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RIKEN BioResource Center - Japan Collection of Microorganisms
JCM Mail News （電子メール版） No. 60
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独立行政法人 理化学研究所 バイオリソースセンター 微生物材料開発室（JCM）
が公開している微生物等の最新情報をお届けします。
━━━━ 目 次 ━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━
● 新年のご挨拶
● 今月のリソース紹介「メタノール資化性酵母Pichia pastorisの学名変更を
めぐる注目すべき話題」
● 特別企画「ナショナルバイオリソースプロジェクト (NBRP)」
実物つきパネル展示「バイオリソース勢揃い」終了報告
● 新規公開微生物株（2011年11-12月公開）
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┃ 新年のご挨拶
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明けましておめでとうございます。
昨年は東日本大震災など皆様におかれましても激動の年であったかと存じます。
本格的な復興はこれからで、経済や社会のニュースも決して明るいものばかりで
はなかったと感じております。このような時に科学技術が果たすべき役割や研究
者が社会に対して発信する重要性について認識を改める機会ともなりました。
JCMでは研究基盤としての微生物株の整備と皆様への提供を通して、微力かとは
存じますが、将来の社会・世代のための科学技術や研究の発展に貢献を果たせる
よう一層努めていきたいと思っております。本年もよろしくお願い申し上げます。
大熊盛也（室長）
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┃ 今月のリソース紹介「メタノール資化性酵母Pichia pastoris
┃ の学名変更をめぐる注目すべき話題」
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バイオテクノロジー分野では、非Saccharomyces系の1つとしてメタノール資化
性酵母Pichia pastorisの遺伝子発現システムが広く利用されています。最新の
分子系統解析に基づいて、Pichia属の再分類が行われ、P. pastorisはPichia属
から独立して新属Komagataellaに移されました。このKomagataella属には基準種
のK. pastrorisと、最近になり記載された2種（K. phaffiiおよび
K. pseudopastoris）が含まれています。しかし、これら3種の生理生化学的性状
が互いに酷似していることから、表現性状によってこれらを互いに識別すること
ができません。昨年出版されたThe Yeasts, A Taxonomic Study（第5版, 2011年
）によれば、“Invitogen Pichia pastoris Gene Expression Kit”の酵母は
K. phaffiiに同定されており、また、ゲノム解読が進められているK. pastoris
の使用菌株の学名についても再確認する必要があるとのことです。このように、
従来の表現性状のみによってP. pastorisとして同定されてきた酵母株は、遺伝
子解析によって、その学名を再検討する必要が求められています。
そこで、下記の2株について、リボソームRNA遺伝子の塩基配列解析に基づく品
質管理を行いました結果、2株ともにK. pastorisであることが確認できました。
是非、ご利用ください。
Komagataella pastoris JCM 3650 (基準株)
Komagataella pastoris JCM 21999
鈴木基文（酵母担当）
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┃ 特別企画「ナショナルバイオリソースプロジェクト (NBRP)」
┃ 実物つきパネル展示「バイオリソース勢揃い」終了報告
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JCMは「一般微生物」担当として文部科学省ナショナルバイオリソースプロジ
ェクトに参加しています。昨年12月13日（火）から4日間、パシフィコ横浜 展
示ホールにて、第34回日本分子生物学会年会・特別企画「ナショナルバイオリソ
ースプロジェクト (NBRP)」の展示説明会が行われました。JCMの展示ブースに多
数の方々が立ち寄っていただき、学会参加者の方々と有意義な情報交換を行うこ
とができました。ご参加されました方々に心から感謝申し上げます。
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┃ 新規公開微生物株（2011年11-12月公開）
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Acinetobacter sp. JCM 13222
Actinoallomurus oryzae JCM 17933 Type strain
Actinopolymorpha cephalotaxi JCM 17964 Type strain
Aerococcus suis JCM 18035 Type strain
Algoriphagus faecimaris JCM 16561
Alloactinosynnema album JCM 17965 Type strain
Amycolatopsis eurytherma JCM 18060 Type strain
Amycolatopsis samaneae JCM 17934 Type strain
Arthrobacter sp. JCM 10527
Bacillus cereus JCM 10911
"Bacillus kyonggiensis" JCM 17569 Proposed
type strain
Bacillus sp. JCM 10529
Bacillus sp. JCM 14833
Bacillus sp. JCM 10530
Bacillus sp. JCM 10531
Bifidobacterium kashiwanohense JCM 15439 Type strain
Catenovulum agarivorans JCM 16580 Type strain
Chryseobacterium sp. JCM 10535
Clostridium acetobutylicum JCM 7969
Clostridium septicum JCM 7287
Clostridium septicum JCM 7293
Clostridium septicum JCM 7288
Clostridium septicum JCM 7294
Clostridium septicum JCM 7285
Clostridium septicum JCM 7290
Clostridium septicum JCM 7286
Clostridium septicum JCM 7291
Desulfotomaculum varum JCM 16158 Type strain
Desulfovibrio piezophilus JCM 15486 Type strain
Dietzia aerolata JCM 17966 Type strain
Elizabethkingia sp. JCM 10536
Enterococcus faecalis JCM 8904
Enterococcus faecalis JCM 8902
Enterococcus faecium JCM 8903
Enterococcus faecium JCM 8905
Flavobacterium anhuiense JCM 14864 Type strain
Flavobacterium chungbukense JCM 17386 Type strain
Geodermatophilus ruber JCM 17967 Type strain
Georgenia soli JCM 17968 Type strain
Gluconacetobacter saccharivorans JCM 25121 Type strain
Gordonia humi JCM 17969 Type strain
Gramella gaetbulicola JCM 16528 Type strain
Halobacillus yeomjeoni JCM 12929 Type strain
Halorhodospira neutriphila JCM 17835 Type strain
Herbidospora daliensis JCM 18061 Type strain
Herbidospora sakaeratensis JCM 17935 Type strain
Herbidospora yilanensis JCM 18062 Type strain
Isoptericola chiayiensis JCM 18063 Type strain
Jiangella muralis JCM 17970 Type strain
Kytococcus aerolatus JCM 17971 Type strain
Lactobacillus acidophilus JCM 2121
Lactobacillus brevis JCM 1066
Lactobacillus casei JCM 2120
Lactobacillus delbrueckii JCM 1014
Lactobacillus kefiranofaciens subsp. kefirgranum JCM 8944
Lactobacillus kefiranofaciens subsp. kefirgranum JCM 8948
Lactobacillus kefiranofaciens subsp. kefirgranum JCM 8941
Lactobacillus kefiranofaciens subsp. kefirgranum JCM 8945
Lactobacillus kefiranofaciens subsp. kefirgranum JCM 8942
Lactobacillus kefiranofaciens subsp. kefirgranum JCM 8946
Lactobacillus kefiranofaciens subsp. kefirgranum JCM 8943
Lactobacillus kefiranofaciens subsp. kefirgranum JCM 8947
Lactobacillus kefiranofaciens subsp. kefirgranum JCM 8940
Lactobacillus oeni JCM 18036 Type strain
Lactobacillus plantarum JCM 1100
Lactobacillus tucceti JCM 18037 Type strain
Leucobacter aerolatus JCM 17972 Type strain
"Leuconostoc miyukkimchii" JCM 17445 Type strain*
Luteimonas lutimaris JCM 16916 Type strain
Lysinibacillus sp. JCM 10912
Methylogaea oryzae JCM 16910 Type strain
Methylothermus subterraneus JCM 13664 Type strain
Microbacterium sp. JCM 10528
Nitratireductor aquimarinus JCM 17289
Nocardiopsis flavescens JCM 17424 Type strain
Ochrobactrum sp. JCM 5503
Paenibacillus macerans JCM 13340
Paenibacillus odorifer JCM 13339
Paenibacillus sp. JCM 13343
Paenibacillus sp. JCM 13341
Paenibacillus sp. JCM 13338
Paenibacillus sp. JCM 13342
Paenibacillus wooponensis JCM 16350 Type strain
"Paracoccus oceanense" JCM 17768 Proposed
type strain
Planotetraspora kaengkrachanensis JCM 17936 Type strain
Planotetraspora phitsanulokensis JCM 17937 Type strain
Porphyromonas asaccharolytica JCM 6323
Prevotella fusca JCM 17724 Type strain
Prevotella melaninogenica JCM 6324
Prevotella scopos JCM 17725 Type strain
Promicromonospora umidemergens JCM 17975 Type strain
Pseudomonas fragi JCM 5441
Pseudomonas fragi JCM 5479
Pseudomonas fragi JCM 5374
Pseudomonas fragi JCM 5407
Pseudomonas fragi JCM 5367
Pseudomonas fragi JCM 5400
Pseudomonas fragi JCM 5434
Pseudomonas fragi JCM 5393
Pseudomonas fragi JCM 5427
Pseudomonas fragi JCM 5454
Pseudomonas fragi JCM 5386
Pseudomonas fragi JCM 5419
Pseudomonas fragi JCM 5446
Pseudomonas fragi JCM 5483
Pseudomonas fragi JCM 5378
Pseudomonas fragi JCM 5411
Pseudomonas fragi JCM 5438
Pseudomonas fragi JCM 5475
Pseudomonas fragi JCM 5371
Pseudomonas fragi JCM 5404
Pseudomonas fragi JCM 5468
Pseudomonas fragi JCM 5364
Pseudomonas fragi JCM 5397
Pseudomonas fragi JCM 5431
Pseudomonas fragi JCM 5460
Pseudomonas fragi JCM 5390
Pseudomonas fragi JCM 5423
Pseudomonas fragi JCM 5451
Pseudomonas fragi JCM 5383
Pseudomonas fragi JCM 5442
Pseudomonas fragi JCM 5375
Pseudomonas fragi JCM 5408
Pseudomonas fragi JCM 5472
Pseudomonas fragi JCM 5368
Pseudomonas fragi JCM 5401
Pseudomonas fragi JCM 5435
Pseudomonas fragi JCM 5464
Pseudomonas fragi JCM 5394
Pseudomonas fragi JCM 5428
Pseudomonas fragi JCM 5387
Pseudomonas fragi JCM 5420
Pseudomonas fragi JCM 5447
Pseudomonas fragi JCM 5379
Pseudomonas fragi JCM 5412
Pseudomonas fragi JCM 5476
Pseudomonas fragi JCM 5372
Pseudomonas fragi JCM 5469
Pseudomonas fragi JCM 5365
Pseudomonas fragi JCM 5398
Pseudomonas fragi JCM 5432
Pseudomonas fragi JCM 5461
Pseudomonas fragi JCM 5391
Pseudomonas fragi JCM 5425
Pseudomonas fragi JCM 5452
Pseudomonas fragi JCM 5384
Pseudomonas fragi JCM 5417
Pseudomonas fragi JCM 5444
Pseudomonas fragi JCM 5376
Pseudomonas fragi JCM 5409
Pseudomonas fragi JCM 5436
Pseudomonas fragi JCM 5473
Pseudomonas fragi JCM 5369
Pseudomonas fragi JCM 5402
Pseudomonas fragi JCM 5362
Pseudomonas fragi JCM 5395
Pseudomonas fragi JCM 5429
Pseudomonas fragi JCM 5456
Pseudomonas fragi JCM 5388
Pseudomonas fragi JCM 5421
Pseudomonas fragi JCM 5448
Pseudomonas fragi JCM 5380
Pseudomonas fragi JCM 5413
Pseudomonas fragi JCM 5440
Pseudomonas fragi JCM 5477
Pseudomonas fragi JCM 5373
Pseudomonas fragi JCM 5366
Pseudomonas fragi JCM 5399
Pseudomonas fragi JCM 5433
Pseudomonas fragi JCM 5462
Pseudomonas fragi JCM 5392
Pseudomonas fragi JCM 5426
Pseudomonas fragi JCM 5453
Pseudomonas fragi JCM 5385
Pseudomonas fragi JCM 5418
Pseudomonas fragi JCM 5445
Pseudomonas fragi JCM 5377
Pseudomonas fragi JCM 5410
Pseudomonas fragi JCM 5437
Pseudomonas fragi JCM 5474
Pseudomonas fragi JCM 5370
Pseudomonas fragi JCM 5403
Pseudomonas fragi JCM 5467
Pseudomonas fragi JCM 5363
Pseudomonas fragi JCM 5396
Pseudomonas fragi JCM 5430
Pseudomonas fragi JCM 5457
Pseudomonas fragi JCM 5389
Pseudomonas fragi JCM 5422
Pseudomonas fragi JCM 5449
Pseudomonas fragi JCM 5382
Pseudomonas fragi JCM 5414
Pseudomonas sp. JCM 5471
Pseudomonas sp. JCM 5463
Pseudomonas sp. JCM 5496
Pseudomonas sp. JCM 5415
Pseudomonas sp. JCM 10534
Pseudomonas sp. JCM 5480
Pseudomonas sp. JCM 5455
Pseudomonas sp. JCM 5484
Pseudomonas sp. JCM 5439
Pseudomonas sp. JCM 5405
Pseudomonas sp. JCM 5497
Pseudomonas sp. JCM 5481
Pseudomonas sp. JCM 5465
Pseudomonas sp. JCM 5494
Pseudomonas sp. JCM 5406
Pseudomonas sp. JCM 5470
Pseudomonas sp. JCM 5498
Pseudomonas sp. JCM 5482
Pseudomonas sp. JCM 5495
"Pseudomonas veronii subsp. inensis" JCM 11828 Proposed
type strain
"Pseudomonas veronii subsp. inensis" JCM 11829
Pusillimonas harenae JCM 16917 Type strain
Rhizobium pusense JCM 16209 Type strain
Rhizobium sp. JCM 5500
Rhizobium sp. JCM 5504
Rhizobium sp. JCM 5501
Rhizobium sp. JCM 5502
Rhodococcus sp. JCM 1965
Rhodococcus sp. JCM 1966
Salimicrobium salexigens JCM 16414 Type strain
Sphingobacterium siyangense JCM 14866 Type strain
Spongiibacter borealis JCM 17304 Type strain
Staphylococcus sp. JCM 10533
"Streptomyces eridani" JCM 4959
Streptomyces sp. JCM 10538
Streptomyces zinciresistens JCM 18080 Type strain
Thermogemmatispora foliorum JCM 16818 Type strain
Thermogemmatispora onikobensis JCM 16817 Type strain
Zobellella aerophila JCM 17110 Type strain
アーキア
Methanobacterium flexile JCM 15416 Type strain
Methanobacterium movens JCM 15415 Type strain
真菌
Acremonium kiliense JCM 10152
Aegerita candida JCM 13419
Arthrinium sp. JCM 11073
Bullera koratensis JCM 12882
Bullera koratensis JCM 12879
Bullera koratensis JCM 12883
Bullera koratensis JCM 12880
Bullera koratensis JCM 12881
Candida lundiana JCM 16823 Type strain
Candida suthepensis JCM 16822 Type strain
Ceratocystis paradoxa JCM 6963
Ceratocystis paradoxa JCM 6962
Chalara paradoxa JCM 6958
Chalara paradoxa JCM 6959
Chalara paradoxa JCM 6960
Cladobotryum verticillatum JCM 10754
Cladosporium macrocarpum JCM 11784
Cladosporium oxysporum JCM 11786
Coremiella cubispora JCM 11621
Coremiella cubispora JCM 11625
Coremiella cubispora JCM 11622
Coremiella cubispora JCM 11626
Coremiella cubispora JCM 11623
Coremiella cubispora JCM 11620
Coremiella cubispora JCM 11624
Cryptococcus tepidarius JCM 11965 Type strain
Cryptococcus tepidarius JCM 11966
Cyphellophora laciniata JCM 16192
Daedalea dickinsii JCM 12697
Exophiala calicioides JCM 10154
Exophiala dermatitidis JCM 16202
Exophiala dermatitidis JCM 16206
Exophiala dermatitidis JCM 16203
Exophiala dermatitidis JCM 16207
Exophiala dermatitidis JCM 16204
Exophiala dermatitidis JCM 16201
Exophiala dermatitidis JCM 16205
Exophiala sp. JCM 16194
Fulvia fulva JCM 10820
Fulvia fulva JCM 11066
Fulvia fulva JCM 10821
Fulvia fulva JCM 10818
Fulvia fulva JCM 10819
Fusarium oxysporum JCM 11382
Fusarium solani JCM 11381
Fusarium solani JCM 16197
Fusarium sp. JCM 16198
Graphiola phoenicis JCM 8177
Graphiola phoenicis JCM 8178
Graphium putredinis JCM 8079
Graphium putredinis JCM 8080
Grosmannia yunnanensis JCM 11874
Grosmannia yunnanensis JCM 14939
Grosmannia yunnanensis JCM 14940
Grosmannia yunnanensis JCM 14941
Grosmannia yunnanensis JCM 11873
Harzia acremonioides JCM 7954
Helicodendron conglomeratum JCM 9252
Lophiostoma apiculatus JCM 13091 ex-holotype
strain
Lophiostoma apiculatus JCM 13092
Nectria gracilipes JCM 7940
Nectria gracilipes JCM 7941
Nectria gracilipes JCM 7942
Nectria gracilipes JCM 7939
Parasympodiella longispora JCM 7937
Penicillium viticola JCM 17636 ex-holotype
strain
Phialophora verrucosa JCM 16200
Phleogena faginea JCM 7932
Phleogena faginea JCM 7935
Phleogena faginea JCM 7931
Phoma fimeti JCM 16193
Phoma glomerata JCM 16199
Pseudaegerita corticalis JCM 13420
Pseudozyma aphidis JCM 18018
Ramichloridium strelitziae JCM 16191
Tremella sp. JCM 11332
Trichothecium roseum JCM 8206
Trichothecium roseum JCM 8207
Trichothecium roseum JCM 9870
Trichothecium roseum JCM 8205
Tubercularia lateritia JCM 8185
Zygosporium parasiticum JCM 17048
*, 原著論文は印刷中
詳細は以下のサイトから検索できますのでご利用ください。
http://www.jcm.riken.jp/JCM/catalogue_J.shtml
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発行
独立行政法人 理化学研究所 バイオリソースセンター
微生物材料開発室 (JCM)
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2012年1月13日
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