JCM Mail News No. 71

*************************************************************
RIKEN BioResource Center - Japan Collection of Microorganisms
            JCM Mail News (電子メール版) No. 71
*************************************************************

独立行政法人 理化学研究所 バイオリソースセンター 微生物材料開発室(JCM)
が公開している微生物等の最新情報をお届けします。

━━━━ 目 次 ━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━
● 今月のリソース紹介「皮膚常在細菌Propionibacterium acnesの臨床
 分離株について」
● 日本微生物資源学会第20回大会 開催のお知らせ
● 新規公開微生物株(2013年4-5月公開)
━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━
┏━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━
┃ 今月のリソース紹介「皮膚常在細菌Propionibacterium acnesの臨床分離株
┃ について」
┗━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━
 皮膚常在細菌であるPropionibacterium acnesの基準株は、これまで多くの
方々に提供され利用されてきました。JCMからの提供株数では第5位の実績となっ
ています。JCMではP. acnesの基準株以外に参考株として2株だけをこれまで公
開してきました。最近、皮膚科医である出来尾 格博士(Public Health England)
のご好意により、P. acnesの臨床分離株21株を収集することができました。こ
れら収集株の保存と16S rRNA遺伝子配列による同定確認が終了し、全21株(JCM
18907-18927)の公開をはじめました。これらの菌株は健常人あるいはアトピー
性皮膚炎の患者の様々な部位から分離されており、JCM 18919 および JCM
18925株のように細胞形態がユニークな菌株も存在します。これを機に、オンラ
インカタログ上の写真掲載もはじめましたのでご覧ください。また、これらの菌
株は Multilocus Sequence Typing により遺伝的多様性も明らかとなってい
ます。是非この機会にご利用ください。

参考文献
Dekio et al. 2012. Genetic diversity of Propionibacterium acnes strains
isolated from human skin in Japan and comparison with their distribution
in Europe. J. Med. Microbiol. 61: 622-630. DOI:10.1099/jmm.0.040949-0.

坂本 光央(嫌気性細菌担当)

┏━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━
┃  日本微生物資源学会第20回大会 開催のお知らせ
┗━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━
 下記の日程で開催される日本微生物資源学会大会を、本年度はJCMが事務局と
して担当することになりました。大会では、一般講演やポスター発表の他、実務
ワークショップ「カルチャーコレクションの生物多様性条約(CBD)への取り組み
方」と、またシンポジウム「微生物ゲノムと研究基盤」も行われます。皆様のご
参加を心よりお待ち申し上げております。

会 期:平成25年6月27日(木)~ 28日(金)
会 場:つくば国際会議場 つくばエクスプレス つくば駅 徒歩10分

プログラムなどの詳細はこちらをご覧ください。
 http://www.jscc-home.jp/

┏━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━
┃  新規公開微生物株(2013年4-5月公開)
┗━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━
細菌
Acinetobacter beijerinckii            JCM 18990  Type strain
Acinetobacter bouvetii                JCM 18991  Type strain
Aliivibrio fischeri                   JCM 18803  Type strain
Alkalibacterium gilvum                JCM 18271  Type strain
Altererythrobacter gangjinensis       JCM 17802  Type strain
Amphibacillus marinus                 JCM 17099  Type strain
Aquimarina gracilis                   JCM 17453  Type strain
Aquimarina longa                      JCM 17859  Type strain
Ardenticatena maritima                JCM 17282
Aureimonas ferruginea                 JCM 18444
Aureimonas rubiginis                  JCM 18445
Bacillus ginsengisoli                 JCM 17335  Type strain
Bartonella acomydis                   JCM 17706  Type strain
Bartonella acomydis                   JCM 17707
Bartonella callosciuri                JCM 17708
Bartonella callosciuri                JCM 17709  Type strain
Bartonella jaculi                     JCM 17712  Type strain
Bartonella jaculi                     JCM 17713
Bradyrhizobium sp.                    JCM 18382
Brumimicrobium mesophilum             JCM 14063  Type strain
Burkholderia sp.                      JCM 15050
Catenibacterium mitsuokai             JCM 10610
Catenibacterium mitsuokai             JCM 10611
Cedecea sp.                           JCM 17994
Chromobacterium sp.                   JCM 15051
Chryseobacterium rigui                JCM 18078  Type strain
Citrobacter sp.                       JCM 17993
Collinsella aerofaciens               JCM 10775
Collinsella aerofaciens               JCM 10826
Collinsella intestinalis              JCM 10643  Type strain
Collinsella intestinalis              JCM 10644
Cytophaga sp.                         JCM 11541
Dokdonella immobilis                  JCM 15763  Type strain
"Echinicola shivajiensis"             JCM 17847  Proposed type strain
Enterobacer sp.                       JCM 17987
Enterobacter sp.                      JCM 17988
Enterobacter sp.                      JCM 17989
Enterobacter sp.                      JCM 17990
Erythrobacter jejuensis               JCM 16677  Type strain
Halomonas cibimaris                   JCM 16914  Type strain
Halomonas cibimaris                   JCM 16915
Hymenobacter arizonensis              JCM 13504  Type strain
Kushneria avicenniae                  JCM 18993  Type strain
Lactobacillus amylovorus              JCM 14931
Listeria monocytogenes                JCM 2873
"Lysinibacillus pakistanensis"        JCM 18776  Proposed type strain
Lysobacter oligotrophicus             JCM 18257
Marinivirga aestuarii                 JCM 16845
Microbacterium immunditiarum          JCM 14034  Type strain
Microbulbifer gwangyangensis          JCM 17800  Type strain
Microbulbifer pacificus               JCM 14507  Type strain
Mycobacterium iranicum                JCM 17461  Type strain
Nocardioides sp.                      JCM 18899
Oceanobacillus polygoni               JCM 17252
Paracoccus limosus                    JCM 17370  Type strain
Pedobacter ginsengiterrae             JCM 17338  Type strain
Pedobacter luteus                     JCM 16317
Pedobacter luteus                     JCM 16318  Type strain
Polynucleobacter acidiphobus          JCM 18220
Polynucleobacter sp.                  JCM 18219
Propionibacterium acnes               JCM 18913
Propionibacterium acnes               JCM 18914
Propionibacterium acnes               JCM 18915
Propionibacterium acnes               JCM 18916
Propionibacterium acnes               JCM 18917
Propionibacterium acnes               JCM 18918
Propionibacterium acnes               JCM 18919
Propionibacterium acnes               JCM 18920
Propionibacterium acnes               JCM 18921
Propionibacterium acnes               JCM 18922
Propionibacterium acnes               JCM 18923
Propionibacterium acnes               JCM 18924
Propionibacterium acnes               JCM 18925
Propionibacterium acnes               JCM 18926
Propionibacterium acnes               JCM 18927
Propionibacterium granulosum          JCM 6497
Pseudoalteromonas arabiensis          JCM 17292  Type strain
Pseudomonas putida                    JCM 18798
Pseudomonas sp.                       JCM 17996
"Rhizobium halotolerans"              JCM 17536  Proposed type strain
"Rhizobium qilianshanense"            JCM 18337  Proposed type strain
Rhodococcus baikonurensis             JCM 18801
Rhodococcus sp.                       JCM 17957
"Saccharomonospora oceani"            JCM 18128  Proposed type strain
Sediminibacterium ginsengisoli        JCM 15794  Type strain
Serratia sp.                          JCM 17991
Sphingomonas sp.                      JCM 18016
Sphingopyxis rigui                    JCM 17509  Type strain
Sphingopyxis wooponensis              JCM 17547  Type strain
Streptomyces ziwulingensis            JCM 18081  Type strain
Syntrophus aciditrophicus             JCM 18717  Type strain
Tepidimonas sp.                       JCM 11420
"Thermopirellula anaerolimosa"        JCM 17478  Proposed type strain
"Thiodictyon syntrophicum"            JCM 15483  Proposed type strain
Trabulsiella sp.                      JCM 17992
Unidentified bacterium                JCM 18064
Unidentified bacterium                JCM 18065
Unidentified bacterium                JCM 18223
Veillonella tobetsuensis              JCM 17976  Type strain
Verrucomicrobium spinosum             JCM 18804  Type strain
Vibrio sp.                            JCM 17658
Weissella oryzae                      JCM 18190
Weissella oryzae                      JCM 18191  Type strain

アーキア
"Halalkalicoccus paucihalophilus"     JCM 17505  Proposed type strain
Halopiger salifodinae                 JCM 18547

真菌
Ambrosiozyma monospora                JCM 7599
Bensingtonia yamatoana                JCM 5652
Candida deformans                     JCM 2337
Candida oleophila                     JCM 2315   Type strain
Candida tepae                         JCM 10285  Type strain
Candida tepae                         JCM 10286  Type strain
Cryptococcus vishniacii               JCM 9422   Type strain
Kazachstania exigua                   JCM 5181   Type strain
Lachancea thermotolerans              JCM 19085  Type strain
Lipomyces konkoae                     JCM 6012
Lipomyces sp.                         JCM 6013
Lipomyces starkeyi                    JCM 6011
Magnusiomyces ovetensis               JCM 3706   Type strain
Nadsonia fulvescens var. elongata     JCM 19185
Pichia sp.                            JCM 16751
Saccharomycopsis javanensis           JCM 7602   Type strain
Saccharomycopsis sp.                  JCM 16742
Scheffersomyces segobiensis           JCM 7659   Type strain
Sporobolomyces carnicolor             JCM 16284
Sporobolomyces carnicolor             JCM 16298
Sporobolomyces corallinus             JCM 17889
Sporobolomyces koalae                 JCM 16299
Sporobolomyces koalae                 JCM 16300
Sporobolomyces koalae                 JCM 16301
Sporobolomyces patagonicus            JCM 16287
Sporobolomyces patagonicus            JCM 16288
Sporobolomyces phaffii                JCM 16285
Sporobolomyces phaffii                JCM 16286
Sporobolomyces productus              JCM 17890
Sporobolomyces productus              JCM 17891
Sporobolomyces roseus                 JCM 16289
Sporobolomyces roseus                 JCM 16290
Sporobolomyces roseus                 JCM 16291
Sporobolomyces ruberrimus             JCM 16303
Sporobolomyces ruberrimus             JCM 16304
Sporobolomyces sp.                    JCM 16292
Sporobolomyces sp.                    JCM 16293
Sporobolomyces sp.                    JCM 16294
Sporobolomyces sp.                    JCM 16295
Sporobolomyces sp.                    JCM 16296
Wickerhamomyces silvicola             JCM 8048
Xanthophyllomyces dendrorhous         JCM 19184
Yamadazyma mexicana                   JCM 7658   Type strain
Yamadazyma philogaea                  JCM 7657   Type strain

微細藻類
Prototheca zopfii var. portoricensis  JCM 9347

詳細は以下のサイトから検索できますのでご利用ください。
http://www.jcm.riken.jp/JCM/catalogue_J.shtml

------------------------
※ メールでの情報提供受信を中止されたい場合は、微生物材料開発室
  (inquiry@jcm.riken.jp)まで「メールニュース不要」の旨をご連絡下さい。
※ 当メールへのご質問などは、微生物材料開発室(inquiry@jcm.riken.jp)
  までお送り下さい。
※ 当メールニュース受信者各位機関のサーバーメインテナンス等によりメール
  ニュースをお届けできない場合でも、メールニュースの再発行は行いません。
  発行済みのメールニュースは当開発室のwebサイトで公開しておりますので
  そちらをご覧下さい。
  http://www.jcm.riken.jp/JCM/mailnews.shtml
※ 本メールに記載された内容は予告することなく変更することがあります。
※ 本メールに掲載された記事を許可なく複製・転載することを禁止します。
_____________________________________________
発行
独立行政法人 理化学研究所 バイオリソースセンター
微生物材料開発室 (JCM)
inquiry@jcm.riken.jp
http://www.jcm.riken.jp/
2013年6月6日
_____________________________________________


コメントは受け付けていません。