*********************************************************
RIKEN BioResource Center - Japan Collection of Microorganisms
JCM Mail News (電子メール版) No. 18
*********************************************************
独立行政法人 理化学研究所 バイオリソースセンター 微生物材料開発室(JCM)
から公開している微生物等の最新情報をお届けします。
━━━━ 目 次 ━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━
● 今月のリソース
● 新規公開微生物株(2007年8月公開)
● 新規公開微生物株由来ゲノムDNA
● 第23回日本微生物生態学会大会附設展示へのご来場有り難うございました
● 微生物株の寄託ならびに公開の証明書の発行
● 大量依頼の場合に得られる提供手数料の特典システム導入のお知らせ
● JCM微生物株カタログ第9版 (2005年)について
━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━
┏━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━
┃ 今月のリソース
┗━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━
平成15年11月から2年間、バングラディシュから日本学術振興会の外国人特別
研究員として Dr. Ismet Araを受け入れ、バングラディシュの土壌サンプルか
らの放線菌の分離と、分離株の分類学に関する共同研究を行いました。JCMでは
これまでタイやマレーシアなど、アジア地域の研究者との共同研究を行ってき
ましたが、バングラディシュは放線菌のソースとしてはまだまだ未開拓で、新
規な放線菌が多数分離されることが期待されました。その成果が昨年から今年
にかけて論文として発表されつつありますが、以下にこれまでに発表された論
文ならびに放線菌をご紹介いたします。
・Int. J. Syst. Evol. Microbiol. 56: 393-400, 2006.
Catellatospora chokoriensis(新種) Type strain: JCM 12950
Catellatospora coxensis(新種) Type strain: JCM 12951
Catellatospora bangladeshensis(新種) Type strain: JCM 12949
・Actinomycetologica 21: 1-10, 2007.
"Krasilnikovia cinnamonea"(新属新種) Type strain: JCM 13252
・Actinomycetologica 21: 11-21, 2007.
"Sphaerosporangium melleum"(新属新種) Type strain: JCM 13064
"Sphaerosporangium rubeum"(新種) Type strain: JCM 13067
・Int J Syst. Evol. Microbiol. 57: 1504-1509, 2007.
Nonomuraea bangladeshensis(新種) Type strain: JCM 13930
Nonomuraea coxensis(新種) Type strain: JCM 13931
・J. Gen. Appl. Microbiol. 53: 29-37, 2007.
Micromonospora chokoriensis(新種) Type strain: JCM 13247
Micromonospora coxensis(新種) Type strain: JCM 13248
・J. Gen. Appl. Microbiol. 53: 39-51, 2007.
Luedemannella helvata(新属新種) Type strain: JCM 13249
Luedemannella flava(新種) Type strain: JCM 13250
・J. Gen. Appl. Microbiol. 53: 159-166, 2007.
"Nonomuraea maheshkhaliensis"(新種) Type strain: JCM 13929
なお、これらの菌株の提供は、現在のところ植物防疫法による規制を受けます
ので、提供申し込みの際には所定の手続きが必要となります。詳しくは以下の
ページをご覧下さい。
http://www.jcm.riken.jp/JCM/shokubou.html
(専任研究員 工藤卓二)
┏━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━
┃ 新規公開微生物株(2007年8月公開)
┗━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━
細菌 Aminiphilus circumscriptus JCM 14039 Type strain
Amycolatopsis echigonensis JCM 21831 Type strain
Amycolatopsis niigatensis JCM 21832 Type strain
Aureispira marina JCM 23197 Type strain
Aureispira marina JCM 23200
Aureispira marina JCM 23201
Bacillus selenatarsenatis JCM 14380 Type strain
Caenispirillum bisanense JCM 14346 Type strain
Cellulomonas denverensis JCM 14733 Type strain
Clostridium nitrophenolicum JCM 14030 Type strain
Coraliomargarita akajimensis JCM 23193 Type strain
Flammeovirga kamogawensis JCM 23196 Type strain
Fusobacterium necrophorum subsp. funduliforme JCM 3724 Type strain
Geosporobacter subterraneus JCM 14037 Type strain
Halomonas arcis JCM 14607 Type strain
Halomonas saccharevitans JCM 14606 Type strain
Halomonas subterranea JCM 14608 Type strain
Janibacter anophelis JCM 14734 Type strain
Kocuria aegyptia JCM 14735 Type strain
Krasilnikovia cinnamonea JCM 13252 Type strain
Lactobacillus camelliae JCM 13995 Type strain
Lactobacillus thailandensis JCM 13996 Type strain
Leucobacter iarius JCM 14736 Type strain
Loktanella maricola JCM 14564 Type strain
Metascardovia criceti JCM 13492
Metascardovia criceti JCM 13493 Type strain
Metascardovia criceti JCM 13494
Microbacterium indicum JCM 21800 Type strain
Micromonospora chokoriensis JCM 13247 Type strain
Micromonospora coxensis JCM 13248 Type strain
Mycobacterium chimaera JCM 14737 Type strain
Mycobacterium cosmeticum JCM 14739 Type strain
Mycobacterium fluoranthenivorans JCM 14741 Type strain
Mycobacterium septicum JCM 14743 Type strain
Mycobacterium triplex JCM 14744 Type strain
Nocardioides exalbidus JCM 23199 Type strain
Paenibacillus taiwanensis JCM 23198 Type strain
Pediococcus siamensis JCM 13997 Type strain
Pelagicoccus albus JCM 23202 Type strain
Pelagicoccus litoralis JCM 23204 Type strain
Pelagicoccus mobilis JCM 23203 Type strain
Perexilibacter aurantiacus JCM 23194 Type strain
Persicitalea jodogahamensis JCM 23195 Type strain
Pigmentiphaga daeguensis JCM 14330 Type strain
Prevotella paludivivens JCM 13650 Type strain
Prevotella paludivivens JCM 13651
Prevotella pleuritidis JCM 14110 Type strain
Pseudomonas butanovora JCM 20651 Type strain
Pseudomonas jianii JCM 20553 Type strain
Pseudonocardia tetrahydrofuranoxydans JCM 14745 Type strain
Psychromonas hadalis JCM 11830 Type strain
Rheinheimera aquimaris JCM 14331 Type strain
Rhodovulum visakhapatnamense JCM 13531 Type strain
Sphaerosporangium melleum JCM 13064 Type strain
Sphaerosporangium melleum JCM 13065
Sphaerosporangium melleum JCM 13066
Sphaerosporangium melleum JCM 13068
Sphaerosporangium rubeum JCM 13067 Type strain
Sphingomonas molluscorum JCM 14122 Type strain
Sporosarcina saromensis JCM 23205 Type strain
Streptomyces vietnamensis JCM 21785 Type strain
Sulfitobacter donghicola JCM 14565 Type strain
Thalassococcus halodurans JCM 13833 Type strain
Virgibacillus halophilus JCM 21758 Type strain
真菌 Rhizopus oryzae JCM 14556
Sporobolomyces phaffii JCM 11491 Type strain
Sporobolomyces phaffii JCM 11492
詳細は以下のサイトをご覧下さい。
http://www.jcm.riken.jp/JCM/catalogue_J.html
┏━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━
┃ 新規公開微生物株由来ゲノムDNA
┗━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━
Lactobacillus murinus JCM 1717T
Clostridium thermocellum JCM 9323
Archaeoglobus fulgidus JCM 9628T
詳細は以下のサイトをご覧下さい。
https://www.brc.riken.jp/lab/dna/ja/JCMDNA.html
┏━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━
┃ 第23回日本微生物生態学会大会附設展示へのご来場有り難うございました
┗━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━
先月の16日(日)から18日(火)までの3日間、愛媛大学城北キャンパスで
開催されました第23回日本微生物生態学会大会においてBRC-JCMの活動を紹介
するためにパネル展示を行いました。台風余波による雨とポスター発表時の熱
気によって会場は汗だくになるほどの蒸し暑さでしたが、その中でも大勢の皆
様にブースにお立ち寄りいただきまして誠に有り難うございました。またアン
ケートを通して貴重なご意見をお聞かせいただきまして有り難うございました。
尚、展示会場にてお配りした最近のトピックスを紹介したチラシ(和文及び英
文)がまだありますのでのご希望の方はお知らせ下さい。今後も様々な学術学
会にて広報活動を行ってまいりますので、よろしくお願い致します。
┏━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━
┃ 微生物株の寄託ならびに公開の証明書の発行
┗━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━
International Journal of Systematic and Evolutionary Microbiology
(IJSEM) 誌に新種等を発表される場合、あるいは本誌の Validation List に新
種等の掲載を依頼する場合、当該種等の基準株が2カ国以上のカルチャーコレ
クションに寄託され、一般に公開されることの証明が求められます。JCMではこ
の IJSEM 誌の方針に沿って、保存微生物株の寄託ならびに公開の証明書を発行
しています。(詳細は<http://www.jcm.riken.jp/JCM/Depositing_J.html>をご
覧下さい。)
┏━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━
┃ 大量依頼の場合に得られる提供手数料の特典システム導入のお知らせ
┗━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━
JCMでは、一度に20株以上を提供する場合、申込数に応じて請求代金がディス
カウントされる特典システムを導入しました。20-49株の場合は約20%、50株以
上の場合は約25%ディスカウントの価格となっています。生物遺伝資源提供同意
書に関しては従来どおりです。
本システムには専用の微生物材料提供依頼書(書式M-4L)がありますので、以
下からダウンロードしてください。
http://www.jcm.riken.jp/JCM/Ordering_J.html
価格に関する詳細は以下をご覧ください。
https://www.brc.riken.jp/inf/distribute/jcmdiscount.shtml
┏━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━
┃ JCM微生物株カタログ第9版 (2005年) について
┗━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━
RIKEN BRC では上記カタログを頒布しております。公開株8,059株 [細菌(放
線菌を含む)4,802株、アーキア(古細菌)204株、真菌(糸状菌および酵母)
3,034株、その他19株]が収載されています。販売価格は 5,250 円 (本体 5,000
円 + 税) で、海外の場合は送料が加算されます。
------------------------
※ メールでの情報提供受信を中止されたい場合は、微生物材料開発室(inquiry@jcm.riken.jp)
まで「メールニュース不要」の旨をご連絡下さい。
※ 当メールへのご質問などは、微生物材料開発室(inquiry@jcm.riken.jp)までお送り下さい。
※ 本メールに記載された内容は予告することなく変更することがあります。
※ 本メールに掲載された記事を許可なく複製・転載することを禁止します。
_____________________________________________
発行
独立行政法人 理化学研究所 バイオリソースセンター
微生物材料開発室 (JCM)
inquiry@jcm.riken.jp
http://www.jcm.riken.jp/
2007年10月4日
_____________________________________________