JCM Mail News No. 43

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RIKEN BioResource Center - Japan Collection of Microorganisms
            JCM Mail News (電子メール版) No. 43
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独立行政法人 理化学研究所 バイオリソースセンター 微生物材料開発室(JCM)
から公開している微生物等の最新情報をお届けします。

━━━━ 目 次 ━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━
● 今月のリソース紹介
● 新規公開微生物株(2010年4月公開)
● 理研BRC総合カタログNo. 8が発行されました
● 微生物株の寄託ならびに公開の証明書の発行
● バイオリソースの提供手数料の改定のお知らせ
● 大量依頼の場合に得られる提供手数料の特典システムのご案内
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┃  今月のリソース紹介
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 4月8日付の毎日新聞に「日本人の腸に『海藻好き』細菌」という記事が掲載
されましたが、ご覧になった方はいらっしゃいますか?これは日本人の腸内に
ノリやワカメなど海藻の食物繊維を消化する細菌が存在することをフランスの
研究チームがNatureに発表したことを紹介した記事です。本論文によると
Bacteroides plebeiusは海藻の食物繊維を分解する酵素を持っており、米国人
18人の腸内からは検出されず、日本人では13人中5人から検出された、というこ
とです。B. plebeiusの食物繊維を分解する酵素の遺伝子は海中の細菌から取り
入れられたと推定されています。
 B. plebeiusは2005年にJCMスタッフにより新種提唱された種で、日本人の糞
便3人から分離した6株をJCMでは公開しております。今回発表されたNatureの研
究結果はB. plebeius基準株のゲノム解析から得られたものです。基準株は海外
のカルチャーコレクションにも寄託されていますが、参考株については現在の
ところJCMからのみ入手することができます。今後参考株を使ったさらなる研究
の展開が期待されます。

Bacteroides plebeius                         JCM 12973 (Type strain)
Bacteroides plebeius                         JCM 12974 
Bacteroides plebeius                         JCM 12975 
Bacteroides plebeius                         JCM 12976 
Bacteroides plebeius                         JCM 12977 
Bacteroides plebeius                         JCM 12978

参考文献
Hehemann, J. H. et al. 2010. Transfer of carbohydrate-active enzymes
from marine bacteria to Japanese gut microbiota. Nature. 464: 908-912.
Kitahara, M. et al. 2005. Bacteroides plebeius sp. nov. and Bacteroides
coprocola sp. nov., isolated from human faeces. Int. J. Syst. Evol.
Microbiol. 55: 2143-2147.

北原 真樹(菌株担当者・乳酸菌)

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┃  新規公開微生物株(2010年4月公開)
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細菌
Aestuariibacter litoralis                    JCM 15896   Type strain 
Alishewanella agri                           JCM 15597
Alistipes finegoldii                         JCM 16770   Type strain 
Alistipes onderdonkii                        JCM 16771   Type strain 
Alistipes putredinis                         JCM 16772   Type strain 
Alistipes shahii                             JCM 16773   Type strain 
Bartonella japonica                          JCM 15567   Type strain 
Bartonella silvatica                         JCM 15566   Type strain 
Caldinitratiruptor microaerophilus           JCM 16183
Cellulosilyticum ruminicola                  JCM 14822   Type strain 
Clostridium thermocellum                     JCM 9322    Type strain 
Cronobacter dublinensis subsp. dublinensis   JCM 16467   Type strain 
Cryobacterium roopkundense                   JCM 15131   Type strain 
Desulfovibrio africanus subsp. uniflagellum  JCM 15510   Type strain 
Enterobacter helveticus                      JCM 16470   Type strain 
Enterobacter pulveris                        JCM 16471   Type strain 
Enterobacter turicensis                      JCM 16472   Type strain 
Geomicrobium halophilum                      JCM 15647   Type strain 
Kocuria atrinae                              JCM 15914   Type strain 
Lactobacillus sucicola                       JCM 15457   Type strain 
Meiothermus cateniformans                    JCM 15150
Meiothermus cateniformans                    JCM 15151   Type strain 
Morganell psychrotolerans                    JCM 16473   Type strain 
Nocardioides fonticola                       JCM 16703   Type strain 
Pelotomaculum sp.                            JCM 12326
Serratia ureilytica                          JCM 16474   Type strain 
Streptococcus dentapri                       JCM 15752   Type strain 
Thermus arciformis                           JCM 15152
Thermus arciformis                           JCM 15153   Type strain 
Wandonia haliotis                            JCM 16083   Type strain 

真菌
Candida khmerensis                           JCM 13262   Type strain 
Candida khmerensis                           JCM 13263
Candida takamatsuzukensis                    JCM 15410   Type strain 
Candida takamatsuzukensis                    JCM 15411
Candida takamatsuzukensis                    JCM 15412
Candida takamatsuzukensis                    JCM 15413
Candida takamatsuzukensis                    JCM 15414
Candida tumulicola                           JCM 15396
Candida tumulicola                           JCM 15397
Candida tumulicola                           JCM 15398
Candida tumulicola                           JCM 15399
Candida tumulicola                           JCM 15400
Candida tumulicola                           JCM 15401
Candida tumulicola                           JCM 15402
Candida tumulicola                           JCM 15403   Type strain 
Candida tumulicola                           JCM 15404
Candida tumulicola                           JCM 15405
Candida tumulicola                           JCM 15406
Candida tumulicola                           JCM 15407
Candida tumulicola                           JCM 15408
Candida tumulicola                           JCM 15409
Leptographium yunnanense                     JCM 15536
Penicillium paneum                           JCM 15985
Penicillium paneum                           JCM 15986
Penicillium paneum                           JCM 15987
Penicillium paneum                           JCM 15988
Penicillium paneum                           JCM 15989
Penicillium paneum                           JCM 15990
Penicillium paneum                           JCM 15991
Penicillium paneum                           JCM 15992
Penicillium paneum                           JCM 15993
Penicillium paneum                           JCM 15994
Penicillium paneum                           JCM 15995
Pichia myanmarensis                          JCM 12922   Type strain 
Unidentified fungus                          JCM 13870

詳細は以下のサイトをご覧下さい。
http://www.jcm.riken.jp/JCM/catalogue_J.shtml

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┃  理研BRC総合カタログNo. 8が発行されました
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 理研BRC総合カタログNo. 8、2010年度版が発行されました。
 詳細は以下のサイトをご覧下さい。
 https://www.brc.riken.jp/lab/info/catalog/

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┃  微生物株の寄託ならびに公開の証明書の発行
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 International Journal of Systematic and Evolutionary Microbiology
(IJSEM) 誌に新種等を発表される場合、あるいはIJSEM誌の Validation List
に新種等の掲載を依頼する場合、当該種等の基準株が2カ国以上のカルチャー
コレクションに寄託され、一般に公開されることが求められます。JCMではこの
IJSEM 誌の方針にしたがって、保存微生物株の寄託ならびに公開の証明書を発行
しています。詳細につきましては以下のサイトをご覧下さい。

http://www.jcm.riken.jp/JCM/Depositing_J.shtml#certificate

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┃  バイオリソースの提供手数料の改定しました
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 当センターは、ライフサイエンスの開発研究に必要なバイオリソースを整備
し、提供する事業を実施いたしております。事業を継続的かつ円滑に行うため
に、バイオリソースの収集、保存、品質管理等に必要な経費は理化学研究所運
営費交付金を充て、提供に必要な経費は提供手数料として利用者の皆様にご負
担いただいております。この度、社会情勢の変化と政府の指導により、提供手
数料の見直しを行い、改定させていただくことになりました。利用者の皆様に
は一部負担の増とはなりますが、ご理解とご協力を賜りますよう何卒宜しくお
願い申し上げます。引き続き、当センターはバイオリソースの充実と品質の向
上に努めて参ります。皆様の一層のご利用を心よりお待ち申し上げております。
詳細は以下のサイトをご覧下さい。
https://www.brc.riken.jp/inf/distribute/kakaku.shtml#JCM

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┃  大量依頼の場合に得られる提供手数料の特典システムのご案内
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 JCMでは、一度に20株以上お申し込みいただいた場合、申込株数に応じて提供
手数料をディスカウントする特典システムを導入しております。20-49株の場合
は約20%、50株以上の場合は約25%のディスカウントとなります。
 本システム専用の微生物材料提供依頼書(書式M-4L)がございますので、以下
からダウンロードの上、お申し込み下さい。
http://www.jcm.riken.jp/JCM/Ordering_J.shtml#documents
ディスカウント手数料に関する詳細は以下をご覧下さい。
https://www.brc.riken.jp/inf/distribute/jcmdiscount.shtml

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※ メールでの情報提供受信を中止されたい場合は、微生物材料開発室
  (inquiry@jcm.riken.jp)まで「メールニュース不要」の旨をご連絡下さい。
※ 当メールへのご質問などは、微生物材料開発室(inquiry@jcm.riken.jp)
  までお送り下さい。
※ 当メールニュース受信者各位機関のサーバーメインテナンス等によりメール
  ニュースをお届けできない場合でも、メールニュースの再発行は行いません。
  発行済みのメールニュースは当開発室のwebサイトで公開しておりますので
  そちらをご覧下さい。
  http://www.jcm.riken.jp/JCM/mailnews.shtml
※ 本メールに記載された内容は予告することなく変更することがあります。
※ 本メールに掲載された記事を許可なく複製・転載することを禁止します。
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発行
独立行政法人 理化学研究所 バイオリソースセンター
微生物材料開発室 (JCM)
inquiry@jcm.riken.jp
http://www.jcm.riken.jp/
2010年4月30日
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