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 学名検索1
 属名:
 種名:
    例1: 属名 = Micromonospora
例2: 種名 = aurantiaca
例3: 属名 = %monospo, 種名 = %ensis
(前方一致検索。ワイルドカード「%」を使って中間または後方一致検索も可能。大文字・小文字は区別されません)

 学名検索2
   学名:
    例1: 学名 = Micromonospora chalcea
例2: 学名 = Lactobacillus paracasei subsp. paracasei
(前方一致検索。ワイルドカード「%」を使って中間または後方一致検索も可能。大文字・小文字は区別されません)

 JCM番号検索
   JCM番号:
    例: JCM = 12345 (完全一致検索)

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 機関名略称:
 番号:
    例1: 機関名略称 = DSM, 番号 = 43067
例2: 機関名略称 = VKM, 番号 = Ac-636
(完全一致検索。大文字・小文字は区別されます)

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    例: キーワード = genome sequence
(部分一致検索。大文字・小文字は区別されません)

 培地検索
 JCM培地番号:
 培地名:
    例1: JCM培地番号 = 58
例2: 培地名 = malt extract
(JCM培地番号は完全一致検索、培地名は部分一致検索。大文字・小文字は区別されません)

JCM Mail News No. 96


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RIKEN BioResource Center - Japan Collection of Microorganisms
            JCM Mail News (電子メール版) No. 96
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  理化学研究所 バイオリソースセンター 微生物材料開発室(JCM)
  が公開している微生物等の最新情報をお届けします。

━━━━  目  次  ━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━
 ● 理化学研究所バイオリソースセンター 一般公開のお知らせ
 ● 今月のリソース紹介「マッサリナ亜目 (クロイボタケ綱・プレオスポラ目)
                        の分類学的再検討に用いられた日本産菌株」
 ● 新規公開微生物株(2016年2-3月公開)
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┃  理化学研究所バイオリソースセンター 一般公開のお知らせ
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 理化学研究所バイオリソースセンターの一般公開が行われます。
 当室の坂本光央研究員の講演がございます。
 講演タイトル
   「目に見えないけど大切なパートナー
    -私たちの体の一部である微生物とうまく付き合っていこう!-」
 皆様のご来場をお待ちしております。

  4月22日(金)13:00 - 16:00 および 23日(土)10:00 - 16:00

 詳細は以下のサイトをご覧ください。
 http://rtcweb.rtc.riken.jp/openhouse28/20160404-ippan.pdf

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┃  今月のリソース紹介「マッサリナ亜目 (クロイボタケ綱・プレオスポラ目)
┃                      の分類学的再検討に用いられた日本産菌株」
┗━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━
 田中和明准教授 (弘前大学農学生命科学部) らの日本人研究者が、子嚢菌
クロイボタケ綱 (Dothideomycetes) プレオスポラ目 (Pleosporales) の
マッサリナ亜目 (Massarineae) について、形態・生態・分子系統 
[核リボソームRNA遺伝子 (SSU, LSU)、tef1遺伝子] に基づいた分類学的
再検討を試み、その成果をオランダの著名な雑誌に最近発表しました
(Tanaka et al. 2015)。2新科・10新属・22新種・7新組合せ・2エピタイプ
選定が提案され、同時に菌類バーコードマーカーとしての多数のITS配列が
公開されました。JCMではこれらの株 (以下、一部抜粋) を公開すべく、準備
を進めています。なお、天然基質上の子嚢果・子嚢・子嚢胞子・分生子などの
みごとな写真は下に示すサイトよりご覧ください。

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JCM no.     学名                           備考
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 19429    Aquastroma magniostiolata      新属新種、ex-type
 19427    Aquilomyces rebunensis         新種、ex-type
 19424    Clypeoloculus akitaensis       新属新種、ex-type
 19425    Clypeoloculus hirosakiensis    新種、ex-type
 19426    Clypeoloculus microsporus      新種、ex-type
 19428    Clypeoloculus towadaensis      新種、ex-type
 19404    Dictyosporium digitatum
 19407    Dictyosporium hughesii
 19409    Dictyosporium pseudomusae      新種、ex-type
 19410    Dictyosporium tetrasporum
 19403    Dictyosporium sp.
 13104    Fuscostagonospora sasae        新属新種、ex-type
 19411    Gregarithecium curvisporum     新属新種、ex-type
 19423    Helicascus aquaticus
 17526    Helicascus thalassioideus
 13095    Helminthosporium massarinum    新種、ex-type
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引用文献
Tanaka et al.  2015.  Revision of the Massarineae
 (Pleosporales, Dothideomycetes).  Stud. Mycol. 82: 75–136.
<http://www.sciencedirect.com/science/article/pii/S0166061615000160>

岡田 元 (糸状菌担当)

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┃  新規公開微生物株(2016年2-3月公開)
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細菌
Acidithiobacillus ferriphilus          JCM 30830  Type strain
Actinoplanes lichenis                  JCM 30485  Type strain
Advenella alkanexedens                 JCM 30465  Type strain
Alcaligenes pakistanensis              JCM 30216  Type strain
Algoriella xinjiangensis               JCM 16590  Type strain
Alteromonas naphthalenivorans          JCM 17741  Type strain
Aminobacterium thunnarium              JCM 19320  Type strain
Amphritea spongicola                   JCM 16668  Type strain
Anaerosalibacter bizertensis           JCM 17239  Type strain
"Aneurinibacillus humi"                JCM 19865  Proposed type strain
Arcobacter pacificus                   JCM 17857  Type strain
Athalassotoga saccharophila            JCM 19762  Type strain
Azospirillum soli                      JCM 18820  Type strain
Bacillus ectoiniformans                JCM 30397  Type strain
Bacillus formosensis                   JCM 18448  Type strain
Bacillus malikii                       JCM 30192  Type strain
Bacillus sp.                           JCM 15709
Bacillus stamsii                       JCM 30025  Type strain
"Bergeyella cardium"                   JCM 30115  Proposed type strain
Bifidobacterium hapali                 JCM 30799  Type strain
Bifidobacterium hapali                 JCM 30800
Bifidobacterium myosotis               JCM 30796  Type strain
Bifidobacterium myosotis               JCM 30797
Bifidobacterium tissieri               JCM 30798  Type strain
Bifidobacterium tissieri               JCM 30803
Bordetella muralis                     JCM 30931  Type strain
Bordetella muralis                     JCM 30932
Bordetella muralis                     JCM 30933
Bordetella tumbae                      JCM 30934  Type strain
Bordetella tumulicola                  JCM 30935  Type strain
Bordetella tumulicola                  JCM 30936
Bordetella tumulicola                  JCM 30937
Bordetella tumulicola                  JCM 30938
Bordetella tumulicola                  JCM 30939
Bordetella tumulicola                  JCM 30940
Burkholderia cepacia                   JCM 5509
Burkholderia cepacia                   JCM 5510
Burkholderia cepacia                   JCM 5511
Caulobacter flavus                     JCM 30763  Type strain
Celeribacter manganoxidans             JCM 19384  Type strain
Chryseobacterium echinoideorum         JCM 30470  Type strain
"Clostridium kogasensis"               JCM 18719  Proposed type strain
Clostridium xylanovorans               JCM 31057  Type strain
Comamonas piscis                       JCM 30718  Type strain
Confluentimicrobium naphthalenivorans  JCM 30828  Type strain
Croceitalea litorea                    JCM 19531  Type strain
Deinococcus actinosclerus              JCM 30700  Type strain
Deinococcus actinosclerus              JCM 30701
Deinococcus actinosclerus              JCM 30702
Dissulfurimicrobium hydrothermale      JCM 19990  Type strain
Duganella ginsengisoli                 JCM 30745  Type strain
Filobacterium rodentium                JCM 19453  Type strain
Flavisolibacter ginsenosidimutans      JCM 18197  Type strain
"Flavisolibacter swuensis"             JCM 19974  Proposed type strain
Flavitalea soli                        JCM 19937  Type strain
Flavobacterium buctense                JCM 30750  Type strain
Flavobacterium seoulense               JCM 30145  Type strain
Flexilinea flocculi                    JCM 30897  Type strain
Fusibacter bizertensis                 JCM 19376  Type strain
Halocynthiibacter arcticus             JCM 30530  Type strain
Halomonas garicola                     JCM 30151  Type strain
Humibacter ginsengisoli                JCM 30080  Type strain
Humibacter ginsengiterrae              JCM 30079  Type strain
Hymenobacter mucosus                   JCM 19647  Type strain
Hyunsoonleella udonensis               JCM 30600  Type strain
Inquilinus ginsengisoli                JCM 14825  Type strain
Kushneria aurantia                     JCM 15469  Type strain
Kushneria indalinina                   JCM 19369  Type strain
Labrys soli                            JCM 19895  Type strain
Luteimonas notoginsengisoli            JCM 30329  Type strain
Luteimonas pelagia                     JCM 18792  Type strain
Lysobacter hankyongensis               JCM 18204  Type strain
Lysobacter sediminicola                JCM 18205  Type strain
"Lysobacter tyrosinelyticus"           JCM 30320  Proposed type strain
Mariniluteicoccus endophyticus         JCM 30097  Type strain
Mariniluteicoccus endophyticus         JCM 30098
Methyloterrigena soli                  JCM 30821  Type strain
Niveibacterium umoris                  JCM 18716  Type strain
Novosphingobium oryzae                 JCM 30537  Type strain
"Paenibacillus ginsengiterrae"         JCM 19887  Proposed type strain
Paenibacillus medicaginis              JCM 18446  Type strain
Paracoccus laeviglucosivorans          JCM 30587  Type strain
"Paralcaligenes ginsengisoli"          JCM 30746  Proposed type strain
"Phaeobacter marinintestinus"          JCM 19926  Proposed type strain
Phaeobacterium nitratireducens         JCM 19219  Type strain
Polymorphobacter fuscus                JCM 19740  Type strain
Pseudoclavibacter terrae               JCM 30298  Type strain
Pseudofulvibacter gastropodicola       JCM 30369  Type strain
Pseudomonas aeruginosa                 JCM 5517
Pseudooceanicola antarcticus           JCM 19802  Type strain
"Pseudooceanicola flagellatus"         JCM 19803  Proposed type strain
Psychroflexus planctonicus             JCM 30616  Type strain
Psychroflexus salis                    JCM 30615  Type strain
Rhabdobacter roseus                    JCM 30685  Type strain
Rhizobium marinum                      JCM 30155  Type strain
Rhodanobacter aciditrophus             JCM 30774  Type strain
Roseomonas wooponensis                 JCM 19527  Type strain
Saccharothrix stipae                   JCM 30560  Type strain
Simplicispira piscis                   JCM 19291  Type strain
Sphingobacterium mucilaginosum         JCM 30424  Type strain
Sphingobium barthaii                   JCM 30309  Type strain
"Sphingosinicella ginsenosidimutans"   JCM 18201  Proposed type strain
Spirosoma fluviale                     JCM 30659  Type strain
Sporohalobacter salinus                JCM 19279  Type strain
Staphylococcus lentus                  JCM 2426   Type strain
Streptomyces actinomycinicus           JCM 30864  Type strain
"Streptomyces siamensis"               JCM 18409  Proposed type strain
"Streptomyces similanensis"            JCM 18410  Proposed type strain
Streptomyces sp.                       JCM 30950
Thalassocola ureilytica                JCM 30682  Type strain
Thermanaeromonas burensis              JCM 18718  Type strain
Thermostilla marina                    JCM 19992  Type strain
Tsukamurella hongkongensis             JCM 30715  Type strain
Tsukamurella hongkongensis             JCM 30716
Tsukamurella sinensis                  JCM 30714  Type strain
Undibacterium aquatile                 JCM 30323  Type strain
Xanthomarina gelatinilytica            JCM 18821  Type strain

アーキア
Acidianus sp.                          JCM 30227
Cuniculiplasma divulgatum              JCM 30641
Cuniculiplasma divulgatum              JCM 30642  Type strain
Haloarcula sp.                         JCM 30477
"Haloparvum sedimenti"                 JCM 30891
"Haloparvum sedimenti"                 JCM 30892
Halorubrum yunnanense                  JCM 30666
Methanolobus chelungpuianus            JCM 15159  Type strain

真菌
Aspergillus nidulans                   JCM 19075
Cunninghamella echinulata              JCM 22488
Cunninghamella elegans                 JCM 22489
Lyophyllum decastes                    JCM 30590
Lyophyllum shimeji                     JCM 30591
Mucor circinelloides                   JCM 22475
Mucor circinelloides                   JCM 22476
Mucor circinelloides                   JCM 22477
Mucor circinelloides                   JCM 22478
Mucor circinelloides                   JCM 22479
Mucor circinelloides                   JCM 22480
Mucor circinelloides                   JCM 22483
Mucor circinelloides                   JCM 22484
Mucor mucedo                           JCM 23020
Mucor racemosus f. racemosus           JCM 22481
Muscodor oryzae                        JCM 18231  ex-holotype
Pilasporangium apinafurcum             JCM 30513  ex-holotype
Pilasporangium apinafurcum             JCM 30514
Rhodosporidium toruloides              JCM 24501
Rhodotorula slooffiae                  JCM 10954  Type strain
Schizophyllum commune                  JCM 22674
Syncephalastrum racemosum              JCM 22491
Yarrowia sp.                           JCM 30694
Yarrowia sp.                           JCM 30695
Yarrowia sp.                           JCM 30696

詳細は以下のサイトから検索できますのでご利用ください。
http://jcm.brc.riken.jp/ja/catalogue

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発行
理化学研究所 バイオリソースセンター
微生物材料開発室 (JCM)
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2016年4月20日
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