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RIKEN BioResource Center - Japan Collection of Microorganisms
JCM Mail News （電子メール版） No. 91
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理化学研究所 バイオリソースセンター 微生物材料開発室（JCM）
が公開している微生物等の最新情報をお届けします。
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● 今月のトピックス「微生物株受入れ時の遺伝子検査について」
● 新規公開微生物株（2015年5月公開）
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┃今月のトピックス「微生物株受入れ時の遺伝子検査について」
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JCMでは、新種候補株や論文投稿予定株、何らかの特徴的な機能を有する菌株
など、研究者の皆様が分離・解析された様々な微生物株の寄託・譲渡を受け付
けています。その数は年々増加傾向にあり、昨年度は約800の微生物株をご寄
託頂きました。今回は、微生物の寄託時に実施される検査（受入検査）につい
て紹介します。
寄託された微生物株は、菌株担当者により培養され、生残性、コロニー形態、
細胞形態、コンタミネーションの有無などが検査されます。また、JCMにて培養
された微生物株の細胞破砕液を用いてrRNA遺伝子領域等をPCR増幅した後に塩基
配列の一部を決定し、寄託者より提示された寄託株由来の配列情報と比較するこ
とで、菌株の同一性を確認します。これらの受入検査に合格した菌株は保存行程
に進められ、最終的に凍結乾燥標品や凍結保存標品が作成されます。受入検査に
おいては、寄託株の1割以上に何らかの問題が見出されており、寄託者への再寄
託を依頼するなどの措置を執っています。現在は全ての新規寄託株で遺伝子検査
を実施していますが、過去に保存された菌株の中には遺伝子検査未実施のものが
含まれており、今後順次遺伝子検査を進める予定です。
なお、JCMで実施している遺伝子検査の手順の詳細をJCMのホームページに掲載
していますので、下記リンク先をご参照下さい。
https://jcm.brc.riken.jp/ja/quality_control#dna
飯田敏也（遺伝子解析担当）
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┃ 新規公開微生物株（2015年5月公開）
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細菌
Actinotalea suaedae JCM 19624 Type strain
Aquibacillus salifodinae JCM 19761 Type strain
Cetia pacifica JCM 19563 Type strain
Chryseobacterium balustinum JCM 1278
Craurococcus roseus JCM 9933 Type strain
"Dactylosporangium sucinum" JCM 19831
Desulfovibrio biadhensis JCM 30146 Type strain
Frigoribacterium endophyticum JCM 30093 Type strain
Grimontia hollisae JCM 1285
Hymenobacter latericoloratus JCM 30327 Type strain
Hymenobacter luteus JCM 30328 Type strain
Hyunsoonleella pacifica JCM 17860 Type strain
Labedella endophytica JCM 30092 Type strain
Myroides injenensis JCM 17451 Type strain
Oerskovia enterophila JCM 21363 Type strain
Olsenella scatoligenes JCM 19907 Type strain
Parabacteroides faecis JCM 18682 Type strain
Pedobacter daejeonensis JCM 30352 Type strain
Pedobacter trunci JCM 30353 Type strain
Rhodanobacter koreensis JCM 19614 Type strain
Rhodococcus soli JCM 19627 Type strain
Romboutsia sedimentorum JCM 19607 Type strain
Sporolactobacillus shoreae JCM 19541 Type strain
Sporolactobacillus spathodeae JCM 19542 Type strain
Vibrio tritonius JCM 16456 Type strain
Vibrio tritonius JCM 16457
Vibrio tritonius JCM 16458
Vibrio tritonius JCM 16459
アーキア
Methanosarcina subterranea JCM 15540 Type strain
真菌
Candida subhashii JCM 30101
Cryptococcus terricola JCM 24517
Scheffersomyces sp. JCM 30102
Yarrowia sp. JCM 30162
Yarrowia sp. JCM 30163
詳細は以下のサイトから検索できますのでご利用ください。
https://jcm.brc.riken.jp/ja/catalogue
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発行
理化学研究所 バイオリソースセンター
微生物材料開発室 (JCM)
inquiry@jcm.riken.jp
https://jcm.brc.riken.jp/ja/
2015年6月16日
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