********************************************************* RIKEN BioResource Center - Japan Collection of Microorganisms JCM Mail News (電子メール版) No. 62 ********************************************************* 独立行政法人 理化学研究所 バイオリソースセンター 微生物材料開発室(JCM) が公開している微生物等の最新情報をお届けします。 ━━━━ 目 次 ━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━ ● 2011年度の事業報告 ● 理化学研究所一般公開のお知らせ ● 今月のリソース紹介「臨床分離Nocardia属菌株の提供について」 ● 新規公開微生物株(2012年2-3月公開) ━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━ ┏━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━ ┃ 2011年度の事業報告 ┗━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━ 2011年度は、679株を収集・登録し、年度末での保有数は20,708株となりまし た。このうち13,853株を即時ご利用可能なものとして公開しております。 細菌およびアーキアの新種を提唱する場合に必要となる「寄託ならびに公開 の証明書」につきましては、2011年度は313通を発行いたしました。細菌・アー キアの基準株の年間寄託数で世界2位となっております。このように、JCMの微 生物株は研究者の皆様から貴重な微生物株を寄託・譲渡いただいたものです。 この場を借りまして厚く御礼申し上げます。 また、2011年度は3,272株を提供させていただきました。このうち、22%の株 は国外へ、20%は企業など営利機関への提供でした。ご利用いただき誠にあり がとうございました。 JCM株をご利用いただいた研究論文は、2011年に310報以上が発表されました。 このように皆様のお役に立てたことは、JCMにとりましては大変嬉しいことであ り、高い評価を受けております。 2012年度も皆様のお役に立てるよう室員一同で努めてまいります。皆様の一 層のご支援をいただければ幸いです。 大熊 盛也(室長) ┏━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━ ┃ 理化学研究所一般公開のお知らせ ┗━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━ 理化学研究所の一般公開が行われます。皆様のご来場をお待ちしております。 筑波研究所 4月20日(金)13:00 - 16:00 および 21日(土)10:00 - 16:00 詳細は< http://rtcweb.rtc.riken.jp/openhouse24/index.html > 和光研究所 4月21日(土)9:30 - 16:30(入場は16:00まで) 詳細は< http://www.riken.jp/r-world/event/2012/open/wako/index.html > ┏━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━ ┃ 今月のリソース紹介「臨床分離Nocardia属菌株の提供について」 ┗━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━ Nocardia属は土壌中に広く分布する好気性放線菌で、創傷の土壌による汚染や 吸入、経口摂取により体内に侵入し、肺や脳、皮膚などにノカルジア症 (Nocardiosis) と呼ばれる日和見感染症を引き起こすことで知られています。 構成する種として現在80余りが正式に命名されており、JCMではこれまで基準株 を中心にほぼ全種について収集、保存、公開を行なってきました。本属に対し ては医学的見地からの関心も高いため、臨床分野で特に重要となる種の参考株 の充実を図ることとし、千葉大学真菌医学研究センターの協力を得て国内外の 臨床分離株60株を収集しました。これら収集株の保存と16S rRNA遺伝子の塩基 配列による同定確認・再同定が完了しましたので近日中に公開致します。種の 構成は、N. farcinica 14株、N. brasiliensis 12株、N. otitidiscaviarum 10株、N. nova 7株、N. elegans, N. aobensis 各3株、N. abscessus, N. exalbida, N. transvalensis 各2株、N. carnea, N. cyriacigeorgica 各1株, Nocardia sp. 3株となっています。なお、本属の基準種であり、臨床的にも重 要とされるN. asteroidesは従来よりヘテロな菌群(N. asteroides complex とも呼ばれる)とされてきましたが、遺伝的手法の導入により再分類が進み、 かつてN. asteroidesと同定されていた菌株の大半が類似の生理生化学的性状を 示す他の種に属すると考えられています。今回公開する分離株の中にも当初N. asteroidesと同定されていた菌株がいくつか含まれますが、遺伝子検査の結果、 そのすべてがN. abscessus, N. aobensis, N. carnea, N. cyriacigeorgica, N. exalbida, N. farcinica, N. nova などに同定されました。公開となりまし たら < http://www.jcm.riken.jp/cgi-bin/jcm/new_jcm_strains > にリストさ れますのでご確認下さい。 工藤 卓二(放線菌担当) ┏━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━ ┃ 新規公開微生物株(2012年2-3月公開) ┗━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━ 細菌 Actinoallomurus radicium JCM 17294 Type strain Actinomycetospora chlora JCM 17979 Type strain Actinomycetospora cinnamomea JCM 17980 Type strain Actinomycetospora lutea JCM 17982 Type strain Actinomycetospora straminea JCM 17983 Type strain Actinomycetospora succinea JCM 17984 Type strain Algoriphagus jejuensis JCM 16112 Type strain Amycolatopsis halophila JCM 18118 Type strain "Azospirillum formosense" JCM 17639 Type strain* Bradyrhizobium japonicum JCM 10833 Brevibacterium massiliense JCM 18108 Type strain Clostridium septicum JCM 7304 Clostridium septicum JCM 7305 Clostridium septicum JCM 7306 Clostridium septicum JCM 7307 Clostridium septicum JCM 7309 Clostridium septicum JCM 7311 Clostridium sp. JCM 10513 Clostridium sp. JCM 10514 Clostridium sp. JCM 10515 Clostridium sp. JCM 10516 Clostridium sp. JCM 10517 Clostridium sp. JCM 10518 Clostridium sp. JCM 10519 Clostridium sp. JCM 10522 Corallibacter vietnamensis JCM 17525 Type strain Corynebacterium glutamicum JCM 18229 Defluviitalea saccharophila JCM 16312 Type strain "Deinococcus guangxiensis" JCM 15082 Proposed type strain Dietzia aurantiaca JCM 17645 Type strain Hasllibacter halocynthiae JCM 16214 Type strain Knoellia locipacati JCM 17313 Type strain Lentibacillus halodurans JCM 12770 Type strain Loktanella tamlensis JCM 14020 Type strain Methylotenera versatilis JCM 17579 Type strain Microbulbifer marinus JCM 17211 Type strain Microbulbifer yueqingensis JCM 17212 Type strain Micrococcus luteus JCM 17588 Mycobacterium mantenii JCM 18113 Type strain Mycobacterium novocastrense JCM 18114 Type strain Mycobacterium vulneris JCM 18115 Type strain Natribacillus halophilus JCM 15649 Type strain "Nonlabens agnitus" JCM 17109 Proposed type strain Phascolarctobacterium succinatutens JCM 16074 Type strain Phascolarctobacterium succinatutens JCM 16075 Prevotella sp. JCM 6348 Propionibacterium acnes JCM 6495 Pseudoclavibacter caeni JCM 16921 Type strain Psychrobacter jeotgali JCM 11464 "Rhodanobacter denitrificans" JCM 17641 Type strain* "Rhodanobacter denitrificans" JCM 17642 "Rhodococcus canchipurensis" JCM 17578 Type strain* Rhodopirellula baltica JCM 17613 Rhodopirellula baltica JCM 17614 Rhodopirellula baltica JCM 17622 Rhodopirellula baltica JCM 17624 Saccharopolyspora cebuensis JCM 18116 Type strain Spinactinospora alkalitolerans JCM 16559 Type strain Stackebrandtia albiflava JCM 18122 Type strain Streptomonospora halophila JCM 18123 Type strain Tenacibaculum jejuense JCM 15975 Type strain "Thermotomaculum hydrothermale" JCM 17643 Proposed type strain アーキア Haloarcula sp. JCM 10920 Haloarcula sp. JCM 10921 Haloarcula sp. JCM 10922 Haloarcula sp. JCM 10923 Haloarcula sp. JCM 10926 Haloarcula sp. JCM 10942 Haloarcula sp. JCM 10943 Halobacterium sp. JCM 10928 Haloterrigena sp. JCM 10929 Haloterrigena sp. JCM 10930 Haloterrigena sp. JCM 10931 Haloterrigena sp. JCM 10932 Haloterrigena sp. JCM 10933 Haloterrigena sp. JCM 10934 Natrialba sp. JCM 10936 Natrialba sp. JCM 10937 真菌 Bensingtonia yamatoana JCM 10406 Bullera oryzae JCM 13707 Bullera setariae JCM 13774 Bullera sp. JCM 13716 Bullera sp. JCM 13719 Bullera sp. JCM 13722 Bullera sp. JCM 13726 Bullera sp. JCM 13727 Bullera sp. JCM 13728 Bullera sp. JCM 13731 Bullera sp. JCM 13732 Bullera sp. JCM 13735 Bullera sp. JCM 13770 Bullera sp. JCM 13784 Bullera sp. JCM 13801 Candida digboiensis JCM 12330 Type strain Candida digboiensis JCM 12331 Candida easanensis JCM 12477 Candida magnoliae JCM 9432 Candida magnoliae JCM 9433 Candida magnoliae JCM 9434 Candida magnoliae JCM 9435 Candida magnoliae JCM 9538 Candida magnoliae JCM 9539 Candida magnoliae JCM 9540 Candida magnoliae JCM 9541 Candida sp. JCM 14994 Candida sp. JCM 15013 Candida sp. JCM 15017 Candida sp. JCM 15018 Candida sp. JCM 16738 Candida sp. JCM 16747 Candida sp. JCM 16754 Candida sp. JCM 16758 Cryptococcus sp. JCM 13706 Derxomyces sp. JCM 13782 Derxomyces yunnanensis JCM 13713 Nadsonia fulvescens var. fulvescens JCM 10023 Pichia sp. JCM 16750 Pseudozyma sp. JCM 13705 Saccharomycopsis sp. JCM 16741 Sporobolomyces lactosus JCM 10082 Type strain Sporobolomyces sp. JCM 10843 Sporobolomyces sp. JCM 10844 Sporobolomyces sp. JCM 10845 Sporobolomyces sp. JCM 10846 Sporobolomyces sp. JCM 10847 Sporobolomyces sp. JCM 13703 Sporobolomyces sp. JCM 13708 Sporobolomyces sp. JCM 13712 Sporobolomyces sp. JCM 13714 Sporobolomyces sp. JCM 13718 Sporobolomyces sp. JCM 13723 Sporobolomyces sp. JCM 13740 Sporobolomyces sp. JCM 13763 Sporobolomyces sp. JCM 13769 Sporobolomyces sp. JCM 13776 Tilletiopsis sp. JCM 13704 Unidentified yeast JCM 13709 Unidentified yeast JCM 13710 Unidentified yeast JCM 13711 Unidentified yeast JCM 13715 Unidentified yeast JCM 13717 Unidentified yeast JCM 13720 Wickerhamomyces sp. JCM 16752 *, 原著論文は印刷中 詳細は以下のサイトから検索できますのでご利用ください。 http://www.jcm.riken.jp/JCM/catalogue_J.shtml ------------------------ ※ メールでの情報提供受信を中止されたい場合は、微生物材料開発室 (inquiry@jcm.riken.jp)まで「メールニュース不要」の旨をご連絡下さい。 ※ 当メールへのご質問などは、微生物材料開発室(inquiry@jcm.riken.jp) までお送り下さい。 ※ 当メールニュース受信者各位機関のサーバーメインテナンス等によりメール ニュースをお届けできない場合でも、メールニュースの再発行は行いません。 発行済みのメールニュースは当開発室のwebサイトで公開しておりますので そちらをご覧下さい。 http://www.jcm.riken.jp/JCM/mailnews.shtml ※ 本メールに記載された内容は予告することなく変更することがあります。 ※ 本メールに掲載された記事を許可なく複製・転載することを禁止します。 _____________________________________________ 発行 独立行政法人 理化学研究所 バイオリソースセンター 微生物材料開発室 (JCM) inquiry@jcm.riken.jp http://www.jcm.riken.jp/ 2012年4月19日 _____________________________________________