JCM Mail News No. 62

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RIKEN BioResource Center - Japan Collection of Microorganisms
            JCM Mail News (電子メール版) No. 62
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独立行政法人 理化学研究所 バイオリソースセンター 微生物材料開発室(JCM)
が公開している微生物等の最新情報をお届けします。

━━━━ 目 次 ━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━
● 2011年度の事業報告
● 理化学研究所一般公開のお知らせ
● 今月のリソース紹介「臨床分離Nocardia属菌株の提供について」
● 新規公開微生物株(2012年2-3月公開)
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┃  2011年度の事業報告
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 2011年度は、679株を収集・登録し、年度末での保有数は20,708株となりまし
た。このうち13,853株を即時ご利用可能なものとして公開しております。
 細菌およびアーキアの新種を提唱する場合に必要となる「寄託ならびに公開
の証明書」につきましては、2011年度は313通を発行いたしました。細菌・アー
キアの基準株の年間寄託数で世界2位となっております。このように、JCMの微
生物株は研究者の皆様から貴重な微生物株を寄託・譲渡いただいたものです。
この場を借りまして厚く御礼申し上げます。
 また、2011年度は3,272株を提供させていただきました。このうち、22%の株
は国外へ、20%は企業など営利機関への提供でした。ご利用いただき誠にあり
がとうございました。
 JCM株をご利用いただいた研究論文は、2011年に310報以上が発表されました。
このように皆様のお役に立てたことは、JCMにとりましては大変嬉しいことであ
り、高い評価を受けております。
 2012年度も皆様のお役に立てるよう室員一同で努めてまいります。皆様の一
層のご支援をいただければ幸いです。

大熊 盛也(室長)

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┃  理化学研究所一般公開のお知らせ
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 理化学研究所の一般公開が行われます。皆様のご来場をお待ちしております。
 筑波研究所 4月20日(金)13:00 - 16:00 および 21日(土)10:00 - 16:00
   詳細は< http://rtcweb.rtc.riken.jp/openhouse24/index.html >
 和光研究所 4月21日(土)9:30 - 16:30(入場は16:00まで)
   詳細は< http://www.riken.jp/r-world/event/2012/open/wako/index.html >

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┃  今月のリソース紹介「臨床分離Nocardia属菌株の提供について」
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Nocardia属は土壌中に広く分布する好気性放線菌で、創傷の土壌による汚染や
吸入、経口摂取により体内に侵入し、肺や脳、皮膚などにノカルジア症 
(Nocardiosis) と呼ばれる日和見感染症を引き起こすことで知られています。
構成する種として現在80余りが正式に命名されており、JCMではこれまで基準株
を中心にほぼ全種について収集、保存、公開を行なってきました。本属に対し
ては医学的見地からの関心も高いため、臨床分野で特に重要となる種の参考株
の充実を図ることとし、千葉大学真菌医学研究センターの協力を得て国内外の
臨床分離株60株を収集しました。これら収集株の保存と16S rRNA遺伝子の塩基
配列による同定確認・再同定が完了しましたので近日中に公開致します。種の
構成は、N. farcinica 14株、N. brasiliensis 12株、N. otitidiscaviarum 
10株、N. nova 7株、N. elegans, N. aobensis 各3株、N. abscessus, N. 
exalbida, N. transvalensis 各2株、N. carnea, N. cyriacigeorgica 各1株,
Nocardia sp. 3株となっています。なお、本属の基準種であり、臨床的にも重
要とされるN. asteroidesは従来よりヘテロな菌群(N. asteroides complex 
とも呼ばれる)とされてきましたが、遺伝的手法の導入により再分類が進み、
かつてN. asteroidesと同定されていた菌株の大半が類似の生理生化学的性状を
示す他の種に属すると考えられています。今回公開する分離株の中にも当初N. 
asteroidesと同定されていた菌株がいくつか含まれますが、遺伝子検査の結果、
そのすべてがN. abscessus, N. aobensis, N. carnea, N. cyriacigeorgica, 
N. exalbida, N. farcinica, N. nova などに同定されました。公開となりまし
たら < http://www.jcm.riken.jp/cgi-bin/jcm/new_jcm_strains > にリストさ
れますのでご確認下さい。

工藤 卓二(放線菌担当)

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┃  新規公開微生物株(2012年2-3月公開)
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細菌
Actinoallomurus radicium              JCM 17294   Type strain
Actinomycetospora chlora              JCM 17979   Type strain
Actinomycetospora cinnamomea          JCM 17980   Type strain
Actinomycetospora lutea               JCM 17982   Type strain
Actinomycetospora straminea           JCM 17983   Type strain
Actinomycetospora succinea            JCM 17984   Type strain
Algoriphagus jejuensis                JCM 16112   Type strain
Amycolatopsis halophila               JCM 18118   Type strain
"Azospirillum formosense"             JCM 17639   Type strain*
Bradyrhizobium japonicum              JCM 10833
Brevibacterium massiliense            JCM 18108   Type strain
Clostridium septicum                  JCM 7304
Clostridium septicum                  JCM 7305
Clostridium septicum                  JCM 7306
Clostridium septicum                  JCM 7307
Clostridium septicum                  JCM 7309
Clostridium septicum                  JCM 7311
Clostridium sp.                       JCM 10513
Clostridium sp.                       JCM 10514
Clostridium sp.                       JCM 10515
Clostridium sp.                       JCM 10516
Clostridium sp.                       JCM 10517
Clostridium sp.                       JCM 10518
Clostridium sp.                       JCM 10519
Clostridium sp.                       JCM 10522
Corallibacter vietnamensis            JCM 17525   Type strain
Corynebacterium glutamicum            JCM 18229
Defluviitalea saccharophila           JCM 16312   Type strain
"Deinococcus guangxiensis"            JCM 15082   Proposed type strain
Dietzia aurantiaca                    JCM 17645   Type strain
Hasllibacter halocynthiae             JCM 16214   Type strain
Knoellia locipacati                   JCM 17313   Type strain
Lentibacillus halodurans              JCM 12770   Type strain
Loktanella tamlensis                  JCM 14020   Type strain
Methylotenera versatilis              JCM 17579   Type strain
Microbulbifer marinus                 JCM 17211   Type strain
Microbulbifer yueqingensis            JCM 17212   Type strain
Micrococcus luteus                    JCM 17588
Mycobacterium mantenii                JCM 18113   Type strain
Mycobacterium novocastrense           JCM 18114   Type strain
Mycobacterium vulneris                JCM 18115   Type strain
Natribacillus halophilus              JCM 15649   Type strain
"Nonlabens agnitus"                   JCM 17109   Proposed type strain
Phascolarctobacterium succinatutens   JCM 16074   Type strain
Phascolarctobacterium succinatutens   JCM 16075
Prevotella sp.                        JCM 6348
Propionibacterium acnes               JCM 6495
Pseudoclavibacter caeni               JCM 16921   Type strain
Psychrobacter jeotgali                JCM 11464
"Rhodanobacter denitrificans"         JCM 17641   Type strain*
"Rhodanobacter denitrificans"         JCM 17642
"Rhodococcus canchipurensis"          JCM 17578   Type strain*
Rhodopirellula baltica                JCM 17613
Rhodopirellula baltica                JCM 17614
Rhodopirellula baltica                JCM 17622
Rhodopirellula baltica                JCM 17624
Saccharopolyspora cebuensis           JCM 18116   Type strain
Spinactinospora alkalitolerans        JCM 16559   Type strain
Stackebrandtia albiflava              JCM 18122   Type strain
Streptomonospora halophila            JCM 18123   Type strain
Tenacibaculum jejuense                JCM 15975   Type strain
"Thermotomaculum hydrothermale"       JCM 17643   Proposed type strain

アーキア
Haloarcula sp.                        JCM 10920
Haloarcula sp.                        JCM 10921
Haloarcula sp.                        JCM 10922
Haloarcula sp.                        JCM 10923
Haloarcula sp.                        JCM 10926
Haloarcula sp.                        JCM 10942
Haloarcula sp.                        JCM 10943
Halobacterium sp.                     JCM 10928
Haloterrigena sp.                     JCM 10929
Haloterrigena sp.                     JCM 10930
Haloterrigena sp.                     JCM 10931
Haloterrigena sp.                     JCM 10932
Haloterrigena sp.                     JCM 10933
Haloterrigena sp.                     JCM 10934
Natrialba sp.                         JCM 10936
Natrialba sp.                         JCM 10937

真菌
Bensingtonia yamatoana                JCM 10406
Bullera oryzae                        JCM 13707
Bullera setariae                      JCM 13774
Bullera sp.                           JCM 13716
Bullera sp.                           JCM 13719
Bullera sp.                           JCM 13722
Bullera sp.                           JCM 13726
Bullera sp.                           JCM 13727
Bullera sp.                           JCM 13728
Bullera sp.                           JCM 13731
Bullera sp.                           JCM 13732
Bullera sp.                           JCM 13735
Bullera sp.                           JCM 13770
Bullera sp.                           JCM 13784
Bullera sp.                           JCM 13801
Candida digboiensis                   JCM 12330   Type strain
Candida digboiensis                   JCM 12331
Candida easanensis                    JCM 12477
Candida magnoliae                     JCM 9432
Candida magnoliae                     JCM 9433
Candida magnoliae                     JCM 9434
Candida magnoliae                     JCM 9435
Candida magnoliae                     JCM 9538
Candida magnoliae                     JCM 9539
Candida magnoliae                     JCM 9540
Candida magnoliae                     JCM 9541
Candida sp.                           JCM 14994
Candida sp.                           JCM 15013
Candida sp.                           JCM 15017
Candida sp.                           JCM 15018
Candida sp.                           JCM 16738
Candida sp.                           JCM 16747
Candida sp.                           JCM 16754
Candida sp.                           JCM 16758
Cryptococcus sp.                      JCM 13706
Derxomyces sp.                        JCM 13782
Derxomyces yunnanensis                JCM 13713
Nadsonia fulvescens var. fulvescens   JCM 10023
Pichia sp.                            JCM 16750
Pseudozyma sp.                        JCM 13705
Saccharomycopsis sp.                  JCM 16741
Sporobolomyces lactosus               JCM 10082   Type strain
Sporobolomyces sp.                    JCM 10843
Sporobolomyces sp.                    JCM 10844
Sporobolomyces sp.                    JCM 10845
Sporobolomyces sp.                    JCM 10846
Sporobolomyces sp.                    JCM 10847
Sporobolomyces sp.                    JCM 13703
Sporobolomyces sp.                    JCM 13708
Sporobolomyces sp.                    JCM 13712
Sporobolomyces sp.                    JCM 13714
Sporobolomyces sp.                    JCM 13718
Sporobolomyces sp.                    JCM 13723
Sporobolomyces sp.                    JCM 13740
Sporobolomyces sp.                    JCM 13763
Sporobolomyces sp.                    JCM 13769
Sporobolomyces sp.                    JCM 13776
Tilletiopsis sp.                      JCM 13704
Unidentified yeast                    JCM 13709
Unidentified yeast                    JCM 13710
Unidentified yeast                    JCM 13711
Unidentified yeast                    JCM 13715
Unidentified yeast                    JCM 13717
Unidentified yeast                    JCM 13720
Wickerhamomyces sp.                   JCM 16752

*, 原著論文は印刷中

詳細は以下のサイトから検索できますのでご利用ください。
http://www.jcm.riken.jp/JCM/catalogue_J.shtml

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発行
独立行政法人 理化学研究所 バイオリソースセンター
微生物材料開発室 (JCM)
inquiry@jcm.riken.jp
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2012年4月19日
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