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RIKEN BioResource Center - Japan Collection of Microorganisms
JCM Mail News （電子メール版） No. 102
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理化学研究所 バイオリソースセンター 微生物材料開発室（JCM）
が公開している微生物等の最新情報をお届けします。
━━━━ 目 次 ━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━
● 理化学研究所バイオリソースセンター 一般公開のお知らせ
● 今月のリソース紹介「共培養を必要とする菌株」
● 被災地の研究者へのバイオリソース無償提供について
● 新規公開微生物株（2016年12月-2017年2月公開）
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┃ 理化学研究所バイオリソースセンター 一般公開のお知らせ
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理化学研究所バイオリソースセンターの一般公開が以下の通り行われます。
皆様のご来場をお待ちしております。
日時：4月21日（金）13:00 - 16:00 および 22日（土）10:00 - 16:00
場所：国立研究開発法人 理化学研究所 筑波事業所（つくば市高野台3-1-1）
バイオリソース棟１階、細胞研究リソース棟１階、事務棟１階、２階
詳細は以下のサイトをご覧ください。
http://rtcweb.rtc.riken.jp/opencampus/index.html
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┃ 今月のリソース紹介「共培養を必要とする菌株」
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ヒトの口腔・腸内細菌叢などの常在微生物叢は、我々が想像していた以上に
多種多様な細菌種で構成されており、その多くが未分離・未分類の細菌種であ
ることが明らかになっています。近年寄託される菌株の中には、その菌株だけ
では生育が困難で、発育を助ける菌株（helper strain）との共培養を必要と
するユニークな菌株が存在します。口腔から分離されたFretibacterium
fastidiosum（JCM 16858T）はSynergistetes門に属する菌種で、これまで培養
を介さない16S rRNA遺伝子クローンライブラリー法で数多くのクローンが検出
されていましたが、口腔細菌の研究で有名な英国のWilliam G. Wade教授らの
グループの長年の努力の結果、ようやく単離に成功しました。本菌種はhelper
strainとしてFusobacterium nucleatum subsp. nucleatumを必要とします。
Wade教授らは口腔の健康と関連があるTannerella sp. HOT-286（ファイロタイ
プBU063）の培養にも成功しており、当室にはTannerella sp.JCM 31301、
JCM 31302およびJCM 31303の3株が寄託されています。これらの菌株はhelper
strainとしてPropionibacterium acnes subsp. acnesを必要とします。また、
口腔由来のChloroflexi門に属するファイロタイプAnaerolineae bacterium
HOT-439の初めての培養株としてUnidentified bacterium JCM 31632および
JCM 31633の2株も寄託されており、これらの菌株はその培養にFusobacterium
nucleatum subsp. polymorphumを必要とします。今後共培養を必要とする菌株
がさらに分離・培養されることにより、微生物叢の共生メカニズムが紐解かれ
ると期待されます。
参考文献
Vartoukian et al. 2013. Fretibacterium fastidiosum gen. nov., sp. nov.,
isolated from the human oral cavity. Int. J. Syst. Evol. Microbiol. 63:
458-463.
doi: 10.1099/ijs.0.041038-0
Vartoukian et al. 2016. First cultivation of health-sssociated
Tannerella sp. HOT-286 (BU063). J. Dent. Res. 95: 1308-1313.
doi: 10.1177/0022034516651078
Vartoukian et al. 2016. In vitro cultivation of 'unculturable' oral
bacteria, facilitated by community culture and media supplementation
with siderophores. PLOS ONE 11: e0146926.
doi: 10.1371/journal.pone.0146926
坂本 光央（嫌気性細菌および乳酸菌担当）
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┃ 被災地の研究者へのバイオリソース無償提供について
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熊本地震により被災された皆様に心よりお見舞い申し上げます。
被災地の研究者の支援として、理化学研究所バイオリソースセンターは、当
センターが提供したバイオリソースの中で、震災で利用不可能になったバイオ
リソースを無償にて再提供いたします。また、震災の影響のあった大学、研究
機関、企業などで、当センターが保有するリソースをご希望の方は別途ご相談
ください。
詳細は以下のサイトをご覧ください。
https://ja.brc.riken.jp/news/shinsai_2016.shtml
なお、理化学研究所では、この他にも支援を行っております。支援内容につ
いては、以下のURLをご参照ください。
http://www.riken.jp/pr/topics/2016/20160421_2/
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┃ 新規公開微生物株（2016年12月-2017年2月公開）
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細菌
Actinocorallia lasiicapitis JCM 31763 Type strain
Actinokineospora guangxiensis JCM 31764 Type strain
Actinokineospora spheciospongiae JCM 31756 Type strain
Actinomycetospora rhizophila JCM 31765 Type strain
Aeromonas allosaccharophila JCM 8576
Agromyces insulae JCM 31741 Type strain
Algibacter alginolyticus JCM 18496 Type strain
Allosalinactinospora lopnorensis JCM 31766 Type strain
Altererythrobacter aurantiacus JCM 19853 Type strain
Arvibacter flaviflagrans JCM 31293 Type strain
Bacillus sp. JCM 31326
Bacillus sp. JCM 31327
Bacillus sp. JCM 31328
Bacillus sp. JCM 31329
Bacterioplanoides pacificum JCM 30597 Type strain
Blautia hydrogenotrophica JCM 31266
Blautia wexlerae JCM 31267
Brachybacterium aquaticum JCM 30059 Type strain
Brachybacterium horti JCM 31742 Type strain
Chelatococcus reniformis JCM 30308 Type strain
Chromobacterium alkanivorans JCM 30068 Type strain
Chromobacterium rhizoryzae JCM 31180 Type strain
Coprococcus comes JCM 31264
Coprococcus eutactus JCM 31265
Corynebacterium faecale JCM 31743 Type strain
Corynebacterium pelargi JCM 31757 Type strain
Dactylosporangium cerinum JCM 31767 Type strain
Deinococcus persicinus JCM 31312
Deinococcus persicinus JCM 31313 Type strain
Deinococcus seoulensis JCM 31404 Type strain
Desulfotomaculum aquiferis JCM 31386 Type strain
Desulfotomaculum profundi JCM 31387 Type strain
Dorea formicigenerans JCM 31256
Enterobacter tabaci JCM 19646 Type strain
Eubacterium contortum JCM 31258
Eubacterium hallii JCM 31263
Falcatimonas natans JCM 16476 Type strain
Fervidobacterium thailandense JCM 18757 Type strain
Flavihumibacter sediminis JCM 31431 Type strain
"Flavobacterium inkyongense" JCM 31385
Frigoribacterium salinisoli JCM 30848 Type strain
Geodermatophilus taihuensis JCM 31768 Type strain
Glycomyces albus JCM 31744 Type strain
Glycomyces fuscus JCM 31745 Type strain
Hymenobacter sedentarius JCM 19636 Type strain
Idiomarina tyrosinivorans JCM 19757 Type strain
Iodidimonas muriae JCM 17843 Type strain
Isoptericola cucumis JCM 31758 Type strain
Jeotgalibacillus sp. JCM 31330
Kineococcus gypseus JCM 31746 Type strain
Kitasatospora sp. JCM 21731
Kocuria dechangensis JCM 31770 Type strain
Kocuria subflava JCM 31771 Type strain
Labrenzia sp. JCM 31348
Lachnotalea glycerini JCM 30818 Type strain
Leuconostoc mesenteroides JCM 31787
Lysobacter erysipheiresistens JCM 31042 Type strain
Marinitoga arctica JCM 30566 Type strain
"Mariprofundus micogutta" JCM 30585 Proposed type strain
Massilia psychrophila JCM 30813 Type strain
Mesorhizobium sediminum JCM 30310 Type strain
Microbacterium aureliae JCM 30060 Type strain
Microbispora bryophytorum JCM 31772 Type strain
Microbispora camponoti JCM 31773 Type strain
Microlunatus endophyticus JCM 31774 Type strain
Micromonospora ovatispora JCM 31747 Type strain
Micromonospora violae JCM 31776 Type strain
Micromonospora vulcania JCM 31777 Type strain
Micromonospora zhanjiangensis JCM 31748 Type strain
Microvirgula curvata JCM 31223 Type strain
Mobilisporobacter senegalensis JCM 18753 Type strain
Mucilaginibacter puniceus JCM 19495 Type strain
Mycobacterium helvum JCM 30396 Type strain
Mycobacterium sarraceniae JCM 30395 Type strain
Mycobacterium smegmatis JCM 31864
Nakamurella endophytica JCM 31778 Type strain
Nautella sp. JCM 31349
Nautella sp. JCM 31350
Nautella sp. JCM 31351
Nautella sp. JCM 31352
Nocardioides albidus JCM 31749 Type strain
Nocardioides flavus JCM 19770 Type strain
Nocardiopsis nanhaiensis JCM 31823 Type strain
Nocardiopsis oceani JCM 31824 Type strain
Nonomuraea indica JCM 31750 Type strain
Ornithinicoccus halotolerans JCM 31779 Type strain
Paenibacillus oryzae JCM 30486 Type strain
Panacibacter ginsenosidivorans JCM 31452 Type strain
Paracoccus sp. JCM 31353
Paracoccus sp. JCM 31354
Phycicoccus endophyticus JCM 31784 Type strain
Phycicoccus ginsengisoli JCM 31016 Type strain
Piscinibacter defluvii JCM 31230 Type strain
Plantactinospora veratri JCM 31781 Type strain
Polaribacter marinaquae JCM 30825 Type strain
Polygonibacillus indicireducens JCM 30831 Type strain
Pontibacter rugosus JCM 31319 Type strain
Promicromonospora alba JCM 31782 Type strain
Pseudogracilibacillus marinus JCM 31390 Type strain
Pseudonocardia nematodicida JCM 31783 Type strain
Psychrobacter pocilloporae JCM 31058 Type strain
Pullulanibacillus camelliae JCM 31236 Type strain
Raineyella antarctica JCM 30886 Type strain
Rhizobium sp. JCM 31363
Rhizobium sp. JCM 31364
Roseburia faecis JCM 31261
Roseburia intestinalis JCM 31262
Roseomonas rubra JCM 31177 Type strain
Rothia aerolata JCM 31759 Type strain
Ruegeria sp. JCM 31355
Ruegeria sp. JCM 31358
Ruminococcus torques JCM 31259
Saccharibacillus qingshengii JCM 31172 Type strain
"Saccharopolyspora aidingensis" JCM 30185
Serpentinicella alkaliphila JCM 30645 Type strain
Serratia marcescens JCM 8536
Shinella curvata JCM 31239 Type strain
Sinomonas halotolerans JCM 31751 Type strain
Sinomonas susongensis JCM 31752 Type strain
Skermanella rosea JCM 31276 Type strain
Sphingobacterium jejuense JCM 30948 Type strain
Sphingomonas lutea JCM 18309 Type strain
Sphingomonas naphthae JCM 31294 Type strain
Stackebrandtia endophytica JCM 31825 Type strain
Streptococcus dentiloxodontae JCM 19284 Type strain
Streptomonospora flavalba JCM 31753 Type strain
Streptomyces lacrimifluminis JCM 31054 Type strain
Streptomyces tremellae JCM 30846 Type strain
Sulfitobacter faviae JCM 31093 Type strain
Thalassobius litorarius JCM 30758 Type strain
Thalassobius sp. JCM 31360
Unidentified bacterium JCM 31257
Unidentified bacterium JCM 31632
Unidentified bacterium JCM 31633
Varibaculum anthropi JCM 19104 Type strain
Varibaculum anthropi JCM 19105
Virgibacillus oceani JCM 19775 Type strain
Xylella taiwanensis JCM 31187 Type strain
アーキア
Halopiger thermotolerans JCM 19583 Type strain
Haloparvum alkalitolerans JCM 30442 Type strain
Halopiger thermotolerans JCM 19581
Halopiger thermotolerans JCM 19582
Thermococcus sp. JCM 31817
詳細は以下のサイトから検索できますのでご利用ください。
https://jcm.brc.riken.jp/ja/catalogue
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(inquiry.jcm@riken.jp)まで「メールニュース不要」の旨をご連絡ください。
※ 当メールへのご質問などは、微生物材料開発室(inquiry.jcm@riken.jp)
までお送りください。
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そちらをご覧ください。
https://jcm.brc.riken.jp/ja/mailnews
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発行
理化学研究所 バイオリソースセンター
微生物材料開発室 (JCM)
inquiry.jcm@riken.jp
https://jcm.brc.riken.jp/ja/
2017年3月16日
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