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RIKEN BioResource Center - Japan Collection of Microorganisms
JCM Mail News （電子メール版） No. 94
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理化学研究所 バイオリソースセンター 微生物材料開発室（JCM）
が公開している微生物等の最新情報をお届けします。
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● 今月のトピックス「幻の腎臓型酵母Reniforma strues」
● 新規公開微生物株（2015年11-12月公開）
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┃ 今月のトピックス「幻の腎臓型酵母Reniforma strues」
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我々の身の回りは肉眼では見えない微生物たちで満ち溢れています。見えない
はずの微生物たちが見えてしまう主人公の大学院生活を描いた某漫画の影響で、
微生物により親しみを感じるようになった方も多いのではないでしょうか。この
世には数多の菌類Fungiが棲息しており、その種数は少なくとも約150万といわれ
ます（Hawksworth, 2012）。一方で記載されている菌類はおよそ10万種とされま
す（Kirk et al., 2008; Blackwell, 2011）。菌類の総種数や記載種数について
は諸説ありますが、我々人類が名前をつけていない、あるいは誰も分離したこと
がない菌類が相当数に上ることは確かなようです。
記載こそされてはいても、自然界でどのように棲息しているのかほとんど情報
が無い種は数多く存在します。今日ご紹介するのはそんな謎の多い酵母、
Reniforma struesです。Reniforma struesの最大の特徴は、珍奇なその細胞形態
と増殖様式にあります。属名が示す通り、細胞が腎臓型reniformをしており、な
おかつ出芽によって増殖します。細胞がアルファベットの“Ｃ”の形をしており、
Ｃの字の先端から小さなＣの字が芽を出して増殖する、と表現すればイメージが
つきやすいでしょうか。Large subunit ribosomal RNA遺伝子やITSなど、菌類の
DNAバーコード領域の塩基配列が解読されており、系統的には担子菌門
(Basidiomycota)サビキン亜門(Pucciniomycotina)に属することが明らかになっ
ています（Schell et al., 2011）。また、生理生化学的性状も調べられており、
栄養源として利用できる炭素源が極めて限られていることも判明しています。
Reniforma struesはアメリカ合衆国ウェストバージニア州の排水処理施設の曝
気槽に生じたバイオフィルムから分離され、Pore and Sorenson (1990)により
新種記載されました。The Yeast, a Taxonomic Study 第5版によれば、Reniforma
struesは「1983年から1990年にウェストバージニア州とペンシルベニア州の排水
処理施設から分離された」と記述されていることから、複数回にわたって検出さ
れたようですが、菌株としては世界に１株しか現存していません（残念ながら菌
株は当方JCMには保存されていません）。また、筆者の知る限りPore and
Sorenson (1990)以降にReniforma struesを分離または検出したという記録は無く、
幻の酵母と言えます。
近年、いわゆる次世代シーケンサーの普及により、環境中のどこにどんな菌類
が棲息しているか遺伝情報から推定することが急速に容易になってきました。に
もかかわらず、自然界におけるReniforma struesの存在は杳としてつかめてい
ません。先述したように、膨大な種数の菌類が自然界に棲息していることは間違
いありません。これは、機能未知の菌類リソースが手つかずの状態で眠っている
と言い換えても過言ではないでしょう。それらをいかにして掘り出し、利活用へ
つなげていくかが大きな課題です。
国内で幻の腎臓型酵母Reniforma struesを発見されましたら、論文発表と共に
是非ともJCMへ寄託いただきますようお願い申し上げます。
遠藤 力也（酵母・酵母様藻類担当）
参考文献
1) Hawksworth DL (2012) Biodiversity and Conservation 21:2425-2433.
2) Kirk PM et al. (2008) Ainsworth & Bisby’s dictionary of the fungi,
10th edn. CAB International, Wallingford.
3) Blackwell M (2011) American Journal of Botany 98:426-438.
4) Schell et al. (2011) Mycologia 103:1331-1340.
5) Pore RS & Sorenson WG (1990) Mycologia 82:549-553.
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┃ 新規公開微生物株（2015年11-12月公開）
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細菌
Alkalimicrobium pacificum JCM 19851 Type strain
Amycolatopsis cihanbeyliensis JCM 31029 Type strain
Amycolatopsis stemonae JCM 30050 Type strain
Aureimonas glaciistagni JCM 30183 Type strain
Aureimonas sp. JCM 18007
Bacillus lycopersici JCM 19140 Type strain
Bifidobacterium bifidum JCM 19472
Bifidobacterium bifidum JCM 19473
Bifidobacterium bifidum JCM 19475
Bifidobacterium bifidum JCM 19477
Bifidobacterium bifidum JCM 19479
Bifidobacterium bifidum JCM 19481
Bizionia arctica JCM 30333 Type strain
Bizionia fulviae JCM 30417 Type strain
Bradyrhizobium oligotrophicum JCM 18005
Bradyrhizobium sp. JCM 18004
Brevirhabdus pacifica JCM 19489 Type strain
Celeribacter naphthalenivorans JCM 30679 Type strain
"Chryseobacterium profundimaris" JCM 19801 Proposed type strain
Chryseobacterium solani JCM 19456 Type strain
"Cohnella humi" JCM 18164 Proposed type strain
Croceifilum oryzae JCM 30426 Type strain
Diaphorobacter polyhydroxybutyrativorans JCM 30411 Type strain
Domibacillus tundrae JCM 30371 Type strain
"Faecalibaculum rodentium" JCM 30274 Proposed type strain
Flavobacterium procerum JCM 30113 Type strain
Flindersiella endophytica JCM 31030 Type strain
Fusibacter fontis JCM 19912 Type strain
Gordonia neofelifaecis JCM 31031 Type strain
Haliea atlantica JCM 30304 Type strain
Jatrophihabitans fulvus JCM 30448 Type strain
Kineosporia babensis JCM 31032 Type strain
"Lentibacillus amyloliquefaciens" JCM 19838
Lunatimonas lonarensis JCM 18822 Type strain
Lysinibacillus fusiformis JCM 31033 Type strain
Mameliella atlantica JCM 30230 Type strain
Marinobacter halophilus JCM 30472 Type strain
Maritimibacter lacisalsi JCM 30555 Type strain
Mesorhizobium acaciae JCM 30534 Type strain
Methylobacterium sp. JCM 18006
Microbacterium rhizomatis JCM 30598 Type strain
Micromonospora avicenniae JCM 31034 Type strain
Micromonospora equina JCM 31035 Type strain
Micromonospora haikouensis JCM 31036 Type strain
Micromonospora nickelidurans JCM 30559 Type strain
Micromonospora sonneratiae JCM 31037 Type strain
Micromonospora wenchangensis JCM 31038 Type strain
Mucilaginibacter ginsengisoli JCM 30759 Type strain
Mythylomagnum ishizawai JCM 18894 Type strain
Nonomuraea polychroma JCM 6834 Type strain
Oceanisphaera psychrotolerans JCM 30466 Type strain
"Paenibacillus alba" JCM 18165 Proposed type strain
Paenibacillus hemerocallicola JCM 19572 Type strain
"Paenibacillus humi" JCM 18166 Proposed type strain
Paenibacillus oenotherae JCM 19573 Type strain
Paenibacillus yunnanensis JCM 30593 Type strain
Pantoea sp. JCM 30570
Pantoea sp. JCM 30571
Pantoea sp. JCM 30572
Pantoea sp. JCM 30573
Pantoea sp. JCM 30574
Pantoea sp. JCM 30575
Pantoea sp. JCM 30576
Phaeocystidibacter marisrubri JCM 30614 Type strain
Plantactinospora endophytica JCM 31039 Type strain
Pseudomaricurvus alcaniphilus JCM 18313 Type strain
Pseudomonas salina JCM 19469 Type strain
Pseudoxanthomonas sangjuensis JCM 19948 Type strain
Qipengyuania sediminis JCM 30182 Type strain
Saccharopolyspora halotolerans JCM 31077 Type strain
"Seohaeicola westpacificensis" JCM 18883 Proposed type strain
Shimia sagamensis JCM 30583 Type strain
Sinimarinibacterium flocculans JCM 17606
Sinimarinibacterium flocculans JCM 17607 Type strain
Solirubrobacter phytolaccae JCM 31078 Type strain
Solirubrobacter taibaiensis JCM 31079 Type strain
Streptomonospora sediminis JCM 31080 Type strain
"Streptomyces vayuensis" JCM 13217
Tamilnaduibacter salinus JCM 30174 Type strain
Tamilnaduibacter salinus JCM 30175
Terrisporobacter petrolearius JCM 19845 Type strain
Tumebacillus luteolus JCM 19866 Type strain
Tumebacillus luteolus JCM 19867
Verrucosispora maris JCM 31040 Type strain
Verrucosispora wenchangensis JCM 31041 Type strain
Vibrio oceanisediminis JCM 30409 Type strain
Vitellibacter echinoideorum JCM 30378 Type strain
Winogradskyella eckloniae JCM 18703 Type strain
Youhaiella tibetensis JCM 19854 Type strain
アーキア
Haloarchaeobius amylolyticus JCM 18642 Type strain
"Halorubrum rutilum" JCM 30030 Proposed type strain
Halorussus amylolyticus JCM 18367 Type strain
Halosimplex litoreum JCM 18647 Type strain
Halorientalis brevis JCM 18366 Type strain
Halarchaeum grantii JCM 19585 Type strain
Halarchaeum grantii JCM 18422
Halarchaeum grantii JCM 19586
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https://jcm.brc.riken.jp/ja/catalogue
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発行
理化学研究所 バイオリソースセンター
微生物材料開発室 (JCM)
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2016年1月29日
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