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RIKEN BioResource Center - Japan Collection of Microorganisms
JCM Mail News （電子メール版） No. 7
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独立行政法人 理化学研究所 バイオリソースセンター 微生物材料開発室（JCM）
から公開している微生物等の最新情報をお届けします。
━━━━ 目 次 ━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━
● 今月のリソース紹介
● 微生物ゲノムDNA試験提供のお知らせ
● 新規公開微生物株（2006年9月公開）
● 研修事業のご案内
● JSCCカタログ編集に参加しました
● 微生物株の寄託ならびに公開の証明書の発行
● JCM微生物株カタログ第９版 (2005年)について
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┃ 今月のリソース紹介
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16S rRNA遺伝子塩基配列解析によるLactobacillus属提供株の品質保証
（辨野義己）
近年、数多くの乳酸菌の新種が発表され、Lactobacillus属に属する菌種は107
種9亜種に達しております(2006年9月現在)。微生物材料開発室（JCM）には数
多くのLactobacillus属の菌種・菌株が保存され、それらを提供しております。
JCMが微生物株の提供事業を開始した当初からLactobacillus属はその一翼を担
ってまいりました。現在、新規に登録される細菌・古細菌に関しましては、各
種性状および16S rRNA遺伝子の塩基配列等の検討を行い、記述通りなのかどう
かの確認後、提供されるシステムとなっております。しかしながら、それ以前
に寄託された菌株（主に参考株）の中には必ずしも16S rRNA遺伝子塩基配列が
決定されていない菌株も多数存在し、現在、特にLactobacillus属についてこ
の確認を行っております。現在のところ、約11.6%の菌株について再検討をし
なければならないことが判明いたしました。皆様が安心して優れた研究・検査
にご使用いただくため、微生物株は正しい学名のもとに提供されなければなり
ません。再同定を含めた検査はこのためにも重要であると考えております。今
後、他の属の菌株につきましても、順次、同様の検査を実施していく所存です。
どうぞ、皆様のご支援をなにとぞよろしくお願い申し上げます。
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┃ 新規公開微生物 2006年9月
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細菌 Actinomyces gerencseriae JCM 12963 Type strain
Actinomyces ruminicola JCM 13352 Type strain
Pseudonocardia oroxyli JCM 13909 Type strain
Pedobacter aquatilis JCM 13454 Type strain
Pedobacter roseus JCM 13399 Type strain
Roseivirga spongicola JCM 13337 Type strain
Shimia marina JCM 13038 Type strain
Trichococcus patagoniensis JCM 12176 Type strain
Xylanibacter oryzae JCM 13648 Type strain
Xylanibacter oryzae JCM 13649
Zymomonas mobilis subsp. mobilis JCM 10190
真菌 Bullera panici JCM 11819 Type strain
詳細は以下のサイトをご覧下さい。
http://www.jcm.riken.jp/JCM/catalogue_J.html
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┃ 研修事業のご案内
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平成１８年度研修事業について
昨年度に引き続き、微生物の培養・保存に関する技術研修を行うことになりま
したので、ご案内申し上げます。
本年度は好気性細菌、嫌気性細菌、放線菌、アーキア（古細菌）、酵母および
糸状菌類の培養・保存法について初心者を対象に講義および実習を行います。
研修期間：平成１９年１月２２日（月）-１月２３日（火）の２日間
研修場所：独立行政法人理化学研究所 和光研究所 微生物系統保存棟内
定員：５名程度
詳細につきましては、近日中に筑波研究所の理研バイオリソースセンターのホ
ームページで公開する予定です。
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┃ 微生物ゲノムDNA試験提供のお知らせ
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理研バイオリソースセンター（BRC）遺伝子材料開発室ならびに理研BRC微生物
材料開発室（JCM）では、BRC-JCMに保存されている微生物株由来ゲノムＤＮＡ
の提供準備を進めています。両材料開発室は、クローンならびに微生物の提供
機関として世界的な事業を展開しておりますが、協力体制の下で行う事業は初
めてのことです。そこで、試験提供期間を設け、BRC-JCM保有株由来ゲノムDNA
の提供事業を行うことになりました。これまで両材料開発室ユーザーの皆様か
らのご要望を多数承っておりましたが、提供がなかなか実現せずご迷惑をおか
けいたしました。試験提供期間中も、皆様からのご意見を取り入れ、提供対象
リソース数も徐々に増やしていく予定です。詳しくは下記webページを参照し
てください。
https://www.brc.riken.jp/lab/dna/ja/JCMDNA.html
対象菌株及び用量
Pyrococus horikoshii JCM 9974（約2μgDNA/バイアル）
Thermus thermophilus JCM 10941（約5μgDNA/バイアル）
提供価格
学術機関：9,450円（送料・消費税込み）
非学術機関：12,285円（送料・消費税込み）
提供申し込み
遺伝子材料提供依頼書（書式A）1部と生物遺伝資源提供同意書（書式C）正本2
部を記入の上、下記までお送り下さい。尚、これらの書式は上記のwebページ
からダウンロードできます。
〒305-0074 茨城県つくば市高野台3-1-1
独立行政法人理化学研究所筑波研究所
研究推進部 企画課バイオリソースセンター受付
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┃ JSCCカタログデータベースに参加しました
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日本微生物資源学会（JSCC）が微生物株のone stop shopの試みとしてカタロ
グデータベースの公開を始めました。現在は、BRC-JCMの他に、IAM [東大分生
研]、NIAS [農業生物資源研]、NIES [国立環境研]およびNITE [製品評価技術
基盤機構]のデータが収載されています。こちらからご利用ください。
http://www.jscc-home.jp/
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┃ 微生物株の寄託ならびに公開の証明書の発行
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International Journal of Systematic and Evolutionary Bacteriology
(IJSEM) 誌に新種等を発表される場合、あるいは本誌の Validation List に
新種等の掲載を依頼する場合、当該種等の基準株が２カ国以上のカルチャーコ
レクションに寄託され、一般に公開されることの証明が求められます。JCMで
はこの IJSEM 誌の方針に沿って、保存微生物株の寄託ならびに公開の証明書
を発行しています。（詳細は<http://www.jcm.riken.jp/JCM/Depositing_J.html
>をご覧下さい。）
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┃ JCM微生物株カタログ第９版 (2005年)について
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理研BRC では上記カタログを頒布しております。公開株8,059株 [細菌（放
線菌を含む）4,802株、アーキア（古細菌）204株、真菌（糸状菌および酵母）
3,034株、その他19株]が収載されています。販売価格は 5,250 円 (本体
5,000円 + 税) で、海外の場合は送料が加算されます。
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※ メールでの情報提供受信を中止されたい場合は、微生物材料開発室(inquiry@jcm.riken.jp)
まで「メールニュース不要」の旨をご連絡下さい。
※ 当メールへのご質問などは、微生物材料開発室(inquiry@jcm.riken.jp)までお送り下さい。
※ 本メールに記載された内容は予告することなく変更することがあります。
※ 本メールに掲載された記事を許可なく複製・転載することを禁止します。
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発行
独立行政法人 理化学研究所 バイオリソースセンター
微生物材料開発室 (JCM)
inquiry@jcm.riken.jp
http://www.jcm.riken.jp/JCM/JCM_Home_J.html
2006年10月30日
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