JCM Mail News No. 10

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RIKEN BioResource Center - Japan Collection of Microorganisms
            JCM Mail News (電子メール版) No. 10
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独立行政法人 理化学研究所 バイオリソースセンター 微生物材料開発室(JCM)
から公開している微生物等の最新情報をお届けします。

━━━━ 目 次 ━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━
● 今月のリソース紹介
● 新規公開微生物株(2006年12月公開)
● 平成18年度技術研修報告
● 今月のFAQコーナー
● 微生物ゲノムDNA試験提供のお知らせ
● 微生物株の寄託ならびに公開の証明書の発行
● JCM微生物株カタログ第9版 (2005年)について
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┃  今月のリソース紹介
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2006年6月~12月に公開された糸状菌類の一部を以下に示します。公開株の内訳
は、接合菌類、担子菌類、子嚢菌類、不完全菌類のタイプ由来株、誌上発表株、
外国産参考株、日本新産種または希少種の分離株などの合計80株です。なお、
他の微生物株を含めた「過去一年間に提供可能になった微生物株」の一覧は、
この項の最後に示すサイトよりご覧いただけますのでご利用ください。
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         Species                       JCM No.            特記事項
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         Bactrodesmium cubense         14126
         Berkleasmium micronesiacum    14127
         Caryospora langloisii         13112, 13115
         Cladosporium colocasiae       13642, 14195
         Exobasidium japonicum         10156, 14106
         Kalmusia scabrispora          12851              ex-paratype
         Karstenula multiseptata       13119
         Karstenula straminis          13123
         Leptosphaeria collinsoniae    13073
         Leptosphaeria galiorum        13075
         Lophiostoma aquaticum         14131
         Lophiotrema boreale           14136
         Lophiostoma nucula            14132
         Lophiostoma quadrinucleatum   14133
         Lophiotrema nucula            14137
         Lophiotrema vagabundum        14138
         Lophiotrema vitigenum         13534              ex-holotype
         Lophiostoma winteri           14134
         Massarina bipolaris           14139
         Massarina cisti               14140
         Massarina constricta          13535              ex-holotype
         Massarina corticola           14141
         Massarina igniaria            14142, 14143
         Massarina japonica            13537              ex-holotype
         Massarina lacustris           13097
         Massarina microspora          14144
         Massarina phragmaticola       14145
         Massarina rubi                14146
         Massarina submediana          13538              ex-holotype
         Massarina thalassioidea       14147
         Massarina uniserialis         13539              ex-holotype
         Massariosphaeria megaspora    13542              ex-holotype
         Massariosphaeria moricola     13541              ex-paratype
         Monodictys putredinis         14128
         Ophiobolus anguillidus        13080
         Ophiosphaerella sasicola      13134
         Ophiostoma davidsonii         7867               ex-type
         Penicillium sp.               13474              誌上発表株
         Pesotum fragrans              11616-11618
         Petrakia echinata             14130
         Phaeosphaeria brevispora      13543              ex-paratype
         Phaeosphaeria caricis         13136
         Phaeosphaeria elongata        13137
         Phaeosphaeria fuckelloides    13140
         Polystigma ochraceum          14166
         Rhizopus azygosporus          12784              誌上発表株
         Rhizopus oryzae               12785, 12786       誌上発表株
         Termitomyces  spp.            11084, 13351       誌上発表株
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過去一年間に提供可能になった微生物株:
        http://www.jcm.riken.jp/cgi-bin/jcm/new_jcm_strains

(先任研究員 岡田元)

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┃  新規公開微生物株(2006年12月公開)
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細菌
         Acaricomes phytoseiuli               JCM 14300   Type strain
         Agrococcus lahaulensis               JCM 14301   Type strain
         Agromyces humatus                    JCM 14319   Type strain
         Agromyces italicus                   JCM 14320   Type strain
         Agromyces lapidis                    JCM 14321   Type strain
         Agromyces neolithicus                JCM 14322   Type strain
         Agromyces salentinus                 JCM 14323   Type strain
         Agromyces subbeticus                 JCM 14324   Type strain
         Bacillus idriensis                   JCM 13437   Type strain
         Bacillus infantis                    JCM 13438   Type strain
         Bacteroides barnesiae                JCM 13653
         Bacteroides barnesiae                JCM 13654
         Bacteroides barnesiae                JCM 13655
         Bacteroides barnesiae                JCM 13656
         Bacteroides barnesiae                JCM 13652   Type strain
         Bacteroides gallinarum               JCM 13659
         Bacteroides gallinarum               JCM 13658   Type strain
         Bacteroides salanitronis             JCM 13657   Type strain
         Capnocytophaga ochracea              JCM 12966   Type strain
         Capnocytophaga sputigena             JCM 12967   Type strain
         Cellulomonas xylanilytica            JCM 14281   Type strain
         Cellulosimicrobium funkei            JCM 14302   Type strain
         Dermacoccus abyssi                   JCM 14339   Type strain
         Desulfosporosinus lacus              JCM 12239   Type strain
         Desulfurobacterium pacificum         JCM 12127   Type strain
         Gillisia myxillae                    JCM 13564   Type strain
         Gordonia soli                        JCM 14298   Type strain
         Isoptericola hypogeus                JCM 14325   Type strain
         Kribbella alba                       JCM 14306   Type strain
         Kribbella karoonensis                JCM 14304   Type strain
         Kribbella lupini                     JCM 14303   Type strain
         Kribbella swartbergensis             JCM 14305   Type strain
         Kribbella yunnanensis                JCM 14307   Type strain
         Lactobacillus agilis                 JCM 1048
         Lactobacillus agilis                 JCM 1049
         Lactobacillus agilis                 JCM 1050
         Lactobacillus agilis                 JCM 1187   Type strain
         Lactobacillus salivarius             JCM 1040
         Lactobacillus salivarius             JCM 1042
         Lactobacillus salivarius             JCM 1044
         Lactobacillus salivarius             JCM 1045
         Lactobacillus salivarius             JCM 1046
         Leptotrichia buccalis                JCM 12969   Type strain
         Marinomonas ostreistagni             JCM 13672   Type strain
         Microbacterium hydrocarbonoxydans    JCM 14340   Type strain
         Microbacterium oleivorans            JCM 14341   Type strain
         Microbacterium paludicola            JCM 14308   Type strain
         Microbacterium ulmi                  JCM 14282   Type strain
         Myceligenerans crystallogenes        JCM 14326   Type strain
         Mycobacterium kumamotonense          JCM 13453   Type strain
         Nesterenkonia aethiopica             JCM 14309   Type strain
         Nocardia gamkensis                   JCM 14299   Type strain
         Nocardioides oleivorans              JCM 14342   Type strain
         Rhodococcus aetherivorans            JCM 14343   Type strain
         Terrabacter terrae                   JCM 14283   Type strain
         Thermovibrio guaymasensis            JCM 12128   Type strain
         Veillonella parvula                  JCM 12972   Type strain
         Williamsia marianensis               JCM 14345   Type strain
         Xylanibacterium ulmi                 JCM 14284   Type strain
アーキア
         Ferroplasma cupricumulans            JCM 13668   Type strain
真菌
         Penicillium sp.                      JCM 13474
         Rhizopus azygosporus                 JCM 12784
         Rhizopus oryzae                      JCM 12785
         Rhizopus oryzae                      JCM 12786
         Termitomyces sp.                     JCM 11084
         Termitomyces sp.                     JCM 11086
         Termitomyces sp.                     JCM 11091
         Termitomyces sp.                     JCM 11092
         Termitomyces sp.                     JCM 11093
         Termitomyces sp.                     JCM 11094
         Termitomyces sp.                     JCM 11095
         Termitomyces sp.                     JCM 11096
         Termitomyces sp.                     JCM 11097
         Termitomyces sp.                     JCM 11110
         Termitomyces sp.                     JCM 11154
         Termitomyces sp.                     JCM 11155
         Termitomyces sp.                     JCM 11157
         Termitomyces sp.                     JCM 11158
         Termitomyces sp.                     JCM 11159
         Termitomyces sp.                     JCM 11161
         Termitomyces sp.                     JCM 11162
         Termitomyces sp.                     JCM 11163
         Termitomyces sp.                     JCM 13351

      詳細は以下のサイトをご覧下さい。
        http://www.jcm.riken.jp/JCM/catalogue_J.html

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┃  平成18年度技術研修報告
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平成19年1月22日(月)および1月 23日(火)の2日間、独立行政法人理化学研
究所和光研究所の微生物系統保存棟のセミナー室及び各実験室に於いて、微生
物材料開発室による第3回技術研修を行いました。今回の課題名は「微生物の
培養、保存方法に関する技術研修」で、好気性細菌、放線菌、酵母、糸状菌、
嫌気性細菌、アーキアの培養法・保存法・復元法について、JCMの担当者全員に
よる講義や技術指導が行われました。受講者は6名(企業:3名、国立研究機
関もしくは独立行政法人機関:2名、大学:1名)で、培地調製、無菌操作、
培養法、凍結乾燥アンプルや凍結標品の作製および復元について、受講者全員
が体験し、全員に修了証が授与されました。

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┃  今月のFAQコーナー
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Q.1 未同定の、あるいは新種等の発表前でまだ学名が決まっていない株を寄託
することは可能でしょうか。
A.1 はい、可能です。その場合は例えば「Unidentified bacterium」などのよ
うに表記してください。また菌株番号、分離に関するデータ、原産国等はお知
らせください。これらの情報は「微生物材料寄託申込書」に記入する場所があ
ります。その他の手続きは通常どおりで、「生物遺伝資源寄託同意書」もしく
は「生物遺伝資源譲渡同意書」もお願いいたします。

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┃  微生物ゲノムDNA試験提供のお知らせ
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理研バイオリソースセンター(RIKEN BRC)遺伝子材料開発室ならびに微生物材
料開発室(JCM)では、JCMに保存されている微生物株由来ゲノムDNAの提供
準備を進めています。両材料開発室は、クローンならびに微生物の提供機関と
して世界的な事業を展開しておりますが、協力体制の下で行う事業は初めての
ことです。そこで、試験提供期間を設け、JCM保有株由来ゲノムDNAの提供事業
を行うことになりました。これまで両材料開発室ユーザーの皆様からのご要望
を多数承っておりましたが、提供がなかなか実現せずご迷惑をおかけいたしま
した。試験提供期間中も、皆様からのご意見を取り入れ、提供対象リソース数
も徐々に増やしていく予定です。詳しくは下記webページを参照してください。
        https://www.brc.riken.jp/lab/dna/ja/JCMDNA.html

対象菌株及び用量
Pyrococus horikoshii JCM 9974(約2μgDNA/バイアル)
Thermus thermophilus JCM 10941(約5μgDNA/バイアル)

提供価格
学術機関:9,450円(送料・消費税込み)
非学術機関:12,285円(送料・消費税込み)

提供申し込み
遺伝子材料提供依頼書(書式A)1部と生物遺伝資源提供同意書(書式C)正本
2部を記入の上、下記までお送り下さい。尚、これらの書式は上記のwebページ
からダウンロードできます。
〒305-0074 茨城県つくば市高野台3-1-1
独立行政法人理化学研究所筑波研究所
研究推進部 企画課バイオリソースセンター受付

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┃  微生物株の寄託ならびに公開の証明書の発行
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 International Journal of Systematic and Evolutionary Microbiology
(IJSEM) 誌に新種等を発表される場合、あるいは本誌の Validation List に新
種等の掲載を依頼する場合、当該種等の基準株が2カ国以上のカルチャーコレ
クションに寄託され、一般に公開されることの証明が求められます。JCMではこ
の IJSEM 誌の方針に沿って、保存微生物株の寄託ならびに公開の証明書を発行
しています。(詳細は<http://www.jcm.riken.jp/JCM/Depositing_J.html>をご
覧下さい。)

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┃  JCM微生物株カタログ第9版 (2005年)について
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 RIKEN BRC では上記カタログを頒布しております。公開株8,059株 [細菌(放
線菌を含む)4,802株、アーキア(古細菌)204株、真菌(糸状菌および酵母)
3,034株、その他19株]が収載されています。販売価格は 5,250 円 (本体 5,000
円 + 税) で、海外の場合は送料が加算されます。

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※ メールでの情報提供受信を中止されたい場合は、微生物材料開発室(inquiry@jcm.riken.jp)
  まで「メールニュース不要」の旨をご連絡下さい。
※ 当メールへのご質問などは、微生物材料開発室(inquiry@jcm.riken.jp)までお送り下さい。
※ 本メールに記載された内容は予告することなく変更することがあります。
※ 本メールに掲載された記事を許可なく複製・転載することを禁止します。
_____________________________________________
発行
独立行政法人 理化学研究所 バイオリソースセンター
微生物材料開発室 (JCM)
inquiry@jcm.riken.jp
http://www.jcm.riken.jp/JCM/JCM_Home_J.html
2007年1月31日
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