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RIKEN BioResource Center - Japan Collection of Microorganisms
JCM Mail News （電子メール版） No. 80
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独立行政法人 理化学研究所 バイオリソースセンター 微生物材料開発室（JCM）
が公開している微生物等の最新情報をお届けします。
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● NBRPゲノム情報等整備プログラムで解読したJCM株のゲノム情報の公開
について
● 今月のリソース紹介「脂肪酸を蓄積する酵母：その2」
● 新規公開微生物株（2014年4-5月公開）
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┃ NBRPゲノム情報等整備プログラムで解読したJCM株のゲノム情報の公開
┃ について
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JCMでは、平成24年度のNBRPゲノム情報等整備プログラムに採択され、環境と
健康の様々な研究に有用な多様な細菌およびアーキアの約300株について、ドラ
フトゲノム解析を東京大学新領域オーミクス情報センターと共同で実施しました。
これらの解析ゲノム情報を公開していますのでご利用ください。また、同時に解
析に供したゲノムDNAも提供しておりますのでご利用ください。
詳細は以下のサイトをご覧ください。
https://jcm.brc.riken.jp/en/nbrplist_e
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┃ 今月のリソース紹介「脂肪酸を蓄積する酵母：その2」
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メールニュースのNo. 67で「脂肪酸を蓄積する酵母Rhodosporidium
toruloides」をご紹介しましたが、今回はその続報です。
Cryptococcus podzolicusは広く土壌に棲息する酵母です。本酵母が脂肪酸
を蓄積することは知られていなかったのですが、Tanimuraらはスクリーニングの
結果、いわゆる油糧酵母と呼ばれる脂肪酸蓄積能を有している種と比較して同等
もしくはそれ以上の蓄積能をもつことを報告しました（文献1）。また、
Cryptococcus terricolaは脂肪酸を蓄積することが1960年代に報告されている
酵母ですが、この度デンプンを原料として直接油脂を蓄積できることが報告され
ました（文献2）。
研究に使用された菌株は以下のJCM番号で公開していますので、どうぞご利用
ください。
菌株：
JCM 24502、JCM 24503、JCM 24504、JCM 24505、JCM 24506、JCM 24507、
JCM 24508、JCM 24509、JCM 24510、JCM 24511、JCM 24512、JCM 24513、
JCM 24514、JCM 24515、JCM 24516、JCM 24518、JCM 24519、JCM 24520、
JCM 24521、JCM 24522、JCM 24523
文献：
1）Tanimura et al. 2014. Selection of oleaginous yeasts with high lipid
productivity for practical biodiesel production. Bioresour. Technol.
153: 230-235. PMID: 24368271.
2）Tanimura et al. 2014. Cryptococcus terricola is a promising
oleaginous yeast for biodiesel production from starch through
consolidated bioprocessing. Sci. Rep. 24: 4776. PMID: 24758986.
高島昌子（リソース事業推進担当）
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┃ 新規公開微生物株（2014年4-5月公開）
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細菌
Achromobacter sp. JCM 18799
Aerococcus vaginalis JCM 19163 Type strain
Agrobacterium sp. JCM 17895
"Algivirga pacifica" JCM 18326 Proposed type strain
Aliidiomarina shirensis JCM 17761 Type strain
"Anoxybacillus suryakundensis" JCM 19211 Proposed type strain
Aquipuribacter hungaricus JCM 19543 Type strain
Arthrobacter cupressi JCM 19662 Type strain
Bacillus ligniniphilus JCM 18543 Type strain
Bacillus niacini JCM 19735
Bacillus panacisoli JCM 19226 Type strain
Bacteroides luti JCM 19020 Type strain
Barrientosiimonas humi JCM 19663 Type strain
Bifidobacterium moukalabense JCM 18751 Type strain
"Borrelia yangtze" JCM 17189
Brachybacterium saurashtrense JCM 19544 Type strain
Bradyrhizobium ganzhouense JCM 19881 Type strain
Burkholderia eburnea JCM 18070 Type strain
Burkholderia sp. JCM 18069
Butyrivibrio fibrisolvens JCM 6563 Type strain
Caenispirillum salinarum JCM 17360 Type strain
Caulobacter profunda JCM 19440 Type strain
Caulobacter profunda JCM 19441
Cellulomonas carbonis JCM 19664 Type strain
Cellulomonas phragmiteti JCM 19545 Type strain
Chryseobacterium camelliae JCM 18745 Type strain
Cryobacterium arcticum JCM 19546 Type strain
Enterococcus diestrammenae JCM 18359 Type strain
"Erythrobacter westpacificensis" JCM 18014 Proposed type strain
"Flavobacterium anseonense" JCM 17070 Proposed type strain
Frigoribacterium mesophilum JCM 19547 Type strain
"Geobacter sulfurreducens subsp. ethanolicus"
JCM 18752 Proposed type strain
Georgenia muralis JCM 19733
"Gracilibacillus pakistanensis" JCM 18860
Halolactibacillus sp. JCM 19043
Herpetosiphon sp. JCM 19918
Intrasporangium mesophilum JCM 19548 Type strain
Isoptericola nanjingensis JCM 19549 Type strain
Janibacter alkaliphilus JCM 19550 Type strain
"Kouleothrix aurantiaca" JCM 19913
"Kouleothrix aurantiaca" JCM 19914
"Kouleothrix aurantiaca" JCM 19915
"Kouleothrix aurantiaca" JCM 19916
"Kouleothrix aurantiaca" JCM 19917
Laceyella putida JCM 19734
Leifsonia psychrotolerans JCM 19551 Type strain
"Litorilituus sediminis" JCM 17549 Proposed type strain
Luteimicrobium xylanilyticum JCM 18090 Type strain
Lysinibacillus parviboronicapiens JCM 18861 Type strain
"Marinilabilia nitratireducens" JCM 17679 Proposed type strain
Marisediminicola antarctica JCM 19552 Type strain
Methylomonas lenta JCM 19378 Type strain
"Microbacterium jejuense" JCM 18734
"Microbacterium kyungheense" JCM 18735
Microbacterium marinum JCM 19665 Type strain
Microbacterium neimengense JCM 19553 Type strain
Microbacterium sediminis JCM 19554 Type strain
Microbispora hainanensis JCM 19666 Type strain
Myceligenerans halotolerans JCM 19555 Type strain
Nesterenkonia halophila JCM 19556 Type strain
Nesterenkonia suensis JCM 19557 Type strain
Nitrosomonas sp. JCM 17640
Nocardioides hungaricus JCM 19558 Type strain
Nocardioides lianchengensis JCM 19667 Type strain
Nocardioides sediminis JCM 19559 Type strain
Nocardioides szechwanensis JCM 19669 Type strain
Paenibacillus relictisesami JCM 18068 Type strain
Phytomonospora endophytica JCM 19147 Type strain
Prevotella heparinolytica JCM 16133 Type strain
Promicromonospora endophytica JCM 19560 Type strain
Promicromonospora xylanilytica JCM 19561 Type strain
Ramlibacter solisilvae JCM 19319 Type strain
Robertkochia marina JCM 18552 Type strain
Sphingobacterium ginsenosidimutans JCM 16722 Type strain
Sphingomonas daechungensis JCM 17887 Type strain
"Sphingomonas ginsenosidivorax" JCM 17076 Proposed type strain
"Sphingomonas kyeonggiense" JCM 18825 Proposed type strain
Sphingomonas yantingensis JCM 19201 Type strain
"Sporomusa intestinalis" JCM 13218 Proposed type strain
"Staphylococcus lipolyticus" JCM 16560 Proposed type strain
"Steroidobacter agariperforans" JCM 18477 Proposed type strain
Streptomyces barkulensis JCM 18754 Type strain
Streptomyces bullii JCM 19671 Type strain
Streptomyces chlorus JCM 19672 Type strain
Streptomyces deserti JCM 19673 Type strain
Streptomyces fukangensis JCM 19127 Type strain
Streptomyces heilongjiangensis JCM 19675 Type strain
Streptomyces incanus JCM 19677 Type strain
Streptomyces pratens JCM 19679 Type strain
Streptomyces qinglanensis JCM 19680 Type strain
Streptomyces tunisiensis JCM 17589 Type strain
Taibaiella koreensis JCM 18823 Type strain
Tamlicoccus marinus JCM 19562 Type strain
Terrimicrobium sacchariphilum JCM 17479 Type strain
Thalassotalea piscium JCM 18590 Type strain
Thermus antranikianii JCM 19900 Type strain
Thermus composti JCM 19902 Type strain
Thermus igniterrae JCM 19899 Type strain
Thermus islandicus JCM 19901 Type strain
Unidentified bacterium JCM 19314
Vallitalea pronyensis JCM 18391 Type strain
Verrucosispora qiuiae JCM 19682 Type strain
Wohlfahrtiimonas larvae JCM 18424 Type strain
Xenorhabdus ishibashii JCM 16258
Xiangella phaseoli JCM 19683 Type strain
アーキア
Halomicroarcula limicola JCM 18640 Type strain
Halorubrum rubrum JCM 18365 Type strain
Metallosphaera sedula JCM 19967
Methanobacterium movilense JCM 18470 Type strain
Methanomethylovorans uponensis JCM 19217 Type strain
Salinarubrum litoreum JCM 18649 Type strain
真菌
Cryptococcus terricola JCM 24514
Cryptococcus terricola JCM 24515
Cryptococcus terricola JCM 24516
Cryptococcus terricola JCM 24518
Cryptococcus terricola JCM 24519
Cryptococcus terricola JCM 24520
Cryptococcus terricola JCM 24521
Cryptococcus terricola JCM 24522
Cryptococcus terricola JCM 24523
詳細は以下のサイトから検索できますのでご利用ください。
https://jcm.brc.riken.jp/ja/catalogue
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(inquiry@jcm.riken.jp)まで「メールニュース不要」の旨をご連絡下さい。
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https://jcm.brc.riken.jp/ja/mailnews
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発行
独立行政法人 理化学研究所 バイオリソースセンター
微生物材料開発室 (JCM)
inquiry@jcm.riken.jp
http://jcm.brc.riken.jp/
2014年6月17日
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