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RIKEN BioResource Center - Japan Collection of Microorganisms
JCM Mail News （電子メール版） No. 10
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独立行政法人 理化学研究所 バイオリソースセンター 微生物材料開発室（JCM）
から公開している微生物等の最新情報をお届けします。
━━━━ 目 次 ━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━
● 今月のリソース紹介
● 新規公開微生物株（2006年12月公開）
● 平成18年度技術研修報告
● 今月のFAQコーナー
● 微生物ゲノムDNA試験提供のお知らせ
● 微生物株の寄託ならびに公開の証明書の発行
● JCM微生物株カタログ第９版 (2005年)について
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┃ 今月のリソース紹介
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2006年6月～12月に公開された糸状菌類の一部を以下に示します。公開株の内訳
は、接合菌類、担子菌類、子嚢菌類、不完全菌類のタイプ由来株、誌上発表株、
外国産参考株、日本新産種または希少種の分離株などの合計80株です。なお、
他の微生物株を含めた「過去一年間に提供可能になった微生物株」の一覧は、
この項の最後に示すサイトよりご覧いただけますのでご利用ください。
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Species JCM No. 特記事項
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Bactrodesmium cubense 14126
Berkleasmium micronesiacum 14127
Caryospora langloisii 13112, 13115
Cladosporium colocasiae 13642, 14195
Exobasidium japonicum 10156, 14106
Kalmusia scabrispora 12851 ex-paratype
Karstenula multiseptata 13119
Karstenula straminis 13123
Leptosphaeria collinsoniae 13073
Leptosphaeria galiorum 13075
Lophiostoma aquaticum 14131
Lophiotrema boreale 14136
Lophiostoma nucula 14132
Lophiostoma quadrinucleatum 14133
Lophiotrema nucula 14137
Lophiotrema vagabundum 14138
Lophiotrema vitigenum 13534 ex-holotype
Lophiostoma winteri 14134
Massarina bipolaris 14139
Massarina cisti 14140
Massarina constricta 13535 ex-holotype
Massarina corticola 14141
Massarina igniaria 14142, 14143
Massarina japonica 13537 ex-holotype
Massarina lacustris 13097
Massarina microspora 14144
Massarina phragmaticola 14145
Massarina rubi 14146
Massarina submediana 13538 ex-holotype
Massarina thalassioidea 14147
Massarina uniserialis 13539 ex-holotype
Massariosphaeria megaspora 13542 ex-holotype
Massariosphaeria moricola 13541 ex-paratype
Monodictys putredinis 14128
Ophiobolus anguillidus 13080
Ophiosphaerella sasicola 13134
Ophiostoma davidsonii 7867 ex-type
Penicillium sp. 13474 誌上発表株
Pesotum fragrans 11616-11618
Petrakia echinata 14130
Phaeosphaeria brevispora 13543 ex-paratype
Phaeosphaeria caricis 13136
Phaeosphaeria elongata 13137
Phaeosphaeria fuckelloides 13140
Polystigma ochraceum 14166
Rhizopus azygosporus 12784 誌上発表株
Rhizopus oryzae 12785, 12786 誌上発表株
Termitomyces spp. 11084, 13351 誌上発表株
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過去一年間に提供可能になった微生物株:
http://www.jcm.riken.jp/cgi-bin/jcm/new_jcm_strains
(先任研究員 岡田元)
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┃ 新規公開微生物株（2006年12月公開）
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細菌
Acaricomes phytoseiuli JCM 14300 Type strain
Agrococcus lahaulensis JCM 14301 Type strain
Agromyces humatus JCM 14319 Type strain
Agromyces italicus JCM 14320 Type strain
Agromyces lapidis JCM 14321 Type strain
Agromyces neolithicus JCM 14322 Type strain
Agromyces salentinus JCM 14323 Type strain
Agromyces subbeticus JCM 14324 Type strain
Bacillus idriensis JCM 13437 Type strain
Bacillus infantis JCM 13438 Type strain
Bacteroides barnesiae JCM 13653
Bacteroides barnesiae JCM 13654
Bacteroides barnesiae JCM 13655
Bacteroides barnesiae JCM 13656
Bacteroides barnesiae JCM 13652 Type strain
Bacteroides gallinarum JCM 13659
Bacteroides gallinarum JCM 13658 Type strain
Bacteroides salanitronis JCM 13657 Type strain
Capnocytophaga ochracea JCM 12966 Type strain
Capnocytophaga sputigena JCM 12967 Type strain
Cellulomonas xylanilytica JCM 14281 Type strain
Cellulosimicrobium funkei JCM 14302 Type strain
Dermacoccus abyssi JCM 14339 Type strain
Desulfosporosinus lacus JCM 12239 Type strain
Desulfurobacterium pacificum JCM 12127 Type strain
Gillisia myxillae JCM 13564 Type strain
Gordonia soli JCM 14298 Type strain
Isoptericola hypogeus JCM 14325 Type strain
Kribbella alba JCM 14306 Type strain
Kribbella karoonensis JCM 14304 Type strain
Kribbella lupini JCM 14303 Type strain
Kribbella swartbergensis JCM 14305 Type strain
Kribbella yunnanensis JCM 14307 Type strain
Lactobacillus agilis JCM 1048
Lactobacillus agilis JCM 1049
Lactobacillus agilis JCM 1050
Lactobacillus agilis JCM 1187 Type strain
Lactobacillus salivarius JCM 1040
Lactobacillus salivarius JCM 1042
Lactobacillus salivarius JCM 1044
Lactobacillus salivarius JCM 1045
Lactobacillus salivarius JCM 1046
Leptotrichia buccalis JCM 12969 Type strain
Marinomonas ostreistagni JCM 13672 Type strain
Microbacterium hydrocarbonoxydans JCM 14340 Type strain
Microbacterium oleivorans JCM 14341 Type strain
Microbacterium paludicola JCM 14308 Type strain
Microbacterium ulmi JCM 14282 Type strain
Myceligenerans crystallogenes JCM 14326 Type strain
Mycobacterium kumamotonense JCM 13453 Type strain
Nesterenkonia aethiopica JCM 14309 Type strain
Nocardia gamkensis JCM 14299 Type strain
Nocardioides oleivorans JCM 14342 Type strain
Rhodococcus aetherivorans JCM 14343 Type strain
Terrabacter terrae JCM 14283 Type strain
Thermovibrio guaymasensis JCM 12128 Type strain
Veillonella parvula JCM 12972 Type strain
Williamsia marianensis JCM 14345 Type strain
Xylanibacterium ulmi JCM 14284 Type strain
アーキア
Ferroplasma cupricumulans JCM 13668 Type strain
真菌
Penicillium sp. JCM 13474
Rhizopus azygosporus JCM 12784
Rhizopus oryzae JCM 12785
Rhizopus oryzae JCM 12786
Termitomyces sp. JCM 11084
Termitomyces sp. JCM 11086
Termitomyces sp. JCM 11091
Termitomyces sp. JCM 11092
Termitomyces sp. JCM 11093
Termitomyces sp. JCM 11094
Termitomyces sp. JCM 11095
Termitomyces sp. JCM 11096
Termitomyces sp. JCM 11097
Termitomyces sp. JCM 11110
Termitomyces sp. JCM 11154
Termitomyces sp. JCM 11155
Termitomyces sp. JCM 11157
Termitomyces sp. JCM 11158
Termitomyces sp. JCM 11159
Termitomyces sp. JCM 11161
Termitomyces sp. JCM 11162
Termitomyces sp. JCM 11163
Termitomyces sp. JCM 13351
詳細は以下のサイトをご覧下さい。
http://www.jcm.riken.jp/JCM/catalogue_J.html
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┃ 平成18年度技術研修報告
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平成19年1月22日（月）および1月 23日（火）の２日間、独立行政法人理化学研
究所和光研究所の微生物系統保存棟のセミナー室及び各実験室に於いて、微生
物材料開発室による第３回技術研修を行いました。今回の課題名は「微生物の
培養、保存方法に関する技術研修」で、好気性細菌、放線菌、酵母、糸状菌、
嫌気性細菌、アーキアの培養法・保存法・復元法について、JCMの担当者全員に
よる講義や技術指導が行われました。受講者は６名（企業：３名、国立研究機
関もしくは独立行政法人機関：２名、大学：１名）で、培地調製、無菌操作、
培養法、凍結乾燥アンプルや凍結標品の作製および復元について、受講者全員
が体験し、全員に修了証が授与されました。
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┃ 今月のFAQコーナー
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Q.1 未同定の、あるいは新種等の発表前でまだ学名が決まっていない株を寄託
することは可能でしょうか。
A.1 はい、可能です。その場合は例えば「Unidentified bacterium」などのよ
うに表記してください。また菌株番号、分離に関するデータ、原産国等はお知
らせください。これらの情報は「微生物材料寄託申込書」に記入する場所があ
ります。その他の手続きは通常どおりで、「生物遺伝資源寄託同意書」もしく
は「生物遺伝資源譲渡同意書」もお願いいたします。
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┃ 微生物ゲノムDNA試験提供のお知らせ
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理研バイオリソースセンター（RIKEN BRC）遺伝子材料開発室ならびに微生物材
料開発室（JCM）では、JCMに保存されている微生物株由来ゲノムＤＮＡの提供
準備を進めています。両材料開発室は、クローンならびに微生物の提供機関と
して世界的な事業を展開しておりますが、協力体制の下で行う事業は初めての
ことです。そこで、試験提供期間を設け、JCM保有株由来ゲノムDNAの提供事業
を行うことになりました。これまで両材料開発室ユーザーの皆様からのご要望
を多数承っておりましたが、提供がなかなか実現せずご迷惑をおかけいたしま
した。試験提供期間中も、皆様からのご意見を取り入れ、提供対象リソース数
も徐々に増やしていく予定です。詳しくは下記webページを参照してください。
https://www.brc.riken.jp/lab/dna/ja/JCMDNA.html
対象菌株及び用量
Pyrococus horikoshii JCM 9974（約2μgDNA/バイアル）
Thermus thermophilus JCM 10941（約5μgDNA/バイアル）
提供価格
学術機関：9,450円（送料・消費税込み）
非学術機関：12,285円（送料・消費税込み）
提供申し込み
遺伝子材料提供依頼書（書式A）1部と生物遺伝資源提供同意書（書式C）正本
2部を記入の上、下記までお送り下さい。尚、これらの書式は上記のwebページ
からダウンロードできます。
〒305-0074 茨城県つくば市高野台3-1-1
独立行政法人理化学研究所筑波研究所
研究推進部 企画課バイオリソースセンター受付
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┃ 微生物株の寄託ならびに公開の証明書の発行
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International Journal of Systematic and Evolutionary Microbiology
(IJSEM) 誌に新種等を発表される場合、あるいは本誌の Validation List に新
種等の掲載を依頼する場合、当該種等の基準株が２カ国以上のカルチャーコレ
クションに寄託され、一般に公開されることの証明が求められます。JCMではこ
の IJSEM 誌の方針に沿って、保存微生物株の寄託ならびに公開の証明書を発行
しています。（詳細は<http://www.jcm.riken.jp/JCM/Depositing_J.html>をご
覧下さい。）
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┃ JCM微生物株カタログ第９版 (2005年)について
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RIKEN BRC では上記カタログを頒布しております。公開株8,059株 [細菌（放
線菌を含む）4,802株、アーキア（古細菌）204株、真菌（糸状菌および酵母）
3,034株、その他19株]が収載されています。販売価格は 5,250 円 (本体 5,000
円 + 税) で、海外の場合は送料が加算されます。
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※ メールでの情報提供受信を中止されたい場合は、微生物材料開発室(inquiry@jcm.riken.jp)
まで「メールニュース不要」の旨をご連絡下さい。
※ 当メールへのご質問などは、微生物材料開発室(inquiry@jcm.riken.jp)までお送り下さい。
※ 本メールに記載された内容は予告することなく変更することがあります。
※ 本メールに掲載された記事を許可なく複製・転載することを禁止します。
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発行
独立行政法人 理化学研究所 バイオリソースセンター
微生物材料開発室 (JCM)
inquiry@jcm.riken.jp
http://www.jcm.riken.jp/JCM/JCM_Home_J.html
2007年1月31日
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