 30266
Burgoa anomala                               JCM 30267
Burgoa anomala                               JCM 30268
Burgoa anomala                               JCM 30269
Mariannaea elegans var. punicea              JCM 19622
Mariannaea macrochlamydospora                JCM 19621    ex-holotype strain
Mortierella elongata                         JCM 30264
Ogataea sp.                                  JCM 24526
Pythium biforme                              JCM 30207    ex-holotype strain
Pythium biforme                              JCM 30208
Pythium brachiatum                           JCM 30210    ex-holotype strain
Pythium brachiatum                           JCM 30209
Pythium brachiatum                           JCM 30211
Pythium junctum                              JCM 30212    ex-holotype strain
Pythium junctum                              JCM 30213
Pythium junctum                              JCM 30214
Pythium junctum                              JCM 30215
Pythium utonaiense                           JCM 30206    ex-holotype strain


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https://jcm.brc.riken.jp/ja/catalogue

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発行
理化学研究所 バイオリソースセンター
微生物材料開発室 (JCM)
inquiry@jcm.riken.jp
https://jcm.brc.riken.jp/ja/
2015年10月07日
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