*********************************************************
RIKEN BioResource Center - Japan Collection of Microorganisms
JCM Mail News （電子メール版） No. 50
*********************************************************
独立行政法人 理化学研究所 バイオリソースセンター 微生物材料開発室（JCM）
が公開している微生物等の最新情報をお届けします。
━━━━ 目 次 ━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━
● 糸状菌類の遺伝子解析法と顕微鏡観察・分離法に関する技術研修実施のお知
らせ
● 今月のリソース紹介「難分解性物質を分解する放線菌類について」
● 新規公開微生物株（2010年12月公開）
● 利用者による研究成果をホームページに掲載しています
━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━
┏━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━
┃ 糸状菌類の遺伝子解析法と顕微鏡観察・分離法に関する技術研修実施のお知
┃ らせ
┗━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━
JCMでは下記の要領で技術研修を行います。
概 要： 初心者を対象に、糸状菌類（カビ）の簡便迅速同定に有効な遺伝
子解析法（DNA抽出から塩基配列解析まで）ならびに顕微鏡観察
・分離法の基礎を学ぶ実習を行います。
研修期間： 平成23年2月3日（木）～2月4日（金）（2日間）
実施場所： 独立行政法人理化学研究所 和光研究所 微生物系統保存棟内
（埼玉県和光市広沢2-1）
定 員： 4名程度
費 用： 13,000円
募集締切： 平成23年1月7日
詳細は以下のサイトをご覧ください。
https://www.brc.riken.jp/inf/kensyu/jcm4.shtml
┏━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━
┃ 今月のリソース紹介「難分解性物質を分解する放線菌類について」
┗━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━
放線菌類はグラム陽性細菌のうち、260余りの属から構成されるアクチノバク
テリア綱に分類される一大菌群です。JCMではこれまで放線菌類の基準株につい
て精力的に収集、保存をし、正式発表された種の90%に当たる約2,000種の基準
株を保有しております。一方、JCMでは「環境と健康の研究に資する微生物」を
事業目標のスローガンに掲げており、放線菌はそのスローガンの一つ、「環境」
とも深く関わっています。放線菌は抗生物質をはじめとする有用物質の生産者と
して知られる一方、環境中に存在する化学物質の分解者という一面も持っており
、腐植などを通じて地球規模の物質循環などに寄与していると考えられます。さ
らにその分解能は多岐にわたり、一般に生物学的に容易に分解されない難分解性
物質の分解菌も数多く放線菌類から見いだされています。JCMが保有する放線菌
類にも多くの難分解性物質分解菌がありますので、以下にその一部をご紹介致し
ます。
菌 株 被分解物質
Agromyces ulmi JCM 13315 xylan
Amycolatopsis keratiniphila JCM 12683 keratin
Arthrobacter chlorophenolicus JCM 12360 4-chlorophenol
Arthrobacter nitroguajacolicus JCM 14115 4-nitroguaiacol
Arthrobacter phenanthrenivorans JCM 16027 phenanthrene
Gordonia amicalis JCM 10675 dibenzothiophene
Gordonia polyisoprenivorans JCM 10675 rubber
Gordonia westfalica JCM 11757 rubber,
cis-1,4-polyisoprene
Janibacter sp. JCM 11555 dibenzofuran
Janibacter sp. JCM 11556 dibenzofuran
Janibacter terrae JCM 12887 trichloroethylene
Kribbia dieselivorans JCM 13585 diesel oil
Microbacterium hydrocarbonoxydans JCM 14340 crude oil
Microbacterium oleivorans JCM 14341 crude oil
Microbacterium xylanilyticum JCM 13591 xylan
Mycobacterium aromaticivorans JCM 16368 PAHs*
Mycobacterium chlorophenolicum JCM 7439 polychlorophenol
Mycobacterium crocinum JCM 16369 PAHs*
Mycobacterium fluoranthenivorans JCM 14741 fluoranthene,
aflatoxin B1
Mycobacterium hodleri JCM 12141 PAHs*
Mycobacterium pallens JCM 16370 PAHs*
Mycobacterium pyrenivorans JCM 15927 PAHs*
Mycobacterium rufum JCM 16372 PAHs*
Mycobacterium rutilum JCM 16371 PAHs*
Mycobacterium vanbaalenii JCM 13017 PAHs*
Nocardioides aromaticivorans JCM 11674 dibenzofuran
Nocardioides aromaticivorans JCM 16569 carbazole
Nocardioides jensenii JCM 1364 dinitro-o-cresol
herbicides
Nocardioides nitrophenolicus JCM 10703 p-nitrophenol, phenol
Nocardioides oleivorans JCM 14342 crude oil
Nocardioides pyridinolyticus JCM 10369 pyridine
Nocardioides sp. JCM 16518 atrazine
Nocardiopsis aegyptia JCM 13853 poly(3-hydroxybutyrate)
Pseudonocardia chloroethenivorans JCM 12679 trichloroethene,
cis-1,2-dichloroethene,
chloroethene
Pseudonocardia sulfidoxydans JCM 10411 dimethyl sulfide,
dimethyl disulfide
Pseudonocardia tetrahydrofuranoxydans JCM 14745 tetrahydrofuran
Rhodococcus aetherivorans JCM 14343 methyl t-butyl ether
Rhodococcus erythropolis JCM 9803 PCBs, biphenyl
Rhodococcus erythropolis JCM 9805 PCBs, biphenyl
Rhodococcus imtechensis JCM 13270 p-nitrophenol,
2,4-dinitrophenol
Rhodococcus koreensis JCM 10743 2,4-dinitrophenol
Rhodococcus phenolicus JCM 14914 chlorobenzene,
dichlorobenzene, phenol
Rhodococcus pyridinivorans JCM 10940 pyridine
Rhodococcus qingshengii JCM 15477 carbendazim
Rhodococcus sp. JCM 11554 dibenzofuran
Rhodococcus sp. JCM 3009 phenol, naphthalene
Rhodococcus sp. JCM 9789 PCBs, biphenyl
Rhodococcus sp. JCM 9791 PCBs, biphenyl
Rhodococcus zopfii JCM 9919 chlorinated benzenes
Thermobifida fusca JCM 3263 lignin
*PAHs, polycyclic aromatic hydrocarbons
工藤卓二 (放線菌担当)
┏━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━
┃ 新規公開微生物株（2010年12月公開）
┗━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━
細菌
Actinoallomurus acaciae JCM 17235 Type strain
Actinophytocola oryzae JCM 17236 Type strain
Aeromicrobium halocynthiae JCM 15749 Type strain
"Agromyces soli" JCM 16247 Type strain*
Alkaliphilus halophilus JCM 16124 Type strain
Brevibacterium salitolerans JCM 15900 Type strain
"Brevundimonas olei" JCM 16237 Proposed type strain
Castellaniella daejeonensis JCM 16240 Type strain
Chromohalobacter salexigens JCM 15323
Corynebacterium pyruviciproducens JCM 17320 Type strain
Curvibacter fontanus JCM 21533 Type strain
Erythrobacter nanhaisediminis JCM 16125 Type strain
Gluconacetobacter intermedius JCM 16936 Type strain
Halomonas titanicae JCM 16411 Type strain
Kangiella japonica JCM 16211 Type strain
Microbacterium ginsengiterrae JCM 15516 Type strain
Mycobacterium botniense JCM 17322 Type strain
Mycobacterium bouchedurhonense JCM 17323 Type strain
Mycobacterium timonense JCM 17325 Type strain
Nonomuraea rosea JCM 17326 Type strain
Pseudidiomarina aestuarii JCM 16344 Type strain
Pseudomonas taeanensis JCM 16046 Type strain
Pusillimonas soli JCM 16386 Type strain
Rhodothermus profundi JCM 15944 Type strain
Sphingopyxis panaciterrulae JCM 14844 Type strain
Staphylococcus aureus subsp. aureus JCM 16554
Staphylococcus aureus subsp. aureus JCM 16555
Staphylococcus aureus subsp. aureus JCM 16556
アーキア
Archaeoglobus sulfaticallidus JCM 14716 Type strain
"Halostagnicola alkaliphila" JCM 16592 Type strain*
Halostagnicola kamekurae JCM 16110 Type strain
"Salarchaeum japonicum" JCM 16327 Type strain*
* , 原著論文は印刷中（IJSEM誌）
真菌
Acremonium sp. JCM 15326
Acremonium sp. JCM 15327
Acremonium sp. JCM 15328
Acremonium sp. JCM 15329
Acremonium sp. JCM 15330
Acremonium sp. JCM 15331
Acremonium sp. JCM 15332
Acremonium sp. JCM 15333
Clonostachys sp. JCM 15334
Clonostachys sp. JCM 15335
Cylindrocarpon sp. JCM 15336
Cylindrocarpon sp. JCM 15337
Cylindrocarpon sp. JCM 15338
Fusarium sp. JCM 15339
Fusarium sp. JCM 15340
Fusarium sp. JCM 15341
Fusarium sp. JCM 15342
Fusarium sp. JCM 15343
Fusarium sp. JCM 15344
Fusarium sp. JCM 15345
Fusarium sp. JCM 15346
Fusarium sp. JCM 15347
Fusarium sp. JCM 15348
Fusarium sp. JCM 15349
Fusarium sp. JCM 15350
Fusarium sp. JCM 15351
Fusarium sp. JCM 15352
Fusarium sp. JCM 15353
Fusarium sp. JCM 15354
Fusarium sp. JCM 15355
Fusarium sp. JCM 15356
Fusarium sp. JCM 15357
Fusarium sp. JCM 15358
Fusarium sp. JCM 15359
Fusarium sp. JCM 15360
Fusarium sp. JCM 15361
Fusarium sp. JCM 15362
Fusarium sp. JCM 15363
Fusarium sp. JCM 15365
Trichoderma sp. JCM 15366
Trichoderma sp. JCM 15367
Trichoderma sp. JCM 15368
Trichoderma sp. JCM 15369
Trichoderma sp. JCM 15370
Trichoderma sp. JCM 15371
Trichoderma sp. JCM 15372
Trichoderma sp. JCM 15373
Trichoderma sp. JCM 15374
Trichoderma sp. JCM 15375
Trichoderma sp. JCM 15376
Trichoderma sp. JCM 15377
Trichoderma sp. JCM 15378
Trichoderma sp. JCM 15379
Trichoderma sp. JCM 15380
Trichoderma sp. JCM 15381
Trichoderma sp. JCM 15382
Trichoderma sp. JCM 15383
Unidentified fungus JCM 15384
Unidentified fungus JCM 15385
Unidentified fungus JCM 15386
詳細は以下のサイトをご覧下さい。
http://www.jcm.riken.jp/JCM/catalogue_J.shtml
┏━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━
┃ 利用者による研究成果をホームページに掲載しています
┗━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━
JCMにおける事業の重要な目的のひとつは、利用者の皆様の研究に貢献するこ
とです。提供したJCM株から多くの優れた研究成果が生まれています。JCM株が利
用された論文の情報をホームページに掲載しています。論文情報には利用された
JCM株を、また各JCM株のカタログページにはその株が利用された論文を、それぞ
れ記載しています。
詳細は以下のサイトをご覧ください。
http://www.jcm.riken.jp/JCM/result_J.shtml
今後の継続的な事業実施のため、JCM株を利用した研究成果を発表されました
ら、是非とも、微生物材料開発室 (inquiry@jcm.riken.jp)まで論文情報をお知
らせください。
------------------------
※ メールでの情報提供受信を中止されたい場合は、微生物材料開発室
(inquiry@jcm.riken.jp)まで「メールニュース不要」の旨をご連絡下さい。
※ 当メールへのご質問などは、微生物材料開発室(inquiry@jcm.riken.jp)
までお送り下さい。
※ 当メールニュース受信者各位機関のサーバーメインテナンス等によりメール
ニュースをお届けできない場合でも、メールニュースの再発行は行いません。
発行済みのメールニュースは当開発室のwebサイトで公開しておりますので
そちらをご覧下さい。
http://www.jcm.riken.jp/JCM/mailnews.shtml
※ 本メールに記載された内容は予告することなく変更することがあります。
※ 本メールに掲載された記事を許可なく複製・転載することを禁止します。
_____________________________________________
発行
独立行政法人 理化学研究所 バイオリソースセンター
微生物材料開発室 (JCM)
inquiry@jcm.riken.jp
http://www.jcm.riken.jp/
2010年12月28日
_____________________________________________
