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RIKEN BioResource Center - Japan Collection of Microorganisms
JCM Mail News （電子メール版） No. 9
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独立行政法人 理化学研究所 バイオリソースセンター 微生物材料開発室（JCM）
から公開している微生物等の最新情報をお届けします。
━━━━ 目 次 ━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━
● IAMカルチャーコレクション株の理研BRC-JCMへの移管について
● 今月のリソース紹介
● 新規公開微生物株（2006年11月公開）
● 今月のFAQコーナー
● 微生物ゲノムDNA試験提供のお知らせ
● 微生物株の寄託ならびに公開の証明書の発行
● JCM微生物株カタログ第９版 (2005年)について
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┃ IAMカルチャーコレクション株の理研BRC-JCMへの移管について
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東京大学分子細胞生物学研究所のIAMカルチャーコレクションで保有されている
株のうち、微細藻類を除く全菌株（細菌、酵母、糸状菌）が理研BRC-JCMに移管
されることになりました。これらは平成19年4月からJCMから提供が開始される
予定です。なお、乳業分野における抗生物質試験菌Geobacillus
stearothermophilus IAM 12043はJCM 14450として、平成19年1月1日から提供を
開始いたします。どうぞよろしくお願い申し上げます。
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┃ 今月のリソース紹介
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多国間型国際協力プロジェクト「アジア地域の微生物研究ネットワークに関す
る研究 (Asian Network on Microbial Researches, ANMR)」の一環およびそれ
以前のタイ国との共同研究によって発表されたタイ国産の新種酵母50株が公開
されていますので、ご利用ください。
Tはその種のtype strainであることを示しています。
Bensingtonia musae JCM 8801T
Bensingtonia thailandica JCM 10651T, JCM 10652, JCM 10653, JCM 10654,
JCM 10655, JCM 10656, JCM 10657, JCM 10658,
JCM 10659, JCM 10660
Bullera arundinariae JCM 11818T
Bullera panici JCM 11819T
Bullera penniseticola JCM 9857T
Bullera sakaeratica JCM 11900T, JCM 11901
Bullera siamensis JCM 11820T, JCM 11821, JCM 11822
Bullera koratensis JCM 12878T
Bullera lagerstroemiae JCM 12877T
Candida stellimalicoa JCM 3546T
Kockovaella barringtoniae JCM 10998T
Kockovaella imperatae JCM 7826T
Kockovaella thailandica JCM 7824T, JCM 7825, JCM 9859, JCM 9860,
JCM 11000
Kockovaella sacchari JCM 9858T, JCM 10999
Sporobolomyces blumeae JCM 10212T
Sporobolomyces nylandii JCM 10213T, JCM 10214, JCM 10215
Sporobolomyces poonsookiae JCM 10206, JCM 10207T, JCM 10208, JCM 10209,
JCM 10210, JCM 10211, JCM 11514, JCM 11515
Sporobolomyces vermiculatus JCM 10221, JCM 10222, JCM 10223, JCM 10224T
Tilletiopsis derxii JCM 10217T
Tilletiopsis oryzicola JCM 10218T
Tilletiopsis penniseti JCM 10216T
(担当：先任研究員 鈴木基文)
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┃ 新規公開微生物株（2006年11月公開）
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細菌 Anaerovirgula multivorans JCM 12857 Type strain
Desulfotomaculum thermosubterraneum JCM 13837 Type strain
Glaciecola nitratireducens JCM 12485 Type strain
Lactobacillus vini JCM 14280 Type strain
Lishizhenia caseinilytica JCM 13821 Type strain
Methyloversatilis universalis JCM 13912 Type strain
Paracoccus sulfuroxidans JCM 14013 Type strain
Pasteurella pneumotropica JCM 14074 Type strain
Pediococcus cellicola JCM 14152 Type strain
Tuberibacillus calidus JCM 13397 Type strain
アーキア Natrinema ejinorense JCM 13890 Type strain
真菌 Polystigma ochraceum JCM 14166
詳細は以下のサイトをご覧下さい。
http://www.jcm.riken.jp/JCM/catalogue_J.html
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┃ 今月のFAQコーナー
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Q.1 コレクションによってカビや酵母のtype strainの表記法が異なるのはな
ぜでしょうか？
A.1 菌類（キノコ、カビ、酵母の仲間）の命名に関する事柄は国際植物命名規
約 (International Code of Botanical Nomenclature) により定められていま
す。細菌で使われているtype strain（基準株）という用語は、この規約では使
用されていません。植物や菌類では、学名のタイプ（基準）は原則的に生きて
いるものであってはならず（例外的に、代謝が不活性な状態の凍結乾燥標品な
どはタイプとして近年認められるようになった）、乾燥標本や図版を指定しま
す。しかし、タイプより由来した生きた菌株は実用上有用であるため、「タイ
プ由来株(ex-type strain)」などのように正式には表記し、比較検討などの際
に用います。このように、菌類では増殖している菌株そのものは命名法上のタ
イプではなく、またtype strainという表記そのものも規約上認められていませ
んが、細菌を含む微生物株のユーザーに分かりやすくするために、特に酵母で
はex-type strainの代わりにtype strainを用いることがよくあります。なお、
キノコやカビでは培養困難なものが多く、また命名の出発点がリンネの時代
（1753年）までさかのぼるため、タイプ由来株が存在しないことがほとんどで
す。
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┃ 微生物ゲノムDNA試験提供のお知らせ
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理研バイオリソースセンター（RIKEN BRC）遺伝子材料開発室ならびに微生物材
料開発室（JCM）では、JCMに保存されている微生物株由来ゲノムＤＮＡの提供
準備を進めています。両材料開発室は、クローンならびに微生物の提供機関と
して世界的な事業を展開しておりますが、協力体制の下で行う事業は初めての
ことです。そこで、試験提供期間を設け、JCM保有株由来ゲノムDNAの提供事業
を行うことになりました。これまで両材料開発室ユーザーの皆様からのご要望
を多数承っておりましたが、提供がなかなか実現せずご迷惑をおかけいたしま
した。試験提供期間中も、皆様からのご意見を取り入れ、提供対象リソース数
も徐々に増やしていく予定です。詳しくは下記webページを参照してください。
https://www.brc.riken.jp/lab/dna/ja/JCMDNA.html
対象菌株及び用量
Pyrococus horikoshii JCM 9974（約2μgDNA/バイアル）
Thermus thermophilus JCM 10941（約5μgDNA/バイアル）
提供価格
学術機関：9,450円（送料・消費税込み）
非学術機関：12,285円（送料・消費税込み）
提供申し込み
遺伝子材料提供依頼書（書式A）1部と生物遺伝資源提供同意書（書式C）正本
2部を記入の上、下記までお送り下さい。尚、これらの書式は上記のwebページ
からダウンロードできます。
〒305-0074 茨城県つくば市高野台3-1-1
独立行政法人理化学研究所筑波研究所
研究推進部 企画課バイオリソースセンター受付
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┃ 微生物株の寄託ならびに公開の証明書の発行
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International Journal of Systematic and Evolutionary Microbiology
(IJSEM) 誌に新種等を発表される場合、あるいは本誌の Validation List に新
種等の掲載を依頼する場合、当該種等の基準株が２カ国以上のカルチャーコレ
クションに寄託され、一般に公開されることの証明が求められます。JCMではこ
の IJSEM 誌の方針に沿って、保存微生物株の寄託ならびに公開の証明書を発行
しています。（詳細は<http://www.jcm.riken.jp/JCM/Depositing_J.html>をご
覧下さい。）
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┃ JCM微生物株カタログ第９版 (2005年)について
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RIKEN BRC では上記カタログを頒布しております。公開株8,059株 [細菌（放
線菌を含む）4,802株、アーキア（古細菌）204株、真菌（糸状菌および酵母）
3,034株、その他19株]が収載されています。販売価格は 5,250 円 (本体 5,000
円 + 税) で、海外の場合は送料が加算されます。
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※ メールでの情報提供受信を中止されたい場合は、微生物材料開発室(inquiry@jcm.riken.jp)
まで「メールニュース不要」の旨をご連絡下さい。
※ 当メールへのご質問などは、微生物材料開発室(inquiry@jcm.riken.jp)までお送り下さい。
※ 本メールに記載された内容は予告することなく変更することがあります。
※ 本メールに掲載された記事を許可なく複製・転載することを禁止します。
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発行
独立行政法人 理化学研究所 バイオリソースセンター
微生物材料開発室 (JCM)
inquiry@jcm.riken.jp
http://www.jcm.riken.jp/JCM/JCM_Home_J.html
2006年12月27日
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